Shadow Technique Algorithm (STA) Sheds a ...
Type de document :
Article dans une revue scientifique: Article original
URL permanente :
Titre :
Shadow Technique Algorithm (STA) Sheds a New Light on Differential Interference Contrast (DIC) Microscopy
Auteur(s) :
Trinel, Dave [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Vandame, Pauline [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Hervieu, Magalie [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Floquet, Emilie [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Aumercier, Marc [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Biondi, Emanuele G. [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Bodart, Jean-Francois [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Spriet, Corentin [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Vandame, Pauline [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Hervieu, Magalie [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Floquet, Emilie [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Aumercier, Marc [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Biondi, Emanuele G. [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Bodart, Jean-Francois [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Spriet, Corentin [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Titre de la revue :
Journal of Analytical & Bioanalytical Techniques
Numéro :
6
Date de publication :
2015-08-28
ISSN :
21559872
Mot(s)-clé(s) en anglais :
Differential interference contrast
Shadow technique algorithm
Image analysis
ImageJ
Tracking
Cell cycle
3D reconstruction
Shadow technique algorithm
Image analysis
ImageJ
Tracking
Cell cycle
3D reconstruction
Discipline(s) HAL :
Chimie/Chimie théorique et/ou physique
Résumé en anglais : [en]
Diversity of biological samples is still partially considered by conventional Differential Interference Contrast (DIC) microscopy approaches. Here we propose a new algorithm (developed as an ImageJ macro), the STA (Shadow ...
Lire la suite >Diversity of biological samples is still partially considered by conventional Differential Interference Contrast (DIC) microscopy approaches. Here we propose a new algorithm (developed as an ImageJ macro), the STA (Shadow Technique Algorithm), whose originality relies in the 3D/4D visualization of a large range of biological objects, from bacteria, vegetal tissues to living cells in culture. This new approach does not need extensive calculations, systems modifications or in-depth knowledge of acquisition optics. STA, providing 3D DIC reconstruction every hundredth of ms, can be applied to dissect various cellular phenomena. In addition, we propose different methods of graphic representations, which unable to enlighten the specificities of each category of questioning. Specifically we here addressed: i) tissue imaging, ii) cell cycle and cell death imaging iii) vesicle tracking.Lire moins >
Lire la suite >Diversity of biological samples is still partially considered by conventional Differential Interference Contrast (DIC) microscopy approaches. Here we propose a new algorithm (developed as an ImageJ macro), the STA (Shadow Technique Algorithm), whose originality relies in the 3D/4D visualization of a large range of biological objects, from bacteria, vegetal tissues to living cells in culture. This new approach does not need extensive calculations, systems modifications or in-depth knowledge of acquisition optics. STA, providing 3D DIC reconstruction every hundredth of ms, can be applied to dissect various cellular phenomena. In addition, we propose different methods of graphic representations, which unable to enlighten the specificities of each category of questioning. Specifically we here addressed: i) tissue imaging, ii) cell cycle and cell death imaging iii) vesicle tracking.Lire moins >
Langue :
Anglais
Comité de lecture :
Oui
Audience :
Internationale
Vulgarisation :
Non
Références liée(s) :
Établissement(s) :
CNRS
Université de Lille
Université de Lille
Équipe(s) de recherche :
Biologie structurale et intégrative
Date de dépôt :
2020-02-12T15:45:25Z
2020-04-15T09:53:35Z
2020-04-15T09:53:35Z
Fichiers
- shadow-technique-algorithm-sta-sheds-a-new-light-on-differentialinterference-contrast-dic-microscopy-2155-9872-1000268.pdf
- Version éditeur
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Annexes
- zenodo
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