Automated optical approaches for in vivo ...
Document type :
Autre communication scientifique (congrès sans actes - poster - séminaire...): Communication dans un congrès avec actes
Title :
Automated optical approaches for in vivo multiscale monitoring of phytoplankton communities and HABs in the English Channel and North Sea
Author(s) :
Artigas, Luis Felipe [Auteur]
Laboratoire d’Océanologie et de Géosciences (LOG) - UMR 8187 [LOG]
Université du Littoral Côte d'Opale [ULCO]
Hubert, Zéline [Auteur]
Laboratoire d’Océanologie et de Géosciences (LOG) - UMR 8187 [LOG]
Université du Littoral Côte d'Opale [ULCO]
Louchart, Arnaud [Auteur]
Netherlands Institute of Ecology [NIOO-KNAW]
Université du Littoral Côte d'Opale [ULCO]
Laboratoire d’Océanologie et de Géosciences (LOG) - UMR 8187 [LOG]
Centre National de la Recherche Scientifique [CNRS]
Créach, Véronique [Auteur]
Centre for Environment, Fisheries and Aquaculture Science [Lowestoft] [CEFAS]
Lefebvre, Alain [Auteur]
Laboratoire Environnement Ressources de Boulogne-sur-Mer [LERBL]
Wacquet, Guillaume [Auteur]
Laboratoire Environnement Ressources de Boulogne-sur-Mer [LERBL]
Caillault, Emilie Poisson [Auteur]
Laboratoire d'Informatique Signal et Image de la Côte d'Opale [LISIC]
Université du Littoral Côte d'Opale [ULCO]
Deneudt, Klaas [Auteur]
Flanders Marine Institute [VLIZ]
Möller, Klas Owe [Auteur]
Helmholtz-Zentrum Geesthacht [GKSS]
Rikeboer, Machteld [Auteur]
Claquin, Pascal [Auteur]
Biologie des Organismes et Ecosystèmes Aquatiques [BOREA]
Université de Caen Normandie [UNICAEN]
Gallot, Clémentine [Auteur]
Université du Littoral Côte d'Opale [ULCO]
Laboratoire d’Océanologie et de Géosciences (LOG) - UMR 8187 [LOG]
Centre National de la Recherche Scientifique [CNRS]
Institut méditerranéen d'océanologie [MIO]
Robache, Kévin [Auteur]
Université du Littoral Côte d'Opale [ULCO]
Laboratoire d’Océanologie et de Géosciences (LOG) - UMR 8187 [LOG]
Verghaeghe, Florine [Auteur]
Université du Littoral Côte d'Opale [ULCO]
Laboratoire d’Océanologie et de Géosciences (LOG) - UMR 8187 [LOG]
Jeabert, Lisa [Auteur]
Université du Littoral Côte d'Opale [ULCO]
Laboratoire d’Océanologie et de Géosciences (LOG) - UMR 8187 [LOG]
Lanoy, Lucinda [Auteur]
Université du Littoral Côte d'Opale [ULCO]
Laboratoire d’Océanologie et de Géosciences (LOG) - UMR 8187 [LOG]
Dédécker, Claire [Auteur]
Université du Littoral Côte d'Opale [ULCO]
Laboratoire d’Océanologie et de Géosciences (LOG) - UMR 8187 [LOG]
Epinoux, Alexandre [Auteur]
Université du Littoral Côte d'Opale [ULCO]
Laboratoire d’Océanologie et de Géosciences (LOG) - UMR 8187 [LOG]
Centre National de la Recherche Scientifique [CNRS]
Blackwell, Robert [Auteur]
Centre for Environment, Fisheries and Aquaculture Science [Lowestoft] [CEFAS]
Ghosn, Raed Halawi [Auteur]
Laboratoire Environnement Ressources de Boulogne-sur-Mer [LERBL]
Facq, Jean-Valéry [Auteur]
Unité Recherches et Développements Technologiques [RDT]
Répécaud, Michel [Auteur]
Unité Recherches et Développements Technologiques [RDT]
Hébert, Pierre-Alexandre [Auteur]
Laboratoire d'Informatique Signal et Image de la Côte d'Opale [LISIC]
Université du Littoral Côte d'Opale [ULCO]
Aubert, Anais [Auteur]
Flanders Marine Institute [VLIZ]
Lagaisse, Rune [Auteur]
Flanders Marine Institute [VLIZ]
Moltermans, Jonas [Auteur]
Flanders Marine Institute [VLIZ]
Rombouts, Isabelle [Auteur]
Flanders Marine Institute [VLIZ]
Macovei, Vlad [Auteur]
Helmholtz-Zentrum Geesthacht [GKSS]
Rhül, Saskia [Auteur]
Helmholtz-Zentrum Geesthacht [GKSS]
Voynova, Yoana G. [Auteur]
Helmholtz-Zentrum Geesthacht [GKSS]
Veen, Arnold [Auteur]
Laboratoire d’Océanologie et de Géosciences (LOG) - UMR 8187 [LOG]
Université du Littoral Côte d'Opale [ULCO]
Hubert, Zéline [Auteur]
Laboratoire d’Océanologie et de Géosciences (LOG) - UMR 8187 [LOG]
Université du Littoral Côte d'Opale [ULCO]
Louchart, Arnaud [Auteur]
Netherlands Institute of Ecology [NIOO-KNAW]
Université du Littoral Côte d'Opale [ULCO]
Laboratoire d’Océanologie et de Géosciences (LOG) - UMR 8187 [LOG]
Centre National de la Recherche Scientifique [CNRS]
Créach, Véronique [Auteur]
Centre for Environment, Fisheries and Aquaculture Science [Lowestoft] [CEFAS]
Lefebvre, Alain [Auteur]
Laboratoire Environnement Ressources de Boulogne-sur-Mer [LERBL]
Wacquet, Guillaume [Auteur]
Laboratoire Environnement Ressources de Boulogne-sur-Mer [LERBL]
Caillault, Emilie Poisson [Auteur]
Laboratoire d'Informatique Signal et Image de la Côte d'Opale [LISIC]
Université du Littoral Côte d'Opale [ULCO]
Deneudt, Klaas [Auteur]
Flanders Marine Institute [VLIZ]
Möller, Klas Owe [Auteur]
Helmholtz-Zentrum Geesthacht [GKSS]
Rikeboer, Machteld [Auteur]
Claquin, Pascal [Auteur]
Biologie des Organismes et Ecosystèmes Aquatiques [BOREA]
Université de Caen Normandie [UNICAEN]
Gallot, Clémentine [Auteur]
Université du Littoral Côte d'Opale [ULCO]
Laboratoire d’Océanologie et de Géosciences (LOG) - UMR 8187 [LOG]
Centre National de la Recherche Scientifique [CNRS]
Institut méditerranéen d'océanologie [MIO]
Robache, Kévin [Auteur]
Université du Littoral Côte d'Opale [ULCO]
Laboratoire d’Océanologie et de Géosciences (LOG) - UMR 8187 [LOG]
Verghaeghe, Florine [Auteur]
Université du Littoral Côte d'Opale [ULCO]
Laboratoire d’Océanologie et de Géosciences (LOG) - UMR 8187 [LOG]
Jeabert, Lisa [Auteur]
Université du Littoral Côte d'Opale [ULCO]
Laboratoire d’Océanologie et de Géosciences (LOG) - UMR 8187 [LOG]
Lanoy, Lucinda [Auteur]
Université du Littoral Côte d'Opale [ULCO]
Laboratoire d’Océanologie et de Géosciences (LOG) - UMR 8187 [LOG]
Dédécker, Claire [Auteur]
Université du Littoral Côte d'Opale [ULCO]
Laboratoire d’Océanologie et de Géosciences (LOG) - UMR 8187 [LOG]
Epinoux, Alexandre [Auteur]
Université du Littoral Côte d'Opale [ULCO]
Laboratoire d’Océanologie et de Géosciences (LOG) - UMR 8187 [LOG]
Centre National de la Recherche Scientifique [CNRS]
Blackwell, Robert [Auteur]
Centre for Environment, Fisheries and Aquaculture Science [Lowestoft] [CEFAS]
Ghosn, Raed Halawi [Auteur]
Laboratoire Environnement Ressources de Boulogne-sur-Mer [LERBL]
Facq, Jean-Valéry [Auteur]
Unité Recherches et Développements Technologiques [RDT]
Répécaud, Michel [Auteur]
Unité Recherches et Développements Technologiques [RDT]
Hébert, Pierre-Alexandre [Auteur]
Laboratoire d'Informatique Signal et Image de la Côte d'Opale [LISIC]
Université du Littoral Côte d'Opale [ULCO]
Aubert, Anais [Auteur]
Flanders Marine Institute [VLIZ]
Lagaisse, Rune [Auteur]
Flanders Marine Institute [VLIZ]
Moltermans, Jonas [Auteur]
Flanders Marine Institute [VLIZ]
Rombouts, Isabelle [Auteur]
Flanders Marine Institute [VLIZ]
Macovei, Vlad [Auteur]
Helmholtz-Zentrum Geesthacht [GKSS]
Rhül, Saskia [Auteur]
Helmholtz-Zentrum Geesthacht [GKSS]
Voynova, Yoana G. [Auteur]
Helmholtz-Zentrum Geesthacht [GKSS]
Veen, Arnold [Auteur]
Conference title :
International Conference on Harmful Algae - ICHA 2023
Conference organizers(s) :
International Society for the Study of Hamrful Algae
City :
Hiroshima
Country :
Japon
Start date of the conference :
2023-11-05
English keyword(s) :
Automated optical observations
Phytoplankton monitoring
Harmful Algal Blooms
North Sea and English Channel
Pilot Super Site
Phytoplankton monitoring
Harmful Algal Blooms
North Sea and English Channel
Pilot Super Site
HAL domain(s) :
Sciences du Vivant [q-bio]
English abstract : [en]
Automated optical observations of phytoplankton communities are currently implemented in eastern English Channel and southern North Sea on different platforms (fixed autonomous stations, moorings, dedicated cruises and ...
Show more >Automated optical observations of phytoplankton communities are currently implemented in eastern English Channel and southern North Sea on different platforms (fixed autonomous stations, moorings, dedicated cruises and measurements/ships of opportunity) as a complement of long term monitoring networks in the. These marginal seas are characterized by significant connectivity to adjacent ocean and seas, strong hydrodynamics and low to high riverine inputs, influencing biogeochemical and biological processes like high productivity and recurring phytoplankton blooms, including some Harmful Algal Blooms-HABs of potential impact on marine food webs, as well as on human health and economy. Integrated phytoplankton observations are carried out combining reference methods with innovative automated in vivo imaging inflow/in situ/benchtop devices, pulse shape-recording flow cytometers, as well as in vivo multispectral fluorometers. These measurements provide information on the distribution and dynamics of phytoplankton functional groups (flow cytometry) and main taxa (imaging) at high spatial and temporal resolution assigning community changes to different bloom situations and pelagic habitats state, complementing physical, biogeochemical and biological variables. The in vivo approaches allow tracking HABs at different spatial and temporal scales, through the harmonisation of observations (including near-real time in vivo automated approaches implemented for almost a decade), at almost real time, and become a helpful tool for managers of these events. Finally, harmonisation in data pipelines conform to the FAIR principle and synthesis based on conventional statistics as well as on IA/ML approaches makes it possible to address scientific, societal and economic challenges through a new perspective, facing global and local changes.Show less >
Show more >Automated optical observations of phytoplankton communities are currently implemented in eastern English Channel and southern North Sea on different platforms (fixed autonomous stations, moorings, dedicated cruises and measurements/ships of opportunity) as a complement of long term monitoring networks in the. These marginal seas are characterized by significant connectivity to adjacent ocean and seas, strong hydrodynamics and low to high riverine inputs, influencing biogeochemical and biological processes like high productivity and recurring phytoplankton blooms, including some Harmful Algal Blooms-HABs of potential impact on marine food webs, as well as on human health and economy. Integrated phytoplankton observations are carried out combining reference methods with innovative automated in vivo imaging inflow/in situ/benchtop devices, pulse shape-recording flow cytometers, as well as in vivo multispectral fluorometers. These measurements provide information on the distribution and dynamics of phytoplankton functional groups (flow cytometry) and main taxa (imaging) at high spatial and temporal resolution assigning community changes to different bloom situations and pelagic habitats state, complementing physical, biogeochemical and biological variables. The in vivo approaches allow tracking HABs at different spatial and temporal scales, through the harmonisation of observations (including near-real time in vivo automated approaches implemented for almost a decade), at almost real time, and become a helpful tool for managers of these events. Finally, harmonisation in data pipelines conform to the FAIR principle and synthesis based on conventional statistics as well as on IA/ML approaches makes it possible to address scientific, societal and economic challenges through a new perspective, facing global and local changes.Show less >
Language :
Anglais
Peer reviewed article :
Oui
Audience :
Internationale
Popular science :
Non
ANR Project :
Source :