Title :

Common genetic variation in alcohol-related hepatocellular carcinoma: a case-control genome-wide association study

Author(s) :

Trépo, Eric [Auteur]
Centre de Recherche des Cordeliers [CRC (UMR_S_1138 / U1138)]
Faculté de Médecine [Bruxelles] [ULB]
Caruso, Stefano [Auteur]
Centre de Recherche des Cordeliers [CRC (UMR_S_1138 / U1138)]
Yang, Jie [Auteur]
Centre de Recherche des Cordeliers [CRC (UMR_S_1138 / U1138)]
Imbeaud, Sandrine [Auteur]
Centre de Recherche des Cordeliers [CRC (UMR_S_1138 / U1138)]
Couchy, Gabrielle [Auteur]
Centre de Recherche des Cordeliers [CRC (UMR_S_1138 / U1138)]
Bayard, Quentin [Auteur]
Centre de Recherche des Cordeliers [CRC (UMR_S_1138 / U1138)]
Letouzé, Eric [Auteur]
Centre de Recherche des Cordeliers [CRC (UMR_S_1138 / U1138)]
Ganne-Carrié, Nathalie [Auteur]
Hôpital Avicenne [AP-HP]
Centre de Recherche des Cordeliers [CRC (UMR_S_1138 / U1138)]
Moreno, Christophe [Auteur]
Oussalah, Abderrahim [Auteur]
Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale [INSERM]
Biochimie – Biologie moléculaire et Nutrition [CHRU Nancy]
Féray, Cyrille [Auteur]
Centre Hépato-Biliaire [Hôpital Paul Brousse] [CHB]
Blanc, Jean Frédéric [Auteur]
Bordeaux Research In Translational Oncology [Bordeaux] [BaRITOn]
Clément, Bruno [Auteur]
Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] [LNC]
Hillon, Patrick [Auteur]
Lipides - Nutrition - Cancer [Dijon - U1231] [LNC]
Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand [CHU Dijon]
Boursier, Jérôme [Auteur]
Hémodynamique, Interaction Fibrose et Invasivité tumorales Hépatiques [HIFIH]
Centre Hospitalier Universitaire d'Angers [CHU Angers]
Paradis, Valérie [Auteur]
Hôpital Beaujon [AP-HP]
Calderaro, Julien [Auteur]
Institut Mondor de Recherche Biomédicale [IMRB]
Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 [UPEC UP12]
Hôpital Henri Mondor
Gnemmi, Viviane [Auteur]
Cancer Heterogeneity, Plasticity and Resistance to Therapies - UMR 9020 - U 1277 [CANTHER]
Nault, Jean-Charles [Auteur]
Université Sorbonne Paris Nord
Hôpital Avicenne [AP-HP]
Centre de Recherche des Cordeliers [CRC (UMR_S_1138 / U1138)]
Guéant, Jean-Louis [Auteur]
Nutrition-Génétique et Exposition aux Risques Environnementaux [NGERE]
Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy [CHRU Nancy]
Devière, Jacques [Auteur]
Archambeaud, Isabelle [Auteur]
Hôtel-Dieu de Nantes
Vitellius, Carole [Auteur]
Hémodynamique, Interaction Fibrose et Invasivité tumorales Hépatiques [HIFIH]
Centre Hospitalier Universitaire d'Angers [CHU Angers]
Turlin, Bruno [Auteur]
Nutrition, Métabolismes et Cancer [NuMeCan]
Bronowicki, Jean-Pierre [Auteur]
Nutrition-Génétique et Exposition aux Risques Environnementaux [NGERE]
Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy [CHRU Nancy]
Gustot, Thierry [Auteur]
Sutton, Angela [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Hôpital Avicenne [AP-HP]
Ziol, Marianne [Auteur]
Hôpital Avicenne [AP-HP]
Centre de Recherche des Cordeliers [CRC (UMR_S_1138 / U1138)]
Nahon, Pierre [Auteur]
Hôpital Avicenne [AP-HP]
Centre de Recherche des Cordeliers [CRC (UMR_S_1138 / U1138)]
Zucman-Rossi, Jessica [Auteur]
Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] [HEGP]
Centre de Recherche des Cordeliers [CRC (UMR_S_1138 / U1138)]
Meiller, Clément [Auteur]
Centre de Recherche des Cordeliers [CRC (UMR_S_1138 / U1138)]
Cao, Qian [Auteur]
Centre de Recherche des Cordeliers [CRC (UMR_S_1138 / U1138)]
Hirsch, Théo [Auteur]
Centre de Recherche des Cordeliers [CRC (UMR_S_1138 / U1138)]
Rebouissou, Sandra [Auteur]
Centre de Recherche des Cordeliers [CRC (UMR_S_1138 / U1138)]
Degré, Delphine [Auteur]
Otero Sanchez, Lukas [Auteur]
Rosewick, Nicolas [Auteur]
Quertinmont, Eric [Auteur]
Desille-Dugast, Mireille [Auteur]
Nutrition, Métabolismes et Cancer [NuMeCan]
François-Vié, Muriel [Auteur]
Nutrition, Métabolismes et Cancer [NuMeCan]
Moins, Cécile [Auteur]
Nutrition, Métabolismes et Cancer [NuMeCan]
Leteurtre, Emmanuelle [Auteur]
Cancer Heterogeneity, Plasticity and Resistance to Therapies - UMR 9020 - U 1277 [CANTHER]
Lassailly, Guillaume [Auteur]

Ningarhari, Massih [Auteur]
Centre de Recherche des Cordeliers [CRC (UMR_S_1138 / U1138)]
Boleslawski, Emmanuel [Auteur]
Thérapies Laser Assistées par l'Image pour l'Oncologie - U 1189 [ONCO-THAI]
Cottet, Vanessa [Auteur]
Equipe EPICAD (LNC - U1231)

Journal title :

Lancet Oncology

Pages :

161-171

Publisher :

Elsevier

Publication date :

2021

ISSN :

1470-2045

HAL domain(s) :

Sciences du Vivant [q-bio]/Cancer
Sciences du Vivant [q-bio]/Médecine humaine et pathologie/Hépatologie et Gastroentérologie
Sciences du Vivant [q-bio]/Génétique/Génétique humaine
Sciences du Vivant [q-bio]/Génétique/Génétique des populations [q-bio.PE]
Sciences du Vivant [q-bio]/Santé publique et épidémiologie

English abstract : [en]

Background: Hepatocellular carcinoma is a frequent consequence of alcohol-related liver disease, with variable incidence among heavy drinkers. We did a genome-wide association study (GWAS) to identify common genetic variants ...
Show more >Background: Hepatocellular carcinoma is a frequent consequence of alcohol-related liver disease, with variable incidence among heavy drinkers. We did a genome-wide association study (GWAS) to identify common genetic variants for alcohol-related hepatocellular carcinoma.Methods: We conducted a two-stage case-control GWAS in a discovery cohort of 2107 unrelated European patients with alcohol-related liver disease aged 20–92 years recruited between Oct 22, 1993, and March 12, 2017. Cases were patients with alcohol-related hepatocellular carcinoma diagnosed by imaging or histology. Controls were patients with alcohol-related liver disease without hepatocellular carcinoma. We used an additive logistic regression model adjusted for the first ten principal components to assess genetic variants associated with alcohol-related hepatocellular carcinoma. We did another analysis with adjustment for age, sex, and liver fibrosis. New candidate associations (p<1 × 10−6) and variants previously associated with alcohol-related hepatocellular carcinoma were evaluated in a validation cohort of 1933 patients with alcohol-related liver disease aged 29–92 years recruited between July 21, 1995, and May 2, 2019. We did a meta-analysis of the two case–control cohorts.Findings: The discovery cohort included 775 cases and 1332 controls. Of 7 962 325 variants assessed, we identified WNT3A-WNT9A (rs708113; p=1·11 × 10−8) and found support for previously reported regions associated with alcohol-related hepatocellular carcinoma risk at TM6SF2 (rs58542926; p=6·02 × 10−10), PNPLA3 (rs738409; p=9·29 × 10−7), and HSD17B13 (rs72613567; p=2·49 × 10−4). The validation cohort included 874 cases and 1059 controls and three variants were replicated: WNT3A-WNT9A (rs708113; p=1·17 × 10−3), TM6SF2 (rs58542926; p=4·06 × 10−5), and PNPLA3 (rs738409; p=1·17 × 10−4). All three variants reached GWAS significance in the meta-analysis: WNT3A-WNT9A (odds ratio 0·73, 95% CI 0·66–0·81; p=3·93 × 10−10), TM6SF2 (1·77, 1·52–2·07; p=3·84×10−13), PNPLA3 (1·34, 1·22–1·47; p=7·30 × 10−10). Adjustment for clinical covariates yielded similar results. We observed an additive effect of at-risk alleles on alcohol-related hepatocellular carcinoma. WNT3A-WNT9A rs708113 was not associated with liver fibrosis.Interpretation: WNT3A-WNT9A is a susceptibility locus for alcohol-related hepatocellular carcinoma, suggesting an early role of the Wnt–β-catenin pathway in alcohol-related hepatocellular carcinoma carcinogenesis.Show less >

Language :

Anglais

Peer reviewed article :

Oui

Audience :

Internationale

Popular science :

Non

Collections :

• Thérapies Lasers Assistées par l'Image pour l'Oncologie (ONCO-THAI) - U1189

Source :

Harvested from HAL

Submission date :

2022-10-02T19:25:00Z