Title :

SimBA: A methodology and tools for evaluating the performance of RNA-Seq bioinformatic pipelines

Author(s) :

Audoux, Jérôme [Auteur]
Institut de Biologie Computationnelle [IBC]
Salson, Mikaël [Auteur]
Centre de Recherche en Informatique, Signal et Automatique de Lille - UMR 9189 [CRIStAL]
Bioinformatics and Sequence Analysis [BONSAI]
Grosset, Christophe F. [Auteur]
Biothérapies des maladies génétiques et cancers
Beaumeunier, Sacha [Auteur]
Institut de Biologie Computationnelle [IBC]
Holder, Jean-Marc [Auteur]
Institut de Biologie Computationnelle [IBC]
Commes, Thérèse [Auteur]
Institut de Biologie Computationnelle [IBC]
Philippe, Nicolas [Auteur correspondant]
Institut de Biologie Computationnelle [IBC]

Journal title :

BMC Bioinformatics

Pages :

428

Publisher :

BioMed Central

Publication date :

2017-09

ISSN :

1471-2105

English keyword(s) :

Pipeline optimization
RNA-Seq
Transcriptomics
Benchmark

HAL domain(s) :

Sciences du Vivant [q-bio]
Sciences du Vivant [q-bio]/Bio-Informatique, Biologie Systémique [q-bio.QM]
Sciences du Vivant [q-bio]/Biologie cellulaire

Language :

Anglais

Peer reviewed article :

Oui

Audience :

Internationale

Popular science :

Non

Collections :

• Centre de Recherche en Informatique, Signal et Automatique de Lille (CRIStAL) - UMR 9189

Source :

Harvested from HAL

Submission date :

2020-05-28T13:08:24Z