Contribution to Alzheimer's disease risk ...
Document type :
Compte-rendu et recension critique d'ouvrage
PMID :
Title :
Contribution to Alzheimer's disease risk of rare variants in TREM_2, SORL_1, and ABCA_7 in 1779 cases and 1273 controls
Author(s) :
Bellenguez, Céline [Auteur]
Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167 [RID-AGE]
Excellence Laboratory LabEx DISTALZ
Charbonnier, Camille [Auteur]
Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques [GPMCND]
Grenier-Boley, Benjamin [Auteur]
Epidémiologie des maladies chroniques : impact des interactions gène environnement sur la santé des populations
Quenez, Olivier [Auteur]
Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques [GPMCND]
Le Guennec, Kilan [Auteur]
Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques [GPMCND]
Nicolas, Gaël [Auteur]
Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques [GPMCND]
Chauhan, Ganesh [Auteur]
Wallon, David [Auteur]
Service de neurologie [Rouen]
Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques [GPMCND]
Rousseau, Stéphane [Auteur]
Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques [GPMCND]
Richard, Anne-Claire [Auteur]
Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques [GPMCND]
Boland, Anne [Auteur]
Centre National de Génotypage [CNG]
Bourque, Guillaume [Auteur]
McGill University and Genome Quebec Innovation Centre
Munter, Hans Markus [Auteur]
McGill University and Genome Quebec Innovation Centre
Olaso, Robert [Auteur]
Centre National de Génotypage [CNG]
Meyer, Vincent [Auteur]
Centre National de Génotypage [CNG]
Rollin-Sillaire, Adeline [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Troubles cognitifs dégénératifs et vasculaires - U 1171 - EA 1046 [TCDV]
Pasquier, Florence [Auteur]
Département de neurologie [Lille]
Letenneur, Luc [Auteur]
Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)
Université de Bordeaux [UB]
Redon, Richard [Auteur]
ITX - unité de recherche de l'institut du thorax [ITX]
Dartigues, Jean-François [Auteur]
Epidémiologie, santé publique et développement
Tzourio, Christophe [Auteur]
Neuroépidémiologie
Frebourg, Thierry [Auteur]
Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques [GPMCND]
Lathrop, Mark [Auteur]
McGill University and Genome Quebec Innovation Centre
Deleuze, Jean-François [Auteur]
Centre National de Génotypage [CNG]
Hannequin, Didier [Auteur]
Service de neurologie [Rouen]
Genin, Emmanuelle [Auteur]
Génétique, génomique fonctionnelle et biotechnologies (UMR 1078) [GGB]
Amouyel, Philippe [Auteur]
Université de Lille
Debette, Stéphanie [Auteur]
Troubles cognitifs vasculaires et dégénératifs
Lambert, Jean-Charles [Auteur]
Institut Pasteur de Lille
Campion, Dominique [Auteur]
Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques [GPMCND]
Gabelle-Deloustal, Audrey [Collaborateur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] [CHRU Montpellier]
Labauge, Pierre [Collaborateur]
Département de neurologie [Montpellier]
Godefroy, Olivier [Collaborateur]
CHU Amiens-Picardie
Laboratoire de Neurosciences Fonctionnelles et Pathologies - UR UPJV 4559 [LNFP]
Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167 [RID-AGE]
Excellence Laboratory LabEx DISTALZ
Charbonnier, Camille [Auteur]
Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques [GPMCND]
Grenier-Boley, Benjamin [Auteur]
Epidémiologie des maladies chroniques : impact des interactions gène environnement sur la santé des populations
Quenez, Olivier [Auteur]
Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques [GPMCND]
Le Guennec, Kilan [Auteur]
Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques [GPMCND]
Nicolas, Gaël [Auteur]
Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques [GPMCND]
Chauhan, Ganesh [Auteur]
Wallon, David [Auteur]
Service de neurologie [Rouen]
Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques [GPMCND]
Rousseau, Stéphane [Auteur]
Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques [GPMCND]
Richard, Anne-Claire [Auteur]
Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques [GPMCND]
Boland, Anne [Auteur]
Centre National de Génotypage [CNG]
Bourque, Guillaume [Auteur]
McGill University and Genome Quebec Innovation Centre
Munter, Hans Markus [Auteur]
McGill University and Genome Quebec Innovation Centre
Olaso, Robert [Auteur]
Centre National de Génotypage [CNG]
Meyer, Vincent [Auteur]
Centre National de Génotypage [CNG]
Rollin-Sillaire, Adeline [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Troubles cognitifs dégénératifs et vasculaires - U 1171 - EA 1046 [TCDV]
Pasquier, Florence [Auteur]
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Département de neurologie [Lille]
Letenneur, Luc [Auteur]
Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)
Université de Bordeaux [UB]
Redon, Richard [Auteur]
ITX - unité de recherche de l'institut du thorax [ITX]
Dartigues, Jean-François [Auteur]
Epidémiologie, santé publique et développement
Tzourio, Christophe [Auteur]
Neuroépidémiologie
Frebourg, Thierry [Auteur]
Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques [GPMCND]
Lathrop, Mark [Auteur]
McGill University and Genome Quebec Innovation Centre
Deleuze, Jean-François [Auteur]
Centre National de Génotypage [CNG]
Hannequin, Didier [Auteur]
Service de neurologie [Rouen]
Genin, Emmanuelle [Auteur]
Génétique, génomique fonctionnelle et biotechnologies (UMR 1078) [GGB]
Amouyel, Philippe [Auteur]
Université de Lille
Debette, Stéphanie [Auteur]
Troubles cognitifs vasculaires et dégénératifs
Lambert, Jean-Charles [Auteur]
Institut Pasteur de Lille
Campion, Dominique [Auteur]
Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques [GPMCND]
Gabelle-Deloustal, Audrey [Collaborateur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] [CHRU Montpellier]
Labauge, Pierre [Collaborateur]
Département de neurologie [Montpellier]
Godefroy, Olivier [Collaborateur]
CHU Amiens-Picardie
Laboratoire de Neurosciences Fonctionnelles et Pathologies - UR UPJV 4559 [LNFP]
Journal title :
Neurobiology of Aging
Pages :
220.e1-220.e9
Publisher :
Elsevier
Publication date :
2017
ISSN :
0197-4580
English keyword(s) :
Genome-Wide Association Study
Genetic Predisposition to Disease
Young Adult
80 and over
Middle Aged
Aged
Male
Alzheimer's disease
Humans
Membrane Glycoproteins
Genetic Variation
Genetic Association Studies
LDL-Receptor Related Proteins
ATP-Binding Cassette Transporters
Immunologic
SORL1
TREM2
ABCA7
Membrane Transport Proteins
Receptors
Female
Adult
Alzheimer Disease
Whole Genome Sequencing
Apolipoprotein E4
Genetic Predisposition to Disease
Young Adult
80 and over
Middle Aged
Aged
Male
Alzheimer's disease
Humans
Membrane Glycoproteins
Genetic Variation
Genetic Association Studies
LDL-Receptor Related Proteins
ATP-Binding Cassette Transporters
Immunologic
SORL1
TREM2
ABCA7
Membrane Transport Proteins
Receptors
Female
Adult
Alzheimer Disease
Whole Genome Sequencing
Apolipoprotein E4
HAL domain(s) :
Sciences du Vivant [q-bio]/Neurosciences [q-bio.NC]/Neurobiologie
English abstract : [en]
We performed whole-exome and whole-genome sequencing in 927 late-onset Alzheimer disease (LOAD) cases, 852 early-onset AD (EOAD) cases, and 1273 controls from France. We assessed the evidence for gene-based association of ...
Show more >We performed whole-exome and whole-genome sequencing in 927 late-onset Alzheimer disease (LOAD) cases, 852 early-onset AD (EOAD) cases, and 1273 controls from France. We assessed the evidence for gene-based association of rare variants with AD in 6 genes for which an association with such variants was previously claimed. When aggregating protein-truncating and missense-predicted damaging variants, we found exome-wide significant association between EOAD risk~and rare variants in SORL1, TREM2, and ABCA7. No exome-wide significant signal was obtained in the LOAD sample, and significance of the order of 10$^{-6}$ was observed in the whole AD group for TREM2. Our study confirms previous gene-level results for TREM2, SORL1, and ABCA7 and provides a~clearer insight into the classes of rare variants involved. Despite different effect sizes and~varying~cumulative minor allele frequencies, the rare protein-truncating and missense-predicted~damaging variants in TREM2, SORL1, and ABCA7 contribute similarly to the heritability of EOAD and explain between 1.1% and 1.5% of EOAD heritability each, compared with 9.12% for APOE $\varepsilon$4.Show less >
Show more >We performed whole-exome and whole-genome sequencing in 927 late-onset Alzheimer disease (LOAD) cases, 852 early-onset AD (EOAD) cases, and 1273 controls from France. We assessed the evidence for gene-based association of rare variants with AD in 6 genes for which an association with such variants was previously claimed. When aggregating protein-truncating and missense-predicted damaging variants, we found exome-wide significant association between EOAD risk~and rare variants in SORL1, TREM2, and ABCA7. No exome-wide significant signal was obtained in the LOAD sample, and significance of the order of 10$^{-6}$ was observed in the whole AD group for TREM2. Our study confirms previous gene-level results for TREM2, SORL1, and ABCA7 and provides a~clearer insight into the classes of rare variants involved. Despite different effect sizes and~varying~cumulative minor allele frequencies, the rare protein-truncating and missense-predicted~damaging variants in TREM2, SORL1, and ABCA7 contribute similarly to the heritability of EOAD and explain between 1.1% and 1.5% of EOAD heritability each, compared with 9.12% for APOE $\varepsilon$4.Show less >
Language :
Anglais
Popular science :
Non
ANR Project :
Collections :
Source :