Genomic profiling of mycosis fungoides ...
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Title :
Genomic profiling of mycosis fungoides identifies patients at high risk of disease progression
Author(s) :
Fléchon, Léa [Auteur]
Site de Recherche Intégrée en Cancérologie [SIRIC-ONCOLille]
Hétérogénéité, Plasticité et Résistance aux Thérapies des Cancers = Cancer Heterogeneity, Plasticity and Resistance to Therapies - UMR 9020 - U 1277 [CANTHER]
Arib, Inès [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Dutta, Ankit [Auteur]
Broad Institute of MIT and Harvard [BROAD INSTITUTE]
Harvard Medical School [Boston] [HMS]
Dana-Farber Cancer Institute [Boston]
Hasan Bou Issa, Lama [Auteur]
Site de Recherche Intégrée en Cancérologie [SIRIC-ONCOLille]
Hétérogénéité, Plasticité et Résistance aux Thérapies des Cancers = Cancer Heterogeneity, Plasticity and Resistance to Therapies - UMR 9020 - U 1277 [CANTHER]
Sklavenitis-Pistofidis, Romanos [Auteur]
Broad Institute of MIT and Harvard [BROAD INSTITUTE]
Harvard Medical School [Boston] [HMS]
Dana-Farber Cancer Institute [Boston]
Tilmont, Rémi [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Stewart, Chip [Auteur]
Broad Institute of MIT and Harvard [BROAD INSTITUTE]
Dubois, Romain [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Poulain, Stéphanie [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Site de Recherche Intégrée en Cancérologie [SIRIC-ONCOLille]
Hétérogénéité, Plasticité et Résistance aux Thérapies des Cancers = Cancer Heterogeneity, Plasticity and Resistance to Therapies - UMR 9020 - U 1277 [CANTHER]
Copin, Marie-Christine [Auteur]
Centre de Recherche en Cancérologie et Immunologie Intégrée Nantes-Angers [CRCI2NA ]
Javed, Sahir [Auteur]
Centre hospitalier [Valenciennes, Nord]
Nudel, Morgane [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Cavalieri, Doriane [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Escure, Guillaume [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Gower, Nicolas [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Chauvet, Paul [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Gazeau, Nicolas [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Saade, Cynthia [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Thiam, Marietou Binta [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Ouelkite-Oumouchal, Aïcha [Auteur]
Site de Recherche Intégrée en Cancérologie [SIRIC-ONCOLille]
Hétérogénéité, Plasticité et Résistance aux Thérapies des Cancers = Cancer Heterogeneity, Plasticity and Resistance to Therapies - UMR 9020 - U 1277 [CANTHER]
Gaggero, Silvia [Auteur]
Site de Recherche Intégrée en Cancérologie [SIRIC-ONCOLille]
Hétérogénéité, Plasticité et Résistance aux Thérapies des Cancers = Cancer Heterogeneity, Plasticity and Resistance to Therapies - UMR 9020 - U 1277 [CANTHER]
Cailliau, Émeline [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Faiz, Sarah [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Carpentier, Olivier [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Duployez, Nicolas [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Site de Recherche Intégrée en Cancérologie [SIRIC-ONCOLille]
Hétérogénéité, Plasticité et Résistance aux Thérapies des Cancers = Cancer Heterogeneity, Plasticity and Resistance to Therapies - UMR 9020 - U 1277 [CANTHER]
Idziorek, Thierry [Auteur]
Site de Recherche Intégrée en Cancérologie [SIRIC-ONCOLille]
Hétérogénéité, Plasticité et Résistance aux Thérapies des Cancers = Cancer Heterogeneity, Plasticity and Resistance to Therapies - UMR 9020 - U 1277 [CANTHER]
Mortier, Laurent [Auteur]
Thérapies Assistées par Lasers et Immunothérapies pour l'Oncologie - U 1189 [OncoThAI]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Figeac, Martin [Auteur]
Plateforme de génomique fonctionnelle et structurelle [Lille]
Plateformes Lilloises en Biologie et Santé - UAR 2014 - US 41 [PLBS]
Genomic @ Lille - PLBS [GO@L]
Preudhomme, Claude [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Site de Recherche Intégrée en Cancérologie [SIRIC-ONCOLille]
Hétérogénéité, Plasticité et Résistance aux Thérapies des Cancers = Cancer Heterogeneity, Plasticity and Resistance to Therapies - UMR 9020 - U 1277 [CANTHER]
Quesnel, Bruno [Auteur]
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Hétérogénéité, Plasticité et Résistance aux Thérapies des Cancers = Cancer Heterogeneity, Plasticity and Resistance to Therapies - UMR 9020 - U 1277 [CANTHER]
Mitra, Suman [Auteur]
Site de Recherche Intégrée en Cancérologie [SIRIC-ONCOLille]
Hétérogénéité, Plasticité et Résistance aux Thérapies des Cancers = Cancer Heterogeneity, Plasticity and Resistance to Therapies - UMR 9020 - U 1277 [CANTHER]
Morschhauser, Franck [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Getz, Gad [Auteur]
Harvard Medical School [Boston] [HMS]
Massachusetts General Hospital [Boston]
Broad Institute of MIT and Harvard [BROAD INSTITUTE]
Ghobrial, Irene [Auteur]
Harvard Medical School [Boston] [HMS]
Dana-Farber Cancer Institute [Boston]
Manier, Salomon [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
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Arib, Inès [Auteur]
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Dutta, Ankit [Auteur]
Broad Institute of MIT and Harvard [BROAD INSTITUTE]
Harvard Medical School [Boston] [HMS]
Dana-Farber Cancer Institute [Boston]
Hasan Bou Issa, Lama [Auteur]
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Sklavenitis-Pistofidis, Romanos [Auteur]
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Harvard Medical School [Boston] [HMS]
Dana-Farber Cancer Institute [Boston]
Tilmont, Rémi [Auteur]
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Stewart, Chip [Auteur]
Broad Institute of MIT and Harvard [BROAD INSTITUTE]
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Poulain, Stéphanie [Auteur]
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Copin, Marie-Christine [Auteur]
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Javed, Sahir [Auteur]
Centre hospitalier [Valenciennes, Nord]
Nudel, Morgane [Auteur]
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Cavalieri, Doriane [Auteur]
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Escure, Guillaume [Auteur]
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Gower, Nicolas [Auteur]
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Chauvet, Paul [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Gazeau, Nicolas [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Saade, Cynthia [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Thiam, Marietou Binta [Auteur]
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Ouelkite-Oumouchal, Aïcha [Auteur]
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Hétérogénéité, Plasticité et Résistance aux Thérapies des Cancers = Cancer Heterogeneity, Plasticity and Resistance to Therapies - UMR 9020 - U 1277 [CANTHER]
Gaggero, Silvia [Auteur]
Site de Recherche Intégrée en Cancérologie [SIRIC-ONCOLille]
Hétérogénéité, Plasticité et Résistance aux Thérapies des Cancers = Cancer Heterogeneity, Plasticity and Resistance to Therapies - UMR 9020 - U 1277 [CANTHER]
Cailliau, Émeline [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Faiz, Sarah [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Carpentier, Olivier [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Duployez, Nicolas [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
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Hétérogénéité, Plasticité et Résistance aux Thérapies des Cancers = Cancer Heterogeneity, Plasticity and Resistance to Therapies - UMR 9020 - U 1277 [CANTHER]
Idziorek, Thierry [Auteur]
Site de Recherche Intégrée en Cancérologie [SIRIC-ONCOLille]
Hétérogénéité, Plasticité et Résistance aux Thérapies des Cancers = Cancer Heterogeneity, Plasticity and Resistance to Therapies - UMR 9020 - U 1277 [CANTHER]
Mortier, Laurent [Auteur]
Thérapies Assistées par Lasers et Immunothérapies pour l'Oncologie - U 1189 [OncoThAI]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Figeac, Martin [Auteur]
Plateforme de génomique fonctionnelle et structurelle [Lille]
Plateformes Lilloises en Biologie et Santé - UAR 2014 - US 41 [PLBS]
Genomic @ Lille - PLBS [GO@L]
Preudhomme, Claude [Auteur]
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Quesnel, Bruno [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
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Hétérogénéité, Plasticité et Résistance aux Thérapies des Cancers = Cancer Heterogeneity, Plasticity and Resistance to Therapies - UMR 9020 - U 1277 [CANTHER]
Mitra, Suman [Auteur]
Site de Recherche Intégrée en Cancérologie [SIRIC-ONCOLille]
Hétérogénéité, Plasticité et Résistance aux Thérapies des Cancers = Cancer Heterogeneity, Plasticity and Resistance to Therapies - UMR 9020 - U 1277 [CANTHER]
Morschhauser, Franck [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Getz, Gad [Auteur]
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Ghobrial, Irene [Auteur]
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Dana-Farber Cancer Institute [Boston]
Manier, Salomon [Auteur]
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Hétérogénéité, Plasticité et Résistance aux Thérapies des Cancers = Cancer Heterogeneity, Plasticity and Resistance to Therapies - UMR 9020 - U 1277 [CANTHER]
Journal title :
Blood advances
Pages :
3109 - 3119
Publisher :
The American Society of Hematology
Publication date :
2024-06-13
ISSN :
2473-9529
HAL domain(s) :
Sciences du Vivant [q-bio]
English abstract : [en]
Mycosis fungoides (MF) is the most prevalent primary cutaneous T-cell lymphoma, with an indolent or aggressive course and poor survival. The pathogenesis of MF remains unclear, and prognostic factors in the early stages ...
Show more >Mycosis fungoides (MF) is the most prevalent primary cutaneous T-cell lymphoma, with an indolent or aggressive course and poor survival. The pathogenesis of MF remains unclear, and prognostic factors in the early stages are not well established. Here, we characterized the most recurrent genomic alterations using whole-exome sequencing of 67 samples from 48 patients from Lille University Hospital (France), including 18 sequential samples drawn across stages of the malignancy. Genomic data were analyzed on the Broad Institute's Terra bioinformatics platform. We found that gain7q, gain10p15.1 (IL2RA and IL15RA), del10p11.22 (ZEB1), or mutations in JUNB and TET2 are associated with high-risk disease stages. Furthermore, gain7q, gain10p15.1 (IL2RA and IL15RA), del10p11.22 (ZEB1), and del6q16.3 (TNFAIP3) are coupled with shorter survival. Del6q16.3 (TNFAIP3) was a risk factor for progression in patients at low risk. By analyzing the clonal heterogeneity and the clonal evolution of the cohort, we defined different phylogenetic pathways of the disease with acquisition of JUNB, gain10p15.1 (IL2RA and IL15RA), or del12p13.1 (CDKN1B) at progression. These results establish the genomics and clonality of MF and identify potential patients at risk of progression, independent of their clinical stage.Show less >
Show more >Mycosis fungoides (MF) is the most prevalent primary cutaneous T-cell lymphoma, with an indolent or aggressive course and poor survival. The pathogenesis of MF remains unclear, and prognostic factors in the early stages are not well established. Here, we characterized the most recurrent genomic alterations using whole-exome sequencing of 67 samples from 48 patients from Lille University Hospital (France), including 18 sequential samples drawn across stages of the malignancy. Genomic data were analyzed on the Broad Institute's Terra bioinformatics platform. We found that gain7q, gain10p15.1 (IL2RA and IL15RA), del10p11.22 (ZEB1), or mutations in JUNB and TET2 are associated with high-risk disease stages. Furthermore, gain7q, gain10p15.1 (IL2RA and IL15RA), del10p11.22 (ZEB1), and del6q16.3 (TNFAIP3) are coupled with shorter survival. Del6q16.3 (TNFAIP3) was a risk factor for progression in patients at low risk. By analyzing the clonal heterogeneity and the clonal evolution of the cohort, we defined different phylogenetic pathways of the disease with acquisition of JUNB, gain10p15.1 (IL2RA and IL15RA), or del12p13.1 (CDKN1B) at progression. These results establish the genomics and clonality of MF and identify potential patients at risk of progression, independent of their clinical stage.Show less >
Language :
Anglais
Peer reviewed article :
Oui
Audience :
Internationale
Popular science :
Non
Source :
Submission date :
2025-01-22T21:26:40Z
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