Multiplex targeted high-throughput sequencing ...
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Article dans une revue scientifique: Article original
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Titre :
Multiplex targeted high-throughput sequencing in a series of 352 patients with congenital limb malformations
Auteur(s) :
Jourdain, Anne-Sophie [Auteur]
Maladies Rares du Développement : Génétique, Régulation et Protéomique (RADEME) - ULR 7364
Petit, Florence [Auteur]
Maladies Rares du Développement : Génétique, Régulation et Protéomique (RADEME) - ULR 7364
Odou, Marie-Francoise [Auteur]
Institut de Recherche Translationnelle sur l'Inflammation (INFINITE) - U1286
Balduyck, Malika [Auteur]
Maladies Rares du Développement : Génétique, Régulation et Protéomique (RADEME) - ULR 7364
Maladies RAres du DÉveloppement embryonnaire et du Métabolisme : du phénotype au génotype et à la Fonction (RADEME) - ULR 7364
Brunelle, Perrine [Auteur]
Maladies Rares du Développement : Génétique, Régulation et Protéomique (RADEME) - ULR 7364
Dufour, William [Auteur]
CIC CHU ( Lille)/inserm
Boussion, Simon [Auteur]
CIC CHU ( Lille)/inserm
Brischoux-Boucher, Elise [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon [CHRU Besançon]
Colson, Cindy [Auteur]
Service de Génétique Clinique [CHU Caen]
Dieux, Anne [Auteur]
Maladies Rares du Développement : Génétique, Régulation et Protéomique (RADEME) - ULR 7364
Gerard, Marion [Auteur]
Service de Génétique [CHU Caen]
Ghoumid, Jamal [Auteur]
Maladies Rares du Développement : Génétique, Régulation et Protéomique (RADEME) - ULR 7364
Giuliano, Fabienne [Auteur]
Université de Lausanne = University of Lausanne [UNIL]
Goldenberg, Alice [Auteur]
CHU Rouen
Khau Van Kien, Philippe [Auteur]
Hôpital Universitaire Carémeau [Nîmes] [CHU Nîmes]
Lehalle, Daphne [Auteur]
Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand [CHU Dijon]
Morin, Gilles [Auteur]
Unité de génétique médicale et oncogénétique [CHU Amiens Picardie]
Moutton, Sebastien [Auteur]
Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon)
Smol, Thomas [Auteur]
Maladies Rares du Développement : Génétique, Régulation et Protéomique (RADEME) - ULR 7364
Vanlerberghe, Clemence [Auteur]
Maladies RAres du DEveloppement embryonnaire et du MEtabolisme : du Phénotype au Génotype et à la Fonction - ULR 7364 [RADEME]
Manouvrier, Sylvie [Auteur]
Maladies Rares du Développement : Génétique, Régulation et Protéomique (RADEME) - ULR 7364
Escande, Fabienne [Auteur]
Maladies RAres du DEveloppement embryonnaire et du MEtabolisme : du Phénotype au Génotype et à la Fonction - ULR 7364 [RADEME]
Maladies Rares du Développement : Génétique, Régulation et Protéomique (RADEME) - ULR 7364
Petit, Florence [Auteur]
Maladies Rares du Développement : Génétique, Régulation et Protéomique (RADEME) - ULR 7364
Odou, Marie-Francoise [Auteur]
Institut de Recherche Translationnelle sur l'Inflammation (INFINITE) - U1286
Balduyck, Malika [Auteur]
Maladies Rares du Développement : Génétique, Régulation et Protéomique (RADEME) - ULR 7364
Maladies RAres du DÉveloppement embryonnaire et du Métabolisme : du phénotype au génotype et à la Fonction (RADEME) - ULR 7364
Brunelle, Perrine [Auteur]
Maladies Rares du Développement : Génétique, Régulation et Protéomique (RADEME) - ULR 7364
Dufour, William [Auteur]
CIC CHU ( Lille)/inserm
Boussion, Simon [Auteur]
CIC CHU ( Lille)/inserm
Brischoux-Boucher, Elise [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon [CHRU Besançon]
Colson, Cindy [Auteur]
Service de Génétique Clinique [CHU Caen]
Dieux, Anne [Auteur]
Maladies Rares du Développement : Génétique, Régulation et Protéomique (RADEME) - ULR 7364
Gerard, Marion [Auteur]
Service de Génétique [CHU Caen]
Ghoumid, Jamal [Auteur]
Maladies Rares du Développement : Génétique, Régulation et Protéomique (RADEME) - ULR 7364
Giuliano, Fabienne [Auteur]
Université de Lausanne = University of Lausanne [UNIL]
Goldenberg, Alice [Auteur]
CHU Rouen
Khau Van Kien, Philippe [Auteur]
Hôpital Universitaire Carémeau [Nîmes] [CHU Nîmes]
Lehalle, Daphne [Auteur]
Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand [CHU Dijon]
Morin, Gilles [Auteur]
Unité de génétique médicale et oncogénétique [CHU Amiens Picardie]
Moutton, Sebastien [Auteur]
Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon)
Smol, Thomas [Auteur]
Maladies Rares du Développement : Génétique, Régulation et Protéomique (RADEME) - ULR 7364
Vanlerberghe, Clemence [Auteur]
Maladies RAres du DEveloppement embryonnaire et du MEtabolisme : du Phénotype au Génotype et à la Fonction - ULR 7364 [RADEME]
Manouvrier, Sylvie [Auteur]
Maladies Rares du Développement : Génétique, Régulation et Protéomique (RADEME) - ULR 7364
Escande, Fabienne [Auteur]
Maladies RAres du DEveloppement embryonnaire et du MEtabolisme : du Phénotype au Génotype et à la Fonction - ULR 7364 [RADEME]
Titre de la revue :
Human mutation
Nom court de la revue :
Hum. Mutat.
Numéro :
41
Pagination :
222-239
Date de publication :
2019-09-10
ISSN :
1098-1004
Mot(s)-clé(s) :
limb malformation
molecular diagnosis
targeted high-throughput sequencing
genetics
molecular diagnosis
targeted high-throughput sequencing
genetics
Discipline(s) HAL :
Sciences du Vivant [q-bio]
Résumé en anglais : [en]
Congenital limb malformations (CLM) comprise many conditions affecting limbs and more than 150 associated genes have been reported. Due to this large heterogeneity, a high proportion of patients remains without a molecular ...
Lire la suite >Congenital limb malformations (CLM) comprise many conditions affecting limbs and more than 150 associated genes have been reported. Due to this large heterogeneity, a high proportion of patients remains without a molecular diagnosis. In the last two decades, advances in high throughput sequencing have allowed new methodological strategies in clinical practice. Herein, we report the screening of 52 genes/regulatory sequences by multiplex high-throughput targeted sequencing, in a series of 352 patients affected with various CLM, over a 3-year period of time. Patients underwent a clinical triage by expert geneticists in CLM. A definitive diagnosis was achieved in 35.2% of patients, the yield varying considerably, depending on the phenotype. We identified 112 single nucleotide variants and 26 copy-number variations, of which 52 are novel pathogenic or likely pathogenic variants. In 6% of patients, variants of uncertain significance have been found in good candidate genes. We showed that multiplex targeted high-throughput sequencing works as an efficient and cost-effective tool in clinical practice for molecular diagnosis of congenital limb malformations. Careful clinical evaluation of patients may maximize the yield of CLM panel testing.Lire moins >
Lire la suite >Congenital limb malformations (CLM) comprise many conditions affecting limbs and more than 150 associated genes have been reported. Due to this large heterogeneity, a high proportion of patients remains without a molecular diagnosis. In the last two decades, advances in high throughput sequencing have allowed new methodological strategies in clinical practice. Herein, we report the screening of 52 genes/regulatory sequences by multiplex high-throughput targeted sequencing, in a series of 352 patients affected with various CLM, over a 3-year period of time. Patients underwent a clinical triage by expert geneticists in CLM. A definitive diagnosis was achieved in 35.2% of patients, the yield varying considerably, depending on the phenotype. We identified 112 single nucleotide variants and 26 copy-number variations, of which 52 are novel pathogenic or likely pathogenic variants. In 6% of patients, variants of uncertain significance have been found in good candidate genes. We showed that multiplex targeted high-throughput sequencing works as an efficient and cost-effective tool in clinical practice for molecular diagnosis of congenital limb malformations. Careful clinical evaluation of patients may maximize the yield of CLM panel testing.Lire moins >
Langue :
Anglais
Audience :
Internationale
Vulgarisation :
Non
Établissement(s) :
CHU Lille
Inserm
Université de Lille
Inserm
Université de Lille
Collections :
Date de dépôt :
2021-09-02T07:02:14Z
2021-09-15T08:22:44Z
2021-09-15T08:27:48Z
2021-09-15T08:22:44Z
2021-09-15T08:27:48Z
Fichiers
- Jourdain_humu_2019.pdf
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