A dynamic CTCF chromatin binding landscape ...
Type de document :
Compte-rendu et recension critique d'ouvrage
DOI :
PMID :
Titre :
A dynamic CTCF chromatin binding landscape promotes DNA hydroxymethylation and transcriptional induction of adipocyte differentiation
Auteur(s) :
Dubois-Chevalier, Julie [Auteur]
Institut Pasteur de Lille
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Oger, Frédérik [Auteur]
Institut Pasteur de Lille
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Dehondt, Hélène [Auteur]
Institut Pasteur de Lille
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Firmin, François [Auteur]
Institut Pasteur de Lille
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Gheeraert, Celine [Auteur]
Institut Pasteur de Lille
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Staels, Bart [Auteur]
Institut Pasteur de Lille
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Lefebvre, Philippe [Auteur]
Institut Pasteur de Lille
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Eeckhoute, Jérôme [Auteur correspondant]
Institut Pasteur de Lille
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Institut Pasteur de Lille
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Oger, Frédérik [Auteur]
Institut Pasteur de Lille
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Dehondt, Hélène [Auteur]
Institut Pasteur de Lille
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Firmin, François [Auteur]
Institut Pasteur de Lille
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Gheeraert, Celine [Auteur]
Institut Pasteur de Lille
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Staels, Bart [Auteur]
Institut Pasteur de Lille
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Lefebvre, Philippe [Auteur]
Institut Pasteur de Lille
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Eeckhoute, Jérôme [Auteur correspondant]
Institut Pasteur de Lille
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Titre de la revue :
Nucleic Acids Research
Pagination :
10943-10959
Éditeur :
Oxford University Press
Date de publication :
2014-09-29
ISSN :
0305-1048
Discipline(s) HAL :
Sciences du Vivant [q-bio]/Médecine humaine et pathologie
Sciences du Vivant [q-bio]
Sciences du Vivant [q-bio]
Résumé en anglais : [en]
CCCTC-binding factor (CTCF) is a ubiquitously expressed multifunctional transcription factor characterized by chromatin binding patterns often described as largely invariant. In this context, how CTCF chromatin recruitment ...
Lire la suite >CCCTC-binding factor (CTCF) is a ubiquitously expressed multifunctional transcription factor characterized by chromatin binding patterns often described as largely invariant. In this context, how CTCF chromatin recruitment and functionalities are used to promote cell type-specific gene expression remains poorly defined. Here, we show that, in addition to constitutively bound CTCF binding sites (CTS), the CTCF cistrome comprises a large proportion of sites showing highly dynamic binding patterns during the course of adipogenesis. Interestingly, dynamic CTCF chromatin binding is positively linked with changes in expression of genes involved in biological functions defining the different stages of adipogenesis. Importantly, a subset of these dynamic CTS are gained at cell type-specific regulatory regions, in line with a requirement for CTCF in transcriptional induction of adipocyte differentiation. This relates to, at least in part, CTCF requirement for transcriptional activation of both the nuclear receptor peroxisome proliferator-activated receptor gamma (PPARG) and its target genes. Functionally, we show that CTCF interacts with TET methylcytosine dioxygenase (TET) enzymes and promotes adipogenic transcriptional enhancer DNA hydroxymethylation. Our study reveals a dynamic CTCF chromatin binding landscape required for epigenomic remodeling of enhancers and transcriptional activation driving cell differentiation.Lire moins >
Lire la suite >CCCTC-binding factor (CTCF) is a ubiquitously expressed multifunctional transcription factor characterized by chromatin binding patterns often described as largely invariant. In this context, how CTCF chromatin recruitment and functionalities are used to promote cell type-specific gene expression remains poorly defined. Here, we show that, in addition to constitutively bound CTCF binding sites (CTS), the CTCF cistrome comprises a large proportion of sites showing highly dynamic binding patterns during the course of adipogenesis. Interestingly, dynamic CTCF chromatin binding is positively linked with changes in expression of genes involved in biological functions defining the different stages of adipogenesis. Importantly, a subset of these dynamic CTS are gained at cell type-specific regulatory regions, in line with a requirement for CTCF in transcriptional induction of adipocyte differentiation. This relates to, at least in part, CTCF requirement for transcriptional activation of both the nuclear receptor peroxisome proliferator-activated receptor gamma (PPARG) and its target genes. Functionally, we show that CTCF interacts with TET methylcytosine dioxygenase (TET) enzymes and promotes adipogenic transcriptional enhancer DNA hydroxymethylation. Our study reveals a dynamic CTCF chromatin binding landscape required for epigenomic remodeling of enhancers and transcriptional activation driving cell differentiation.Lire moins >
Langue :
Anglais
Vulgarisation :
Non
Source :
Fichiers
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