Smoothness correction for better SOFI imaging.

Hugelier, S.; Vandenberg, W.; Lukeš, T.; Grußmayer, K. S.; Eilers, P. H. C.; Dedecker, P.; Ruckebusch, Cyril

Type de document :

Article dans une revue scientifique: Article original

DOI :

10.1038/s41598-021-87164-4

PMID :

33828326

URL permanente :

http://hdl.handle.net/20.500.12210/109534

Titre :

Smoothness correction for better SOFI imaging.

Auteur(s) :

Hugelier, S. [Auteur]
Vandenberg, W. [Auteur]
Lukeš, T. [Auteur]
Grußmayer, K. S. [Auteur]
Eilers, P. H. C. [Auteur]
Dedecker, P. [Auteur]
Ruckebusch, Cyril [Auteur]

Laboratoire Avancé de Spectroscopie pour les Intéractions la Réactivité et l'Environnement (LASIRE) - UMR 8516

Titre de la revue :

Scientific Reports

Nom court de la revue :

Sci Rep

Numéro :

Pagination :

7569

Date de publication :

2021-04-17

ISSN :

2045-2322

Discipline(s) HAL :

Chimie/Chimie théorique et/ou physique

Résumé en anglais : [en]

Sub-diffraction or super-resolution fluorescence imaging allows the visualization of the cellular morphology and interactions at the nanoscale. Statistical analysis methods such as super-resolution optical fluctuation ...
Lire la suite >Sub-diffraction or super-resolution fluorescence imaging allows the visualization of the cellular morphology and interactions at the nanoscale. Statistical analysis methods such as super-resolution optical fluctuation imaging (SOFI) obtain an improved spatial resolution by analyzing fluorophore blinking but can be perturbed by the presence of non-stationary processes such as photodestruction or fluctuations in the illumination. In this work, we propose to use Whittaker smoothing to remove these smooth signal trends and retain only the information associated to independent blinking of the emitters, thus enhancing the SOFI signals. We find that our method works well to correct photodestruction, especially when it occurs quickly. The resulting images show a much higher contrast, strongly suppressed background and a more detailed visualization of cellular structures. Our method is parameter-free and computationally efficient, and can be readily applied on both two-dimensional and three-dimensional data.Lire moins >

Langue :

Anglais

Comité de lecture :

Oui

Audience :

Internationale

Vulgarisation :

Non

Établissement(s) :

Université de Lille
CNRS

Collections :

Laboratoire Avancé de Spectroscopie pour les Intéractions la Réactivité et l'Environnement (LASIRE) - UMR 8516

Date de dépôt :

2024-02-28T22:43:23Z
2024-03-15T10:30:23Z

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2	20.500.12210/109534*	2024-03-15T10:29:01Z
1	20.500.12210/109534.1	2024-02-28T22:43:23Z

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