Systems glycomics of adult zebrafish ...
Document type :
Article dans une revue scientifique
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Title :
Systems glycomics of adult zebrafish identifies organ-specific sialylation and glycosylation patterns.
Author(s) :
Yamakawa, Nao [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle (UGSF) - UMR 8576
Nagoya University
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Plateforme d’Analyse des Glycoconjugués - PLBS [PAGés]
Vanbeselaere, Jorick [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Chang, Lan-Yi [Auteur]
Academia Sinica
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Yu, Shin-Yi [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Ducrocq Geoffrey, Lucie [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Harduin Lepers, Anne [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Kurata, Junichi [Auteur]
Aoki-Kinoshita Kiyoko, F [Auteur]
Sato, Chihiro [Auteur]
Khoo, Kay-Hooi [Auteur]
Kitajima, Ken [Auteur]
Guerardel, Yann [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle (UGSF) - UMR 8576
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle (UGSF) - UMR 8576
Nagoya University
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Plateforme d’Analyse des Glycoconjugués - PLBS [PAGés]
Vanbeselaere, Jorick [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Chang, Lan-Yi [Auteur]
Academia Sinica
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Yu, Shin-Yi [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Ducrocq Geoffrey, Lucie [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Harduin Lepers, Anne [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Kurata, Junichi [Auteur]
Aoki-Kinoshita Kiyoko, F [Auteur]
Sato, Chihiro [Auteur]
Khoo, Kay-Hooi [Auteur]
Kitajima, Ken [Auteur]
Guerardel, Yann [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle (UGSF) - UMR 8576
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Journal title :
Nature communications
Abbreviated title :
Nat. Commun.
Volume number :
9
Pages :
4647
Publication date :
2018-11-07
English keyword(s) :
Glycobiology
Glycomics
Mass spectrometry
Zebrafish
Glycomics
Mass spectrometry
Zebrafish
HAL domain(s) :
Sciences du Vivant [q-bio]
Chimie/Chimie théorique et/ou physique
Chimie/Chimie théorique et/ou physique
English abstract : [en]
The emergence of zebrafish Danio rerio as a versatile model organism provides the unique opportunity to monitor the functions of glycosylation throughout vertebrate embryogenesis, providing insights into human diseases ...
Show more >The emergence of zebrafish Danio rerio as a versatile model organism provides the unique opportunity to monitor the functions of glycosylation throughout vertebrate embryogenesis, providing insights into human diseases caused by glycosylation defects. Using a combination of chemical modifications, enzymatic digestion and mass spectrometry analyses, we establish here the precise glycomic profiles of eight individual zebrafish organs and demonstrate that the protein glycosylation and glycosphingolipid expression patterns exhibits exquisite specificity. Concomitant expression screening of a wide array of enzymes involved in the synthesis and transfer of sialic acids shows that the presence of organ-specific sialylation motifs correlates with the localized activity of the corresponding glycan biosynthesis pathways. These findings provide a basis for the rational design of zebrafish lines expressing desired glycosylation profiles.Show less >
Show more >The emergence of zebrafish Danio rerio as a versatile model organism provides the unique opportunity to monitor the functions of glycosylation throughout vertebrate embryogenesis, providing insights into human diseases caused by glycosylation defects. Using a combination of chemical modifications, enzymatic digestion and mass spectrometry analyses, we establish here the precise glycomic profiles of eight individual zebrafish organs and demonstrate that the protein glycosylation and glycosphingolipid expression patterns exhibits exquisite specificity. Concomitant expression screening of a wide array of enzymes involved in the synthesis and transfer of sialic acids shows that the presence of organ-specific sialylation motifs correlates with the localized activity of the corresponding glycan biosynthesis pathways. These findings provide a basis for the rational design of zebrafish lines expressing desired glycosylation profiles.Show less >
Language :
Anglais
Peer reviewed article :
Oui
Audience :
Internationale
Popular science :
Non
Administrative institution(s) :
Inserm
Université de Lille
CHU Lille
CNRS
Université de Lille
CHU Lille
CNRS
Collections :
Submission date :
2019-03-01T14:07:49Z
2020-11-25T16:26:43Z
2020-11-25T16:26:43Z
Files
- Yamakawa Nat Comm 2019.pdf
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