Title :

Community‐Level Responses to Iron Availability in Open Ocean Plankton Ecosystems

Author(s) :

Caputi, Luigi [Auteur]
Stazione Zoologica Anton Dohrn [SZN]
Carradec, Quentin [Auteur]
Institut de Biologie François JACOB [JACOB]
Université Paris-Saclay
Eveillard, Damien [Auteur]
Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes [LS2N]
Combinatoire et Bioinformatique [LS2N - équipe COMBI]
Kirilovsky, Amos [Auteur]
Pelletier, Eric [Auteur]
Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives [CEA]
Pierella Karlusich, Juan [Auteur]
Institut de biologie de l'ENS Paris [IBENS]
Rocha Jimenez Vieira, Fabio [Auteur]
Institut de biologie de l'ENS Paris [IBENS]
Villar, Emilie [Auteur]
Chaffron, Samuel [Auteur]
Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes [LS2N]
Malviya, Shruti [Auteur]
Scalco, Eleonora [Auteur]
Stazione Zoologica Anton Dohrn [SZN]
Acinas, Silvia [Auteur]
Institute of Marine Sciences / Institut de Ciències del Mar [Barcelona] [ICM]
Alberti, Adriana [Auteur]
Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] [GENOSCOPE]
Aury, Jean‐marc [Auteur]
Laboratoire de Bioinformatique pour la Génomique et la Biodiversité [LBGB]
Benoiston, Anne‐sophie [Auteur]
Bertrand, Alexis [Auteur]
Laboratoire de Bioinformatique pour la Génomique et la Biodiversité [LBGB]
Biard, Tristan [Auteur]
Université du Littoral Côte d'Opale [ULCO]
Laboratoire d’Océanologie et de Géosciences (LOG) - UMR 8187 [LOG]
Bittner, Lucie [Auteur]
Institut de Systématique, Evolution, Biodiversité [ISYEB ]
Boccara, Martine [Auteur]
Institut de Systématique, Evolution, Biodiversité [ISYEB ]
Institut de biologie de l'ENS Paris [IBENS]
Brum, Jennifer [Auteur]
Ecology and Evolutionary Biology [Tucson] [EEB]
Brunet, Christophe [Auteur]
Institut de Physique du Globe de Paris [IPGP]
Busseni, Greta [Auteur]
Carratalà, Anna [Auteur]
Claustre, Hervé [Auteur]
Coelho, Luis [Auteur]
Colin, Sébastien [Auteur]
Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes [LS2N]
d'Aniello, Salvatore [Auteur]
da Silva, Corinne [Auteur]
Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes [LS2N]
del Core, Marianna [Auteur]
Doré, Hugo [Auteur]
Gasparini, Stéphane [Auteur]
Kokoszka, Florian [Auteur]
Jamet, Jean‐louis [Auteur]
Lejeusne, Christophe [Auteur]
Lepoivre, Cyrille [Auteur]
Lescot, Magali [Auteur]
Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes [LS2N]
Lima‐mendez, Gipsi [Auteur]
Lombard, Fabien [Auteur]
Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes [LS2N]
Lukeš, Julius [Auteur]
Maillet, Nicolas [Auteur]
Madoui, Mohammed‐amin [Auteur]
Martinez, Elodie [Auteur]
Laboratoire d'Océanographie Physique et Spatiale [LOPS]
Mazzocchi, Maria [Auteur]
Néou, Mario [Auteur]
Paz‐yepes, Javier [Auteur]
Poulain, Julie [Auteur]
Ramondenc, Simon [Auteur]
Romagnan, Jean‐baptiste [Auteur]
Roux, Simon [Auteur]
Salvagio Manta, Daniela [Auteur]
Sanges, Remo [Auteur]
Speich, Sabrina [Auteur]
Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes [LS2N]
Sprovieri, Mario [Auteur]
Sunagawa, Shinichi [Auteur]
Taillandier, Vincent [Auteur]
Tanaka, Atsuko [Auteur]
Tirichine, Leila [Auteur]
Trottier, Camille [Auteur]
Uitz, Julia [Auteur]
Veluchamy, Alaguraj [Auteur]
Veselá, Jana [Auteur]
Vincent, Flora [Auteur]
Yau, Sheree [Auteur]
Kandels‐lewis, Stefanie [Auteur]
Searson, Sarah [Auteur]
Dimier, Céline [Auteur]
Picheral, Marc [Auteur]
Bork, Peer [Auteur]
Boss, Emmanuel [Auteur]
de Vargas, Colomban [Auteur]
Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes [LS2N]
Follows, Michael [Auteur]
Grimsley, Nigel [Auteur]
Guidi, Lionel [Auteur]
Laboratoire d'océanographie de Villefranche [LOV]
Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes [LS2N]
Hingamp, Pascal [Auteur]
Karsenti, Eric [Auteur]
Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes [LS2N]
Sordino, Paolo [Auteur]
Stemmann, Lars [Auteur]
Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes [LS2N]
Sullivan, Matthew [Auteur]
Tagliabue, Alessandro [Auteur]
Zingone, Adriana [Auteur]
Garczarek, Laurence [Auteur]
d'Ortenzio, Fabrizio [Auteur]
Testor, Pierre [Auteur]
Not, Fabrice [Auteur]
d'Alcalà, Maurizio [Auteur]
Wincker, Patrick [Auteur]
Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes [LS2N]
Bowler, Chris [Auteur]
Institut de biologie de l'ENS Paris [IBENS]
Laboratoire des Sciences du Numérique de Nantes [LS2N]
Iudicone, Daniele [Auteur]

Journal title :

GLOBAL BIOGEOCHEMICAL CYCLES

Pages :

391 - 419

Publisher :

American Geophysical Union

Publication date :

2019-03

ISSN :

0886-6236

English keyword(s) :

iron response
system biology
meta-omics
species networks

HAL domain(s) :

Sciences du Vivant [q-bio]

English abstract : [en]

Predicting responses of plankton to variations in essential nutrients is hampered by limited in situ measurements, a poor understanding of community composition, and the lack of reference gene catalogs for key taxa. Iron ...
Show more >Predicting responses of plankton to variations in essential nutrients is hampered by limited in situ measurements, a poor understanding of community composition, and the lack of reference gene catalogs for key taxa. Iron is a key driver of plankton dynamics and, therefore, of global biogeochemical cycles and climate. To assess the impact of iron availability on plankton communities, we explored the comprehensive bio-oceanographic and bio-omics data sets from Tara Oceans in the context of the iron products from two state-of-the-art global scale biogeochemical models. We obtained novel information about adaptation and acclimation toward iron in a range of phytoplankton, including picocyanobacteria and diatoms, and identified whole subcommunities covarying with iron. Many of the observed global patterns were recapitulated in the Marquesas archipelago, where frequent plankton blooms are believed to be caused by natural iron fertilization, although they are not captured in large-scale biogeochemical models. This work provides a proof of concept that integrative analyses, spanning from genes to ecosystems and viruses to zooplankton, can disentangle the complexity of plankton communities and can lead to more accurate formulations of resource bioavailability in biogeochemical models, thus improving our understanding of plankton resilience in a changing environment.Show less >

Language :

Anglais

Popular science :

Non

Collections :

• Laboratoire d'Océanologie et de Géosciences (LOG) - UMR 8187

Source :

Harvested from HAL