Paléoprotéomique appliquée au site de Waziers, le « Bas‑Terroir » (Nord)

Abstract

Les anciennes molécules conservées dans les ossements fossiles offrent l'opportunité d'acquérir une meilleure connaissance du passé biologique. Ces dernières années, la protéomique appliquée aux échantillons osseux et dentaires est devenue une méthode intéressante pour étudier les espèces éteintes et l'évolution phylogénétique comme alternative à l'analyse de l'ADN qui est limitée par l'amplification de l'ADN présent dans les échantillons anciens et sa contamination. Pour endommager le moins possible les échantillons, il est primordial de prélever une faible quantité de matière. Pour certains échantillons fossiles qui peuvent être très précieux car uniques (restes humains, taxons très rares), ces prélèvements sont problématiques. Une autre difficulté est l'absence de données génomiques pour la plupart des espèces éteintes. Dans cette étude, une méthodologie de protéomique a été appliquée à des os de mammifères âgés d'environ 130 000 à 120 000 ans provenant du site pléistocène de Waziers (Nord, France). La présence d'artefacts lithiques et les traces de boucherie observées sur des ossements indiquent la présence de l'Homme de Neandertal sur ce site. À partir d'échantillons de cinq milligrammes, nos résultats montrent une grande majorité de peptides détectés correspondant aux protéines de collagène I alpha 1 et alpha 2 avec une couverture de séquence jusqu'à 60 %. En utilisant l'homologie avec des séquences modernes, une classification biologique a été réalisée avec succès et les rangs taxonomiques associés à chaque os ont été identifiés de manière cohérente avec les informations obtenues à partir d'études ostéomorphologiques et de données paléoenvironnementales et paléodiététiques Mots-clés : paléoprotéomique, Pléistocène, Waziers, ossements de mammifères, taxonomie, modifications post traductionnelles.