A human liver cell-based system modeling ...
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Article dans une revue scientifique: Article original
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Title :
A human liver cell-based system modeling a clinical prognostic liver signature for therapeutic discovery
Author(s) :
Crouchet, Emilie [Auteur]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Bandiera, Simonetta [Auteur]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Fujiwara, Naoto [Auteur]
University of Texas Southwestern Medical Center [Dallas]
Li, Shen [Auteur]
Harvard Medical School [Boston] [HMS]
Massachusetts General Hospital [Boston]
El Saghire, Hussein [Auteur]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Fernández-Vaquero, Mirian [Auteur]
Universität Heidelberg [Heidelberg] = Heidelberg University
German Cancer Research Center - Deutsches Krebsforschungszentrum [Heidelberg] [DKFZ]
Riedl, Tobias [Auteur]
Universität Heidelberg [Heidelberg] = Heidelberg University
German Cancer Research Center - Deutsches Krebsforschungszentrum [Heidelberg] [DKFZ]
Sun, Xiaochen [Auteur]
University of Texas Southwestern Medical Center [Dallas]
Hirschfield, Hadassa [Auteur]
University of Texas Southwestern Medical Center [Dallas]
Jühling, Frank [Auteur]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Zhu, Shijia [Auteur]
University of Texas Southwestern Medical Center [Dallas]
Roehlen, Natascha [Auteur]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Ponsolles, Clara [Auteur]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Heydmann, Laura [Auteur]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Saviano, Antonio [Auteur]
Nouvel Hôpital Civil de Strasbourg
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Qian, Tongqi [Auteur]
University of Texas Southwestern Medical Center [Dallas]
Venkatesh, Anu [Auteur]
University of Texas Southwestern Medical Center [Dallas]
Lupberger, Joachim [Auteur]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Verrier, Eloi [Auteur]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Sojoodi, Mozhdeh [Auteur]
Harvard Medical School [Boston] [HMS]
Massachusetts General Hospital [Boston]
Oudot, Marine [Auteur]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Duong, François [Auteur]
University Hospital Basel [Basel]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Masia, Ricard [Auteur]
Massachusetts General Hospital [Boston]
Wei, Lan [Auteur]
Harvard Medical School [Boston] [HMS]
Massachusetts General Hospital [Boston]
Thumann, Christine [Auteur]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Durand, Sarah [Auteur]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
González-Motos, Victor [Auteur]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Heide, Danijela [Auteur]
German Cancer Research Center - Deutsches Krebsforschungszentrum [Heidelberg] [DKFZ]
Hetzer, Jenny [Auteur]
German Cancer Research Center - Deutsches Krebsforschungszentrum [Heidelberg] [DKFZ]
Nakagawa, Shigeki [Auteur]
University of Texas Southwestern Medical Center [Dallas]
Ono, Atsushi [Auteur]
Hiroshima University
Song, Won-Min [Auteur]
Icahn School of Medicine at Mount Sinai [New York] [MSSM]
Higashi, Takaaki [Auteur]
Kumamoto University
Sanchez, Roberto [Auteur]
Icahn School of Medicine at Mount Sinai [New York] [MSSM]
Kim, Rosa [Auteur]
Icahn School of Medicine at Mount Sinai [New York] [MSSM]
Bian, C. Billie [Auteur]
Icahn School of Medicine at Mount Sinai [New York] [MSSM]
Kiani, Karun [Auteur]
Broad Institute [Cambridge]
Harvard Medical School [Boston] [HMS]
Croonenborghs, Tom [Auteur]
Catholic University of Leuven = Katholieke Universiteit Leuven [KU Leuven]
Broad Institute [Cambridge]
Harvard Medical School [Boston] [HMS]
Subramanian, Aravind [Auteur]
Harvard Medical School [Boston] [HMS]
Chung, Raymond [Auteur]
Harvard Medical School [Boston] [HMS]
Massachusetts General Hospital [Boston]
Straub, Beate [Auteur]
Johannes Gutenberg - Universität Mainz = Johannes Gutenberg University [JGU]
Schuppan, Detlef [Auteur]
Harvard Medical School [Boston] [HMS]
University Medical Center of the Johannes Gutenberg-University Mainz
Ankavay, Maliki [Auteur]
Centre d’Infection et d’Immunité de Lille - INSERM U 1019 - UMR 9017 - UMR 8204 [CIIL]
Cocquerel, Laurence [Auteur]
Centre d’Infection et d’Immunité de Lille - INSERM U 1019 - UMR 9017 - UMR 8204 [CIIL]
Schaeffer, Evelyne [Auteur]
Immunopathologie et chimie thérapeutique [ICT]
Goossens, Nicolas [Auteur]
Geneva University Hospital [HUG]
Koh, Anna [Auteur]
University of Texas Southwestern Medical Center [Dallas]
Mahajan, Milind [Auteur]
Icahn School of Medicine at Mount Sinai [New York] [MSSM]
Nair, Venugopalan [Auteur]
Icahn School of Medicine at Mount Sinai [New York] [MSSM]
Gunasekaran, Ganesh [Auteur]
Icahn School of Medicine at Mount Sinai [New York] [MSSM]
Schwartz, Myron [Auteur]
Icahn School of Medicine at Mount Sinai [New York] [MSSM]
Bardeesy, Nabeel [Auteur]
Harvard Medical School [Boston] [HMS]
Shalek, Alex [Auteur]
Harvard University
Massachusetts Institute of Technology [MIT]
Broad Institute [Cambridge]
Rozenblatt-Rosen, Orit [Auteur]
Broad Institute [Cambridge]
Regev, Aviv [Auteur]
Massachusetts Institute of Technology [MIT]
Broad Institute [Cambridge]
Felli, Emanuele [Auteur]
Nouvel Hôpital Civil de Strasbourg
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Pessaux, Patrick [Auteur]
Nouvel Hôpital Civil de Strasbourg
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Tanabe, Kenneth [Auteur]
Harvard Medical School [Boston] [HMS]
Massachusetts General Hospital [Boston]
Heikenwälder, Mathias [Auteur]
German Cancer Research Center - Deutsches Krebsforschungszentrum [Heidelberg] [DKFZ]
Schuster, Catherine [Auteur]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Pochet, Nathalie [Auteur]
Broad Institute [Cambridge]
Harvard Medical School [Boston] [HMS]
Zeisel, Mirjam [Auteur]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Fuchs, Bryan [Auteur correspondant]
Harvard Medical School [Boston] [HMS]
Massachusetts General Hospital [Boston]
Hoshida, Yujin [Auteur correspondant]
University of Texas Southwestern Medical Center [Dallas]
Baumert, Thomas [Auteur correspondant]
Nouvel Hôpital Civil de Strasbourg
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Bandiera, Simonetta [Auteur]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Fujiwara, Naoto [Auteur]
University of Texas Southwestern Medical Center [Dallas]
Li, Shen [Auteur]
Harvard Medical School [Boston] [HMS]
Massachusetts General Hospital [Boston]
El Saghire, Hussein [Auteur]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Fernández-Vaquero, Mirian [Auteur]
Universität Heidelberg [Heidelberg] = Heidelberg University
German Cancer Research Center - Deutsches Krebsforschungszentrum [Heidelberg] [DKFZ]
Riedl, Tobias [Auteur]
Universität Heidelberg [Heidelberg] = Heidelberg University
German Cancer Research Center - Deutsches Krebsforschungszentrum [Heidelberg] [DKFZ]
Sun, Xiaochen [Auteur]
University of Texas Southwestern Medical Center [Dallas]
Hirschfield, Hadassa [Auteur]
University of Texas Southwestern Medical Center [Dallas]
Jühling, Frank [Auteur]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Zhu, Shijia [Auteur]
University of Texas Southwestern Medical Center [Dallas]
Roehlen, Natascha [Auteur]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Ponsolles, Clara [Auteur]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Heydmann, Laura [Auteur]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Saviano, Antonio [Auteur]
Nouvel Hôpital Civil de Strasbourg
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Qian, Tongqi [Auteur]
University of Texas Southwestern Medical Center [Dallas]
Venkatesh, Anu [Auteur]
University of Texas Southwestern Medical Center [Dallas]
Lupberger, Joachim [Auteur]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Verrier, Eloi [Auteur]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Sojoodi, Mozhdeh [Auteur]
Harvard Medical School [Boston] [HMS]
Massachusetts General Hospital [Boston]
Oudot, Marine [Auteur]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Duong, François [Auteur]
University Hospital Basel [Basel]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Masia, Ricard [Auteur]
Massachusetts General Hospital [Boston]
Wei, Lan [Auteur]
Harvard Medical School [Boston] [HMS]
Massachusetts General Hospital [Boston]
Thumann, Christine [Auteur]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Durand, Sarah [Auteur]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
González-Motos, Victor [Auteur]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Heide, Danijela [Auteur]
German Cancer Research Center - Deutsches Krebsforschungszentrum [Heidelberg] [DKFZ]
Hetzer, Jenny [Auteur]
German Cancer Research Center - Deutsches Krebsforschungszentrum [Heidelberg] [DKFZ]
Nakagawa, Shigeki [Auteur]
University of Texas Southwestern Medical Center [Dallas]
Ono, Atsushi [Auteur]
Hiroshima University
Song, Won-Min [Auteur]
Icahn School of Medicine at Mount Sinai [New York] [MSSM]
Higashi, Takaaki [Auteur]
Kumamoto University
Sanchez, Roberto [Auteur]
Icahn School of Medicine at Mount Sinai [New York] [MSSM]
Kim, Rosa [Auteur]
Icahn School of Medicine at Mount Sinai [New York] [MSSM]
Bian, C. Billie [Auteur]
Icahn School of Medicine at Mount Sinai [New York] [MSSM]
Kiani, Karun [Auteur]
Broad Institute [Cambridge]
Harvard Medical School [Boston] [HMS]
Croonenborghs, Tom [Auteur]
Catholic University of Leuven = Katholieke Universiteit Leuven [KU Leuven]
Broad Institute [Cambridge]
Harvard Medical School [Boston] [HMS]
Subramanian, Aravind [Auteur]
Harvard Medical School [Boston] [HMS]
Chung, Raymond [Auteur]
Harvard Medical School [Boston] [HMS]
Massachusetts General Hospital [Boston]
Straub, Beate [Auteur]
Johannes Gutenberg - Universität Mainz = Johannes Gutenberg University [JGU]
Schuppan, Detlef [Auteur]
Harvard Medical School [Boston] [HMS]
University Medical Center of the Johannes Gutenberg-University Mainz
Ankavay, Maliki [Auteur]
Centre d’Infection et d’Immunité de Lille - INSERM U 1019 - UMR 9017 - UMR 8204 [CIIL]
Cocquerel, Laurence [Auteur]
Centre d’Infection et d’Immunité de Lille - INSERM U 1019 - UMR 9017 - UMR 8204 [CIIL]
Schaeffer, Evelyne [Auteur]
Immunopathologie et chimie thérapeutique [ICT]
Goossens, Nicolas [Auteur]
Geneva University Hospital [HUG]
Koh, Anna [Auteur]
University of Texas Southwestern Medical Center [Dallas]
Mahajan, Milind [Auteur]
Icahn School of Medicine at Mount Sinai [New York] [MSSM]
Nair, Venugopalan [Auteur]
Icahn School of Medicine at Mount Sinai [New York] [MSSM]
Gunasekaran, Ganesh [Auteur]
Icahn School of Medicine at Mount Sinai [New York] [MSSM]
Schwartz, Myron [Auteur]
Icahn School of Medicine at Mount Sinai [New York] [MSSM]
Bardeesy, Nabeel [Auteur]
Harvard Medical School [Boston] [HMS]
Shalek, Alex [Auteur]
Harvard University
Massachusetts Institute of Technology [MIT]
Broad Institute [Cambridge]
Rozenblatt-Rosen, Orit [Auteur]
Broad Institute [Cambridge]
Regev, Aviv [Auteur]
Massachusetts Institute of Technology [MIT]
Broad Institute [Cambridge]
Felli, Emanuele [Auteur]
Nouvel Hôpital Civil de Strasbourg
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Pessaux, Patrick [Auteur]
Nouvel Hôpital Civil de Strasbourg
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Tanabe, Kenneth [Auteur]
Harvard Medical School [Boston] [HMS]
Massachusetts General Hospital [Boston]
Heikenwälder, Mathias [Auteur]
German Cancer Research Center - Deutsches Krebsforschungszentrum [Heidelberg] [DKFZ]
Schuster, Catherine [Auteur]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Pochet, Nathalie [Auteur]
Broad Institute [Cambridge]
Harvard Medical School [Boston] [HMS]
Zeisel, Mirjam [Auteur]
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Fuchs, Bryan [Auteur correspondant]
Harvard Medical School [Boston] [HMS]
Massachusetts General Hospital [Boston]
Hoshida, Yujin [Auteur correspondant]
University of Texas Southwestern Medical Center [Dallas]
Baumert, Thomas [Auteur correspondant]
Nouvel Hôpital Civil de Strasbourg
Institut de Recherche sur les Maladies Virales et Hépatiques [IVH]
Journal title :
Nature Communications
Pages :
5525
Publisher :
Nature Publishing Group
Publication date :
2021-09-17
ISSN :
2041-1723
HAL domain(s) :
Sciences du Vivant [q-bio]/Cancer
English abstract : [en]
Abstract Chronic liver disease and hepatocellular carcinoma (HCC) are life-threatening diseases with limited treatment options. The lack of clinically relevant/tractable experimental models hampers therapeutic discovery. ...
Show more >Abstract Chronic liver disease and hepatocellular carcinoma (HCC) are life-threatening diseases with limited treatment options. The lack of clinically relevant/tractable experimental models hampers therapeutic discovery. Here, we develop a simple and robust human liver cell-based system modeling a clinical prognostic liver signature (PLS) predicting long-term liver disease progression toward HCC. Using the PLS as a readout, followed by validation in nonalcoholic steatohepatitis/fibrosis/HCC animal models and patient-derived liver spheroids, we identify nizatidine, a histamine receptor H2 (HRH2) blocker, for treatment of advanced liver disease and HCC chemoprevention. Moreover, perturbation studies combined with single cell RNA-Seq analyses of patient liver tissues uncover hepatocytes and HRH2 + , CLEC5A high , MARCO low liver macrophages as potential nizatidine targets. The PLS model combined with single cell RNA-Seq of patient tissues enables discovery of urgently needed targets and therapeutics for treatment of advanced liver disease and cancer prevention.Show less >
Show more >Abstract Chronic liver disease and hepatocellular carcinoma (HCC) are life-threatening diseases with limited treatment options. The lack of clinically relevant/tractable experimental models hampers therapeutic discovery. Here, we develop a simple and robust human liver cell-based system modeling a clinical prognostic liver signature (PLS) predicting long-term liver disease progression toward HCC. Using the PLS as a readout, followed by validation in nonalcoholic steatohepatitis/fibrosis/HCC animal models and patient-derived liver spheroids, we identify nizatidine, a histamine receptor H2 (HRH2) blocker, for treatment of advanced liver disease and HCC chemoprevention. Moreover, perturbation studies combined with single cell RNA-Seq analyses of patient liver tissues uncover hepatocytes and HRH2 + , CLEC5A high , MARCO low liver macrophages as potential nizatidine targets. The PLS model combined with single cell RNA-Seq of patient tissues enables discovery of urgently needed targets and therapeutics for treatment of advanced liver disease and cancer prevention.Show less >
Language :
Anglais
Peer reviewed article :
Oui
Audience :
Internationale
Popular science :
Non
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