Title :

Quantitative measurement of antibiotic resistance in Mycobacterium tuberculosis reveals genetic determinants of resistance and susceptibility in a target gene approach

Author(s) :

Barilar, Ivan [Auteur]
Battaglia, Simone [Auteur]
Borroni, Emanuele [Auteur]
Brandao, Angela Pires [Auteur]
Brankin, Alice [Auteur]
Cabibbe, Andrea Maurizio [Auteur]
Carter, Joshua [Auteur]
Chetty, Darren [Auteur]
Cirillo, Daniela Maria [Auteur]
Claxton, Pauline [Auteur]
Clifton, David [Auteur]
Cohen, Ted [Auteur]
Coronel, Jorge [Auteur]
Crook, Derrick [Auteur]
Dreyer, Viola [Auteur]
Earle, Sarah [Auteur]
Escuyer, Vincent [Auteur]
Ferrazoli, Lucilaine [Auteur]
Fowler, Philip [Auteur]
Gao, George Fu [Auteur]
Gardy, Jennifer [Auteur]
Gharbia, Saheer [Auteur]
Ghisi, Kelen Teixeira [Auteur]
Ghodousi, Arash [Auteur]
Gibertoni Cruz, Ana Luíza [Auteur]
Grandjean, Louis [Auteur]
Grazian, Clara [Auteur]
Groenheit, Ramona [Auteur]
Guthrie, Jennifer [Auteur]
He, Wencong [Auteur]
Hoffmann, Harald [Auteur]
Hoosdally, Sarah [Auteur]
Hunt, Martin [Auteur]
Iqbal, Zamin [Auteur]
Ismail, Nazir Ahmed [Auteur]
Jarrett, Lisa [Auteur]
Joseph, Lavania [Auteur]
Jou, Ruwen [Auteur]
Kambli, Priti [Auteur]
Khot, Rukhsar [Auteur]
Knaggs, Jeff [Auteur]
Koch, Anastasia [Auteur]
Kohlerschmidt, Donna [Auteur]
Kouchaki, Samaneh [Auteur]
Lachapelle, Alexander [Auteur]
Lalvani, Ajit [Auteur]
Lapierre, Simon Grandjean [Auteur]
Laurenson, Ian [Auteur]
Letcher, Brice [Auteur]
Lin, Wan-Hsuan [Auteur]
Liu, Chunfa [Auteur]
Liu, Dongxin [Auteur]
Malone, Kerri [Auteur]
Mandal, Ayan [Auteur]
Mansjö, Mikael [Auteur]
Calisto Matias, Daniela Vicente Lucena [Auteur]
Meintjes, Graeme [Auteur]
de Freitas Mendes, Flávia [Auteur]
Merker, Matthias [Auteur]
Mihalic, Marina [Auteur]
Millard, James [Auteur]
Miotto, Paolo [Auteur]
Mistry, Nerges [Auteur]
Moore, David [Auteur]
Musser, Kimberlee [Auteur]
Ngcamu, Dumisani [Auteur]
Nhung, Hoang Ngoc [Auteur]
Niemann, Stefan [Auteur]
Nilgiriwala, Kayzad Soli [Auteur]
Nimmo, Camus [Auteur]
O’donnell, Max [Auteur]
Okozi, Nana [Auteur]
Oliveira, Rosangela Siqueira [Auteur]
Omar, Shaheed Vally [Auteur]
Paton, Nicholas [Auteur]
Peto, Timothy [Auteur]
Pinhata, Juliana Maira Watanabe [Auteur]
Plesnik, Sara [Auteur]
Puyen, Zully [Auteur]
Rabodoarivelo, Marie Sylvianne [Auteur]
Rakotosamimanana, Niaina [Auteur]
Rancoita, Paola [Auteur]
Rathod, Priti [Auteur]
Robinson, Esther Rhiannon [Auteur]
Rodger, Gillian [Auteur]
Rodrigues, Camilla [Auteur]
Rodwell, Timothy [Auteur]
Roohi, Aysha [Auteur]
Santos-Lazaro, David [Auteur]
Shah, Sanchi [Auteur]
Smith, Grace [Auteur]
Kohl, Thomas Andreas [Auteur]
Solano, Walter [Auteur]
Spitaleri, Andrea [Auteur]
Steyn, Adrie [Auteur]
Supply, Philip [Auteur]
Centre d’Infection et d’Immunité de Lille - INSERM U 1019 - UMR 9017 - UMR 8204 [CIIL]
Surve, Utkarsha [Auteur]
Tahseen, Sabira [Auteur]
Thuong, Nguyen Thuy Thuong [Auteur]
Thwaites, Guy [Auteur]
Todt, Katharina [Auteur]
Trovato, Alberto [Auteur]
Utpatel, Christian [Auteur]
van Rie, Annelies [Auteur]
Vijay, Srinivasan [Auteur]
Walker, A. Sarah [Auteur]
Walker, Timothy [Auteur]
Warren, Robin [Auteur]
Werngren, Jim [Auteur]
Wijkander, Maria [Auteur]
Wilkinson, Robert [Auteur]
Wilson, Daniel [Auteur]
Wintringer, Penelope [Auteur]
Xiao, Yu-Xin [Auteur]
Yang, Yang [Auteur]
Yanlin, Zhao [Auteur]
Yao, Shen-Yuan [Auteur]
Zhu, Baoli [Auteur]

Journal title :

Nature Communications

Pages :

488

Publisher :

Nature Publishing Group

Publication date :

2024

ISSN :

2041-1723

HAL domain(s) :

Sciences du Vivant [q-bio]/Microbiologie et Parasitologie/Bactériologie
Sciences du Vivant [q-bio]/Biochimie, Biologie Moléculaire/Génomique, Transcriptomique et Protéomique [q-bio.GN]
Sciences du Vivant [q-bio]/Sciences pharmaceutiques/Pharmacologie

English abstract : [en]

The World Health Organization has a goal of universal drug susceptibility testing for patients with tuberculosis. However, molecular diagnostics to date have focused largely on first-line drugs and predicting susceptibilities ...
Show more >The World Health Organization has a goal of universal drug susceptibility testing for patients with tuberculosis. However, molecular diagnostics to date have focused largely on first-line drugs and predicting susceptibilities in a binary manner (classifying strains as either susceptible or resistant). Here, we used a multivariable linear mixed model alongside whole genome sequencing and a quantitative microtiter plate assay to relate genomic mutations to minimum inhibitory concentration (MIC) in 15,211 Mycobacterium tuberculosis clinical isolates from 23 countries across five continents. We identified 492 unique MIC-elevating variants across 13 drugs, as well as 91 mutations likely linked to hypersensitivity. Our results advance genetics-based diagnostics for tuberculosis and serve as a curated training/testing dataset for development of drug resistance prediction algorithms.Show less >

Language :

Anglais

Peer reviewed article :

Oui

Audience :

Internationale

Popular science :

Non

Collections :

• Centre d'Infection et d'Immunité de Lille (CIIL) - U1019 - UMR 9017

Source :

Harvested from HAL