Whole Exome/Genome Sequencing Joint Analysis ...
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Article dans une revue scientifique: Article original
DOI :
PMID :
Titre :
Whole Exome/Genome Sequencing Joint Analysis of a Family with Oligogenic Familial Hypercholesterolemia
Auteur(s) :
Ghaleb, Youmna [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Université Saint-Joseph de Beyrouth [USJ]
Elbitar, Sandy [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Université Saint-Joseph de Beyrouth [USJ]
Philippi, Anne [Auteur]
Institut Cochin [IC UM3 (UMR 8104 / U1016)]
El Khoury, Petra [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Université Saint-Joseph de Beyrouth [USJ]
Azar, Yara [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Université Saint-Joseph de Beyrouth [USJ]
Andrianirina, Miangaly [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Loste, Alexia [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Abou-Khalil, Yara [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Université Saint-Joseph de Beyrouth [USJ]
Nicolas, Gaël [Auteur]
Centre de recherche sur l'Inflammation [CRI (UMR_S_1149 / ERL_8252 / U1149)]
Le Borgne, Marie [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Moulin, Philippe [Auteur]
Laboratoire de Mécanique, Modélisation et Procédés Propres [M2P2]
Di-Filippo, Mathilde [Auteur]
Cardiovasculaire, métabolisme, diabétologie et nutrition [CarMeN]
Hospices Civils de Lyon [HCL]
Charrière, Sybil [Auteur]
Hôpital Louis Pradel [CHU - HCL]
Cardiovasculaire, métabolisme, diabétologie et nutrition [CarMeN]
Farnier, Michel [Auteur]
CHU Dijon
Yelnick, Cécile [Auteur]
Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167 [RID-AGE]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Carreau, Valérie [Auteur]
Unité de Recherche sur les Maladies Cardiovasculaires, du Métabolisme et de la Nutrition = Research Unit on Cardiovascular and Metabolic Diseases [ICAN]
Ferrières, Jean [Auteur]
Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse [CHU Toulouse]
Lecerf, Jean-Michel [Auteur]
Institut Pasteur de Lille
Derksen, Alexa [Auteur]
McGill University Health Center [Montreal] [MUHC]
Institut de Recherches Cliniques de Montréal [IRCM]
McGill University = Université McGill [Montréal, Canada]
Bernard, Geneviève [Auteur]
Gauthier, Marie-Soleil [Auteur]
Institut de Recherches Cliniques de Montréal [IRCM]
Coulombe, Benoit [Auteur]
Institut de Recherches Cliniques de Montréal [IRCM]
Université de Montréal [UdeM]
Lütjohann, Dieter [Auteur]
University Hospital Bonn
Fin, Bertrand [Auteur]
Laboratoire d'excellence en GENomique MEDicale [ GENMED]
Centre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
Boland, Anne [Auteur]
Laboratoire d'excellence en GENomique MEDicale [ GENMED]
Centre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
Olaso, Robert [Auteur]
Laboratoire d'excellence en GENomique MEDicale [ GENMED]
Centre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
Deleuze, Jean-François [Auteur]
Laboratoire d'excellence en GENomique MEDicale [ GENMED]
Centre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
Rabès, Jean-Pierre [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Hôpital Ambroise Paré [AP-HP]
Boileau, Catherine [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Institut Cochin [IC UM3 (UMR 8104 / U1016)]
Abifadel, Marianne [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Université Saint-Joseph de Beyrouth [USJ]
Varret, Mathilde [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Université Saint-Joseph de Beyrouth [USJ]
Elbitar, Sandy [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Université Saint-Joseph de Beyrouth [USJ]
Philippi, Anne [Auteur]
Institut Cochin [IC UM3 (UMR 8104 / U1016)]
El Khoury, Petra [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Université Saint-Joseph de Beyrouth [USJ]
Azar, Yara [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Université Saint-Joseph de Beyrouth [USJ]
Andrianirina, Miangaly [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Loste, Alexia [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Abou-Khalil, Yara [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Université Saint-Joseph de Beyrouth [USJ]
Nicolas, Gaël [Auteur]
Centre de recherche sur l'Inflammation [CRI (UMR_S_1149 / ERL_8252 / U1149)]
Le Borgne, Marie [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Moulin, Philippe [Auteur]
Laboratoire de Mécanique, Modélisation et Procédés Propres [M2P2]
Di-Filippo, Mathilde [Auteur]
Cardiovasculaire, métabolisme, diabétologie et nutrition [CarMeN]
Hospices Civils de Lyon [HCL]
Charrière, Sybil [Auteur]
Hôpital Louis Pradel [CHU - HCL]
Cardiovasculaire, métabolisme, diabétologie et nutrition [CarMeN]
Farnier, Michel [Auteur]
CHU Dijon
Yelnick, Cécile [Auteur]
Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167 [RID-AGE]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Carreau, Valérie [Auteur]
Unité de Recherche sur les Maladies Cardiovasculaires, du Métabolisme et de la Nutrition = Research Unit on Cardiovascular and Metabolic Diseases [ICAN]
Ferrières, Jean [Auteur]
Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse [CHU Toulouse]
Lecerf, Jean-Michel [Auteur]
Institut Pasteur de Lille
Derksen, Alexa [Auteur]
McGill University Health Center [Montreal] [MUHC]
Institut de Recherches Cliniques de Montréal [IRCM]
McGill University = Université McGill [Montréal, Canada]
Bernard, Geneviève [Auteur]
Gauthier, Marie-Soleil [Auteur]
Institut de Recherches Cliniques de Montréal [IRCM]
Coulombe, Benoit [Auteur]
Institut de Recherches Cliniques de Montréal [IRCM]
Université de Montréal [UdeM]
Lütjohann, Dieter [Auteur]
University Hospital Bonn
Fin, Bertrand [Auteur]
Laboratoire d'excellence en GENomique MEDicale [ GENMED]
Centre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
Boland, Anne [Auteur]
Laboratoire d'excellence en GENomique MEDicale [ GENMED]
Centre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
Olaso, Robert [Auteur]
Laboratoire d'excellence en GENomique MEDicale [ GENMED]
Centre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
Deleuze, Jean-François [Auteur]
Laboratoire d'excellence en GENomique MEDicale [ GENMED]
Centre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
Rabès, Jean-Pierre [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Hôpital Ambroise Paré [AP-HP]
Boileau, Catherine [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Institut Cochin [IC UM3 (UMR 8104 / U1016)]
Abifadel, Marianne [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Université Saint-Joseph de Beyrouth [USJ]
Varret, Mathilde [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Titre de la revue :
Metabolites
Pagination :
262
Éditeur :
MDPI
Date de publication :
2022-03-18
ISSN :
2218-1989
Mot(s)-clé(s) en anglais :
LRP6
LDLRAP1
protein structural models
polygenic risk score
oligogenic hypercholesterolemia
autosomal dominant hypercholesterolemia
linkage analysis
next-generation sequencing
LDL uptake
CYP7A1
LDLRAP1
protein structural models
polygenic risk score
oligogenic hypercholesterolemia
autosomal dominant hypercholesterolemia
linkage analysis
next-generation sequencing
LDL uptake
CYP7A1
Discipline(s) HAL :
Sciences du Vivant [q-bio]/Médecine humaine et pathologie/Endocrinologie et métabolisme
Sciences du Vivant [q-bio]/Génétique/Génétique humaine
Sciences du Vivant [q-bio]/Médecine humaine et pathologie/Cardiologie et système cardiovasculaire
Sciences du Vivant [q-bio]/Génétique/Génétique humaine
Sciences du Vivant [q-bio]/Médecine humaine et pathologie/Cardiologie et système cardiovasculaire
Résumé en anglais : [en]
Autosomal Dominant Hypercholesterolemia (ADH) is a genetic disorder caused by pathogenic variants in LDLR, APOB, PCSK9 and APOE genes. We sought to identify new candidate genes responsible for the ADH phenotype in patients ...
Lire la suite >Autosomal Dominant Hypercholesterolemia (ADH) is a genetic disorder caused by pathogenic variants in LDLR, APOB, PCSK9 and APOE genes. We sought to identify new candidate genes responsible for the ADH phenotype in patients without pathogenic variants in the known ADH-causing genes by focusing on a French family with affected and non-affected members who presented a high ADH polygenic risk score (wPRS). Linkage analysis, whole exome and whole genome sequencing resulted in the identification of variants p.(Pro398Ala) in CYP7A1, p.(Val1382Phe) in LRP6 and p.(Ser202His) in LDLRAP1. A total of 6 other variants were identified in 6 of 160 unrelated ADH probands: p.(Ala13Val) and p.(Aps347Asn) in CYP7A1; p.(Tyr972Cys), p.(Thr1479Ile) and p.(Ser1612Phe) in LRP6; and p.(Ser202LeufsTer19) in LDLRAP1. All six probands presented a moderate wPRS. Serum analyses of carriers of the p.(Pro398Ala) variant in CYP7A1 showed no differences in the synthesis of bile acids compared to the serums of non-carriers. Functional studies of the four LRP6 mutants in HEK293T cells resulted in contradictory results excluding a major effect of each variant alone. Within the family, none of the heterozygous for only the LDLRAP1 p.(Ser202His) variant presented ADH. Altogether, each variant individually does not result in elevated LDL-C; however, the oligogenic combination of two or three variants reveals the ADH phenotype.Lire moins >
Lire la suite >Autosomal Dominant Hypercholesterolemia (ADH) is a genetic disorder caused by pathogenic variants in LDLR, APOB, PCSK9 and APOE genes. We sought to identify new candidate genes responsible for the ADH phenotype in patients without pathogenic variants in the known ADH-causing genes by focusing on a French family with affected and non-affected members who presented a high ADH polygenic risk score (wPRS). Linkage analysis, whole exome and whole genome sequencing resulted in the identification of variants p.(Pro398Ala) in CYP7A1, p.(Val1382Phe) in LRP6 and p.(Ser202His) in LDLRAP1. A total of 6 other variants were identified in 6 of 160 unrelated ADH probands: p.(Ala13Val) and p.(Aps347Asn) in CYP7A1; p.(Tyr972Cys), p.(Thr1479Ile) and p.(Ser1612Phe) in LRP6; and p.(Ser202LeufsTer19) in LDLRAP1. All six probands presented a moderate wPRS. Serum analyses of carriers of the p.(Pro398Ala) variant in CYP7A1 showed no differences in the synthesis of bile acids compared to the serums of non-carriers. Functional studies of the four LRP6 mutants in HEK293T cells resulted in contradictory results excluding a major effect of each variant alone. Within the family, none of the heterozygous for only the LDLRAP1 p.(Ser202His) variant presented ADH. Altogether, each variant individually does not result in elevated LDL-C; however, the oligogenic combination of two or three variants reveals the ADH phenotype.Lire moins >
Langue :
Anglais
Comité de lecture :
Oui
Audience :
Internationale
Vulgarisation :
Non
Collections :
Source :
Fichiers
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