Title :

Splice site variants in the canonical donor site of MED13L exon 7 lead to intron retention in patients with MED13L syndrome

Author(s) :

Fauqueux, Jade [Auteur]
Maladies Rares du Développement : Génétique, Régulation et Protéomique (RADEME) - ULR 7364
Boussion, Simon [Auteur]
Maladies RAres du DEveloppement embryonnaire et du MEtabolisme : du Phénotype au Génotype et à la Fonction - ULR 7364 [RADEME]
Thuillier, Caroline [Auteur]
Institut de génétique médicale
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Meurisse, Evine [Auteur]
Maladies RAres du DEveloppement embryonnaire et du MEtabolisme : du Phénotype au Génotype et à la Fonction - ULR 7364 [RADEME]
Lacombe, Didier [Auteur]
Centre Hospitalier Universitaire de Bordeaux [CHU Bordeaux]
Willems, Marjolaine [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] [CHRU Montpellier]
Piton, Amélie [Auteur]
Les Hôpitaux Universitaires de Strasbourg [HUS]
Ait-Yahya, Émilie [Auteur]
Plateformes Lilloises en Biologie et Santé (PLBS) - UAR 2014 - US 41
Ghoumid, Jamal [Auteur]
Maladies Rares du Développement : Génétique, Régulation et Protéomique (RADEME) - ULR 7364
Smol, Thomas [Auteur]
Maladies Rares du Développement : Génétique, Régulation et Protéomique (RADEME) - ULR 7364

Journal title :

Journal of Medical Genetics

Abbreviated title :

J Med Genet

Volume number :

61

Publisher :

BMJ Publishing Group

Publication date :

2024-08-24

ISSN :

1468-6244

English keyword(s) :

RNA Splicing
Sequence Analysis
DNA
RNA

HAL domain(s) :

Sciences du Vivant [q-bio]

English abstract : [en]

Pathogenic variants in the MED13L gene are associated with the autosomal dominant MED13L syndrome, which is characterised by global developmental delay and cardiac malformations. We investigated two heterozygous MED13L ...
Show more >Pathogenic variants in the MED13L gene are associated with the autosomal dominant MED13L syndrome, which is characterised by global developmental delay and cardiac malformations. We investigated two heterozygous MED13L variants located at the canonical donor splice site motif of exon 7: c.1009+1G>C and c.1009+5G>C. We report that in silico predictions suggested two possible outcomes: exon 7 skipping, resulting in loss of the phosphodegron motif essential for MED13L regulation, or activation of a cryptic donor site in intron 7, leading to intron retention. RNA analysis confirmed that both variants affected the exon 7 splice donor site, resulting in the retention of 73 bp of intron 7. This retention caused a frameshift and premature translation termination, consistent with haploinsufficiency. Our results highlight the importance of combining predictive and experimental approaches to understand the functional impact of splice site variants. These insights into the molecular consequences of MED13L variants provide a deeper understanding of the genetic basis of MED13L syndrome.Show less >

Language :

Anglais

Audience :

Internationale

Popular science :

Non

Administrative institution(s) :

Université de Lille
CHU Lille

Collections :

• Maladies Rares du Développement : Génétique, Régulation et Protéomique (RADEME) - ULR 7364
• Plateformes Lilloises en Biologie et Santé (PLBS) - UAR 2014 - US 41

Submission date :

2024-09-19T21:00:33Z
2024-10-02T09:04:49Z
2025-01-15T16:41:04Z
2025-01-15T16:44:38Z