Kinetic proofreading of chromatin remodeling: ...
Type de document :
Article dans une revue scientifique
URL permanente :
Titre :
Kinetic proofreading of chromatin remodeling: from gene activation to gene repression and back
Auteur(s) :
Singh, Raghvendra [Auteur]
Institut d’Électronique, de Microélectronique et de Nanotechnologie - UMR 8520 [IEMN]
null
Brysbaert, Guillaume [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle (UGSF) - UMR 8576
Lensink, Marc [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle (UGSF) - UMR 8576
Cleri, Fabrizio [Auteur]
Institut d'Électronique, de Microélectronique et de Nanotechnologie (IEMN) - UMR 8520
Blossey, Ralf [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle (UGSF) - UMR 8576
Institut d’Électronique, de Microélectronique et de Nanotechnologie - UMR 8520 [IEMN]
null
Brysbaert, Guillaume [Auteur]

Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle (UGSF) - UMR 8576
Lensink, Marc [Auteur]

Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle (UGSF) - UMR 8576
Cleri, Fabrizio [Auteur]

Institut d'Électronique, de Microélectronique et de Nanotechnologie (IEMN) - UMR 8520
Blossey, Ralf [Auteur]

Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle (UGSF) - UMR 8576
Titre de la revue :
AIMS Biophysics
Numéro :
2
Pagination :
398-411
Date de publication :
2015-08
ISSN :
2377-9098
Mot(s)-clé(s) en anglais :
chromatin
histone code
remodeler
bromodomain
nucleosome
histone
histone code
remodeler
bromodomain
nucleosome
histone
Discipline(s) HAL :
Chimie/Chimie théorique et/ou physique
Résumé en anglais : [en]
ATP-dependent chromatin remodeling is the active displacement of nucleosomes along or off DNA induced by chromatin remodeling complexes. This key process of gene regulation in eukaryote organisms has recently been argued ...
Lire la suite >ATP-dependent chromatin remodeling is the active displacement of nucleosomes along or off DNA induced by chromatin remodeling complexes. This key process of gene regulation in eukaryote organisms has recently been argued to be controlled by a kinetic proofreading mechanism. In this paper we present a discussion of the current understanding of this process. We review the case of gene repression via heterochromatin formation by remodelers from the ISWI family and then discuss the activation of the IFN-β gene, where the displacement of the nucleosome is initiated by histone tail acetylations by the enzyme GCN5 which are required for the recruitment of SWI-SNF remodelers. We quantify the speci city of the acetylation step in the remodeling process by peptide docking simulations.Lire moins >
Lire la suite >ATP-dependent chromatin remodeling is the active displacement of nucleosomes along or off DNA induced by chromatin remodeling complexes. This key process of gene regulation in eukaryote organisms has recently been argued to be controlled by a kinetic proofreading mechanism. In this paper we present a discussion of the current understanding of this process. We review the case of gene repression via heterochromatin formation by remodelers from the ISWI family and then discuss the activation of the IFN-β gene, where the displacement of the nucleosome is initiated by histone tail acetylations by the enzyme GCN5 which are required for the recruitment of SWI-SNF remodelers. We quantify the speci city of the acetylation step in the remodeling process by peptide docking simulations.Lire moins >
Langue :
Anglais
Audience :
Internationale
Vulgarisation :
Non
Établissement(s) :
ISEN
Univ. Valenciennes
CNRS
Institut Catholique Lille
Centrale Lille
Université de Lille
Univ. Valenciennes
CNRS
Institut Catholique Lille
Centrale Lille
Université de Lille
Collections :
Équipe(s) de recherche :
Computational Molecular Systems Biology
Date de dépôt :
2020-02-12T15:45:23Z
2021-07-13T09:25:06Z
2021-07-13T09:25:06Z
Fichiers
- 10.3934_biophy.2015.4.398.pdf
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