Title :

Spatial and Temporal Virus Load Dynamics of SARS-CoV-2: A Single-Center Cohort Study.

Author(s) :

Alidjinou, E. K. [Auteur]
Laboratoire de Virologie - ULR 3610 [Laboratoire de Virologie]
Poissy, Julien [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle (UGSF) - UMR 8576
Ouafi, M. [Auteur]
Laboratoire de Virologie - ULR 3610 [Laboratoire de Virologie]
Caplan, Morgan [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Benhalima, I. [Auteur]
Laboratoire de Virologie - ULR 3610 [Laboratoire de Virologie]
GOUTAY, Julien [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Tinez, C. [Auteur]
Laboratoire de Virologie - ULR 3610 [Laboratoire de Virologie]
Faure, Karine [Auteur]
Centre d'Infection et d'Immunité de Lille (CIIL) - U1019 - UMR 9017
Chopin, M. C. [Auteur]
Yelnik, C. [Auteur]
Lambert, Marc [Auteur]
Facteurs de risque et déterminants moléculaires des maladies liées au vieillissement (RID-AGE) - U1167
Hober, Didier [Auteur]
Laboratoire de virologie - ULR 3610
Pathogenèse virale du diabète de type 1 - ULR 3610
Preau, Sebastien [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle - UMR 8576 [UGSF]
Nseir, Saad [Auteur]
Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle (UGSF) - UMR 8576
Engelmann, I. [Auteur]
Lebuffe, Gilles [Auteur]
Groupe de Recherche sur les formes Injectables et les Technologies Associées (GRITA) - ULR 7365

Journal title :

Diagnostics (Basel)

Abbreviated title :

Diagnostics (Basel)

Volume number :

11

Publication date :

2021-04-07

ISSN :

2075-4418

English keyword(s) :

COVID-19
SARS-CoV-2
viral shedding
molecular diagnostics
RT-PCR

HAL domain(s) :

Sciences du Vivant [q-bio]

English abstract : [en]

The severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) has caused an ongoing pandemic. Reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) is the gold standard for the detection of SARS-CoV-2 and has been ...
Show more >The severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) has caused an ongoing pandemic. Reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) is the gold standard for the detection of SARS-CoV-2 and has been applied to different specimen types. Understanding the virus load and virus detection frequency in different specimen types is important to improve diagnosis and estimate the duration of potential infectivity. We conducted a retrospective single-center cohort study on hospitalized and outpatients with SARS-CoV-2 infection. We analyzed the frequency of virus detection, virus load, and duration of the virus excretion in upper and lower respiratory specimens as well as stool and plasma. We found that the frequency of SARS-CoV-2 detection, the virus load, and duration of virus excretion was higher in lower respiratory tract (LRT) than in upper respiratory tract (URT) specimens. The duration of virus excretion was longer in patients requiring intensive care unit (ICU) admission. In conclusion, LRT specimens are the most appropriate specimen type for the detection and follow-up of SARS-CoV-2 infection. Duration of virus excretion is longer in severe cases of SARS-CoV-2 infection.Show less >

Language :

Anglais

Audience :

Internationale

Popular science :

Non

Administrative institution(s) :

Université de Lille
CHU Lille

Collections :

• Centre d'Infection et d'Immunité de Lille (CIIL) - U1019 - UMR 9017
• Facteurs de risque et déterminants moléculaires des maladies liées au vieillissement (RID-AGE) - U1167
• Groupe de Recherche sur les formes Injectables et les Technologies Associées (GRITA) - ULR 7365
• Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle (UGSF) - UMR 8576

Research team(s) :

Glycobiology in fungal Pathogenesis and Clinical Applications

Submission date :

2023-05-25T03:10:51Z
2024-03-01T13:43:50Z
2024-03-05T09:18:19Z