Vizitig: A visual tool for colored de ...

Type de document :
Pré-publication ou Document de travail
DOI :
10.5281/zenodo.13929021
Titre :
Vizitig: A visual tool for colored de Bruijn graphs exploration
Auteur(s) :
Degardins, Bastien [Auteur]
Linking Dynamic Data [LINKS]
Centre de Recherche en Informatique, Signal et Automatique de Lille - UMR 9189 [CRIStAL]
Mouton, Margaux [Auteur]
Laboratoire d'Informatique, de Modélisation et d'Optimisation des Systèmes [LIMOS]
Guillon, Bruno [Auteur]
Laboratoire d'Informatique, de Modélisation et d'Optimisation des Systèmes [LIMOS]
Institut national polytechnique Clermont Auvergne [INP Clermont Auvergne]
Université Clermont Auvergne [UCA]
Paperman, Charles [Auteur] refId
Linking Dynamic Data [LINKS]
Centre de Recherche en Informatique, Signal et Automatique de Lille - UMR 9189 [CRIStAL]
Marchet, Camille [Auteur]
Institut des sciences informatiques et de leurs interactions - CNRS Sciences informatiques [INS2I-CNRS]
Centre de Recherche en Informatique, Signal et Automatique de Lille - UMR 9189 [CRIStAL]
Date de publication :
2024
Discipline(s) HAL :
Informatique [cs]/Bio-informatique [q-bio.QM]
Résumé en anglais : [en]
 Vizitig is a novel visualization tool designed for the exploration of colored de Bruijn graphs, a structure increasingly used for comparative genomics, pangenomics, and metagenomics. Unlike existing tools such as Bandage, ...
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Langue :
Anglais
Projet ANR :
Analyse en pleine longueur et en profondeur des ARNs
Collections :
Source :
Harvested from HAL
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