Multiomic analysis of malignant pleural ...
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Compte-rendu et recension critique d'ouvrage
PMID :
Titre :
Multiomic analysis of malignant pleural mesothelioma identifies molecular axes and specialized tumor profiles driving intertumor heterogeneity
Auteur(s) :
Mangiante, Lise [Auteur]
Centre International de Recherche contre le Cancer - International Agency for Research on Cancer [CIRC - IARC]
Stanford University
Alcala, Nicolas [Auteur]
Centre International de Recherche contre le Cancer - International Agency for Research on Cancer [CIRC - IARC]
Sexton-Oates, Alexandra [Auteur]
Centre International de Recherche contre le Cancer - International Agency for Research on Cancer [CIRC - IARC]
Di Genova, Alex [Auteur]
Centre International de Recherche contre le Cancer - International Agency for Research on Cancer [CIRC - IARC]
Universidad de O'Higgins [UOH]
Centre de modélisation mathématique / Centro de Modelamiento Matemático [Santiago] [CMM]
Gonzalez-Perez, Abel [Auteur]
Barcelona Institute of Science and Technology [BIST]
Instituto de Salud Carlos III [Madrid] [ISC]
Khandekar, Azhar [Auteur]
University of California [San Diego] [UC San Diego]
Bergstrom, Erik [Auteur]
University of California [San Diego] [UC San Diego]
Kim, Jaehee [Auteur]
Stanford University
Cornell University [New York]
Liu, Xiran [Auteur]
Stanford University
Blazquez-Encinas, Ricardo [Auteur]
Universidad de Córdoba = University of Córdoba [Córdoba]
Instituto Maimonides de Investigación Biomédica de Cordoba [IMIBIC]
Hospital Universitario Reina Sofía de Córdoba
Giacobi, Colin [Auteur]
Centre International de Recherche contre le Cancer - International Agency for Research on Cancer [CIRC - IARC]
Le Stang, Nolwenn [Auteur]
Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon [UNICANCER/CRCL]
Centre Léon Bérard [Lyon]
Boyault, Sandrine [Auteur]
Centre Léon Bérard [Lyon]
Cuenin, Cyrille [Auteur]
Centre International de Recherche contre le Cancer - International Agency for Research on Cancer [CIRC - IARC]
Tabone-Eglinger, Severine [Auteur]
Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon [UNICANCER/CRCL]
Centre Léon Bérard [Lyon]
Damiola, Francesca [Auteur]
Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon [UNICANCER/CRCL]
Centre Léon Bérard [Lyon]
Voegele, Catherine [Auteur]
Centre International de Recherche contre le Cancer - International Agency for Research on Cancer [CIRC - IARC]
Ardin, Maude [Auteur]
Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon [UNICANCER/CRCL]
Michallet, Marie-Cécile [Auteur]
Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon [UNICANCER/CRCL]
Soudade, Lorraine [Auteur]
Centre International de Recherche contre le Cancer - International Agency for Research on Cancer [CIRC - IARC]
Delhomme, Tiffany [Auteur]
Centre International de Recherche contre le Cancer - International Agency for Research on Cancer [CIRC - IARC]
Poret, Arnaud [Auteur]
Centre International de Recherche contre le Cancer - International Agency for Research on Cancer [CIRC - IARC]
Brevet, Marie [Auteur]
Cypath and Cypath-rb [Villeurbanne] [2C]
Copin, Marie-Christine [Auteur]
Tumorothèque du Centre de Référence Régional en Cancérologie [CHRU Lille] [T-C2RC]
Giusiano-Courcambeck, Sophie [Auteur]
Hôpital Nord [CHU - APHM]
Damotte, Diane [Auteur]
Centre de Recherche des Cordeliers [CRC (UMR_S_1138 / U1138)]
Girard, Cecile [Auteur]
Centre Hospitalier Universitaire de Nantes = Nantes University Hospital [CHU Nantes]
Hofman, Veronique [Auteur]
FHU OncoAge - Pathologies liées à l’âge [CHU Nice] [OncoAge]
Université Côte d'Azur [UniCA]
Institut de Recherche sur le Cancer et le Vieillissement [IRCAN]
Centre Hospitalier Universitaire de Nice [CHU Nice]
Hofman, Paul [Auteur]
FHU OncoAge - Pathologies liées à l’âge [CHU Nice] [OncoAge]
Université Côte d'Azur [UniCA]
Institut de Recherche sur le Cancer et le Vieillissement [IRCAN]
Centre Hospitalier Universitaire de Nice [CHU Nice]
Mouroux, Jérôme [Auteur]
FHU OncoAge - Pathologies liées à l’âge [CHU Nice] [OncoAge]
Université Côte d'Azur [UniCA]
Institut de Recherche sur le Cancer et le Vieillissement [IRCAN]
Centre Hospitalier Universitaire de Nice [CHU Nice]
Cohen, Charlotte [Auteur]
FHU OncoAge - Pathologies liées à l’âge [CHU Nice] [OncoAge]
Hôpital Pasteur [Nice] [CHU]
Lacomme, Stephanie [Auteur]
Nutrition-Génétique et Exposition aux Risques Environnementaux [NGERE]
Centre de Ressources Biologiques - [Nancy] [CRB Nancy]
Mazieres, Julien [Auteur]
Université Toulouse III - Paul Sabatier [UT3]
Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse [CHU Toulouse]
de Montpreville, Vincent Thomas [Auteur]
Hôpital Marie-Lannelongue
Perrin, Corinne [Auteur]
Planchard, Gaetane [Auteur]
Rousseau, Nathalie [Auteur]
Rouquette, Isabelle [Auteur]
Service Anatomie et cytologie pathologiques [CHU Toulouse]
Sagan, Christine [Auteur]
Scherpereel, Arnaud [Auteur]
Thérapies Laser Assistées par l'Image pour l'Oncologie - U 1189 [ONCO-THAI]
Thivolet, Francoise [Auteur]
Vignaud, Jean-Michel [Auteur]
Centre de Ressources Biologiques - [Nancy] [CRB Nancy]
Jean, Didier [Auteur]
Centre de Recherche des Cordeliers [CRC (UMR_S_1138 / U1138)]
Ilg, Anabelle Gilg Soit [Auteur]
Santé publique France - French National Public Health Agency [Saint-Maurice, France]
Olaso, Robert [Auteur]
Centre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
Meyer, Vincent [Auteur]
Centre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
Boland-Auge, Anne [Auteur]
Centre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
Deleuze, Jean-Francois [Auteur]
Centre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
Altmuller, Janine [Auteur]
Cologne Center for Genomics [Cologne] [CCG]
Nuernberg, Peter [Auteur]
Cologne Center for Genomics [Cologne] [CCG]
Ibáñez-Costa, Alejandro [Auteur]
Instituto Maimonides de Investigación Biomédica de Cordoba [IMIBIC]
Universidad de Córdoba = University of Córdoba [Córdoba]
Castaño, Justo [Auteur]
Instituto Maimonides de Investigación Biomédica de Cordoba [IMIBIC]
Universidad de Córdoba = University of Córdoba [Córdoba]
Lantuejoul, Sylvie [Auteur]
Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon [UNICANCER/CRCL]
Université Grenoble Alpes [UGA]
Ghantous, Akram [Auteur]
Centre International de Recherche contre le Cancer - International Agency for Research on Cancer [CIRC - IARC]
Maussion, Charles [Auteur]
Owkin, Inc. [New York, NY, États-Unis]
Courtiol, Pierre [Auteur]
Owkin, Inc. [New York, NY, États-Unis]
Hernandez-Vargas, Hector [Auteur]
Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon [UNICANCER/CRCL]
Caux, Christophe [Auteur]
Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon [UNICANCER/CRCL]
Girard, Nicolas [Auteur]
Institut Curie [Paris]
Institut Mutualiste de Montsouris [IMM]
Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines [UVSQ]
Université Paris-Saclay
Lopez-Bigas, Nuria [Auteur]
Barcelona Institute of Science and Technology [BIST]
Instituto de Salud Carlos III [Madrid] [ISC]
Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats = Catalan Institution for Research and Advanced Studies [ICREA]
Alexandrov, Ludmil [Auteur]
University of California [San Diego] [UC San Diego]
Galateau-Salle, Françoise [Auteur]
Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon [UNICANCER/CRCL]
Foll, Matthieu [Auteur]
Centre International de Recherche contre le Cancer - International Agency for Research on Cancer [CIRC - IARC]
Fernandez-Cuesta, Lynnette [Auteur]
Centre International de Recherche contre le Cancer - International Agency for Research on Cancer [CIRC - IARC]
Centre International de Recherche contre le Cancer - International Agency for Research on Cancer [CIRC - IARC]
Stanford University
Alcala, Nicolas [Auteur]
Centre International de Recherche contre le Cancer - International Agency for Research on Cancer [CIRC - IARC]
Sexton-Oates, Alexandra [Auteur]
Centre International de Recherche contre le Cancer - International Agency for Research on Cancer [CIRC - IARC]
Di Genova, Alex [Auteur]
Centre International de Recherche contre le Cancer - International Agency for Research on Cancer [CIRC - IARC]
Universidad de O'Higgins [UOH]
Centre de modélisation mathématique / Centro de Modelamiento Matemático [Santiago] [CMM]
Gonzalez-Perez, Abel [Auteur]
Barcelona Institute of Science and Technology [BIST]
Instituto de Salud Carlos III [Madrid] [ISC]
Khandekar, Azhar [Auteur]
University of California [San Diego] [UC San Diego]
Bergstrom, Erik [Auteur]
University of California [San Diego] [UC San Diego]
Kim, Jaehee [Auteur]
Stanford University
Cornell University [New York]
Liu, Xiran [Auteur]
Stanford University
Blazquez-Encinas, Ricardo [Auteur]
Universidad de Córdoba = University of Córdoba [Córdoba]
Instituto Maimonides de Investigación Biomédica de Cordoba [IMIBIC]
Hospital Universitario Reina Sofía de Córdoba
Giacobi, Colin [Auteur]
Centre International de Recherche contre le Cancer - International Agency for Research on Cancer [CIRC - IARC]
Le Stang, Nolwenn [Auteur]
Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon [UNICANCER/CRCL]
Centre Léon Bérard [Lyon]
Boyault, Sandrine [Auteur]
Centre Léon Bérard [Lyon]
Cuenin, Cyrille [Auteur]
Centre International de Recherche contre le Cancer - International Agency for Research on Cancer [CIRC - IARC]
Tabone-Eglinger, Severine [Auteur]
Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon [UNICANCER/CRCL]
Centre Léon Bérard [Lyon]
Damiola, Francesca [Auteur]
Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon [UNICANCER/CRCL]
Centre Léon Bérard [Lyon]
Voegele, Catherine [Auteur]
Centre International de Recherche contre le Cancer - International Agency for Research on Cancer [CIRC - IARC]
Ardin, Maude [Auteur]
Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon [UNICANCER/CRCL]
Michallet, Marie-Cécile [Auteur]
Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon [UNICANCER/CRCL]
Soudade, Lorraine [Auteur]
Centre International de Recherche contre le Cancer - International Agency for Research on Cancer [CIRC - IARC]
Delhomme, Tiffany [Auteur]
Centre International de Recherche contre le Cancer - International Agency for Research on Cancer [CIRC - IARC]
Poret, Arnaud [Auteur]
Centre International de Recherche contre le Cancer - International Agency for Research on Cancer [CIRC - IARC]
Brevet, Marie [Auteur]
Cypath and Cypath-rb [Villeurbanne] [2C]
Copin, Marie-Christine [Auteur]
Tumorothèque du Centre de Référence Régional en Cancérologie [CHRU Lille] [T-C2RC]
Giusiano-Courcambeck, Sophie [Auteur]
Hôpital Nord [CHU - APHM]
Damotte, Diane [Auteur]
Centre de Recherche des Cordeliers [CRC (UMR_S_1138 / U1138)]
Girard, Cecile [Auteur]
Centre Hospitalier Universitaire de Nantes = Nantes University Hospital [CHU Nantes]
Hofman, Veronique [Auteur]
FHU OncoAge - Pathologies liées à l’âge [CHU Nice] [OncoAge]
Université Côte d'Azur [UniCA]
Institut de Recherche sur le Cancer et le Vieillissement [IRCAN]
Centre Hospitalier Universitaire de Nice [CHU Nice]
Hofman, Paul [Auteur]
FHU OncoAge - Pathologies liées à l’âge [CHU Nice] [OncoAge]
Université Côte d'Azur [UniCA]
Institut de Recherche sur le Cancer et le Vieillissement [IRCAN]
Centre Hospitalier Universitaire de Nice [CHU Nice]
Mouroux, Jérôme [Auteur]
FHU OncoAge - Pathologies liées à l’âge [CHU Nice] [OncoAge]
Université Côte d'Azur [UniCA]
Institut de Recherche sur le Cancer et le Vieillissement [IRCAN]
Centre Hospitalier Universitaire de Nice [CHU Nice]
Cohen, Charlotte [Auteur]
FHU OncoAge - Pathologies liées à l’âge [CHU Nice] [OncoAge]
Hôpital Pasteur [Nice] [CHU]
Lacomme, Stephanie [Auteur]
Nutrition-Génétique et Exposition aux Risques Environnementaux [NGERE]
Centre de Ressources Biologiques - [Nancy] [CRB Nancy]
Mazieres, Julien [Auteur]
Université Toulouse III - Paul Sabatier [UT3]
Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse [CHU Toulouse]
de Montpreville, Vincent Thomas [Auteur]
Hôpital Marie-Lannelongue
Perrin, Corinne [Auteur]
Planchard, Gaetane [Auteur]
Rousseau, Nathalie [Auteur]
Rouquette, Isabelle [Auteur]
Service Anatomie et cytologie pathologiques [CHU Toulouse]
Sagan, Christine [Auteur]
Scherpereel, Arnaud [Auteur]
Thérapies Laser Assistées par l'Image pour l'Oncologie - U 1189 [ONCO-THAI]
Thivolet, Francoise [Auteur]
Vignaud, Jean-Michel [Auteur]
Centre de Ressources Biologiques - [Nancy] [CRB Nancy]
Jean, Didier [Auteur]
Centre de Recherche des Cordeliers [CRC (UMR_S_1138 / U1138)]
Ilg, Anabelle Gilg Soit [Auteur]
Santé publique France - French National Public Health Agency [Saint-Maurice, France]
Olaso, Robert [Auteur]
Centre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
Meyer, Vincent [Auteur]
Centre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
Boland-Auge, Anne [Auteur]
Centre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
Deleuze, Jean-Francois [Auteur]
Centre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
Altmuller, Janine [Auteur]
Cologne Center for Genomics [Cologne] [CCG]
Nuernberg, Peter [Auteur]
Cologne Center for Genomics [Cologne] [CCG]
Ibáñez-Costa, Alejandro [Auteur]
Instituto Maimonides de Investigación Biomédica de Cordoba [IMIBIC]
Universidad de Córdoba = University of Córdoba [Córdoba]
Castaño, Justo [Auteur]
Instituto Maimonides de Investigación Biomédica de Cordoba [IMIBIC]
Universidad de Córdoba = University of Córdoba [Córdoba]
Lantuejoul, Sylvie [Auteur]
Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon [UNICANCER/CRCL]
Université Grenoble Alpes [UGA]
Ghantous, Akram [Auteur]
Centre International de Recherche contre le Cancer - International Agency for Research on Cancer [CIRC - IARC]
Maussion, Charles [Auteur]
Owkin, Inc. [New York, NY, États-Unis]
Courtiol, Pierre [Auteur]
Owkin, Inc. [New York, NY, États-Unis]
Hernandez-Vargas, Hector [Auteur]
Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon [UNICANCER/CRCL]
Caux, Christophe [Auteur]
Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon [UNICANCER/CRCL]
Girard, Nicolas [Auteur]
Institut Curie [Paris]
Institut Mutualiste de Montsouris [IMM]
Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines [UVSQ]
Université Paris-Saclay
Lopez-Bigas, Nuria [Auteur]
Barcelona Institute of Science and Technology [BIST]
Instituto de Salud Carlos III [Madrid] [ISC]
Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats = Catalan Institution for Research and Advanced Studies [ICREA]
Alexandrov, Ludmil [Auteur]
University of California [San Diego] [UC San Diego]
Galateau-Salle, Françoise [Auteur]
Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon [UNICANCER/CRCL]
Foll, Matthieu [Auteur]
Centre International de Recherche contre le Cancer - International Agency for Research on Cancer [CIRC - IARC]
Fernandez-Cuesta, Lynnette [Auteur]
Centre International de Recherche contre le Cancer - International Agency for Research on Cancer [CIRC - IARC]
Titre de la revue :
Nature Genetics
Pagination :
607-618
Éditeur :
Nature Publishing Group
Date de publication :
2023-03-16
ISSN :
1061-4036
Discipline(s) HAL :
Sciences du Vivant [q-bio]
Résumé en anglais : [en]
Abstract Malignant pleural mesothelioma (MPM) is an aggressive cancer with rising incidence and challenging clinical management. Through a large series of whole-genome sequencing data, integrated with transcriptomic and ...
Lire la suite >Abstract Malignant pleural mesothelioma (MPM) is an aggressive cancer with rising incidence and challenging clinical management. Through a large series of whole-genome sequencing data, integrated with transcriptomic and epigenomic data using multiomics factor analysis, we demonstrate that the current World Health Organization classification only accounts for up to 10% of interpatient molecular differences. Instead, the MESOMICS project paves the way for a morphomolecular classification of MPM based on four dimensions: ploidy, tumor cell morphology, adaptive immune response and CpG island methylator profile. We show that these four dimensions are complementary, capture major interpatient molecular differences and are delimited by extreme phenotypes that—in the case of the interdependent tumor cell morphology and adapted immune response—reflect tumor specialization. These findings unearth the interplay between MPM functional biology and its genomic history, and provide insights into the variations observed in the clinical behavior of patients with MPM.Lire moins >
Lire la suite >Abstract Malignant pleural mesothelioma (MPM) is an aggressive cancer with rising incidence and challenging clinical management. Through a large series of whole-genome sequencing data, integrated with transcriptomic and epigenomic data using multiomics factor analysis, we demonstrate that the current World Health Organization classification only accounts for up to 10% of interpatient molecular differences. Instead, the MESOMICS project paves the way for a morphomolecular classification of MPM based on four dimensions: ploidy, tumor cell morphology, adaptive immune response and CpG island methylator profile. We show that these four dimensions are complementary, capture major interpatient molecular differences and are delimited by extreme phenotypes that—in the case of the interdependent tumor cell morphology and adapted immune response—reflect tumor specialization. These findings unearth the interplay between MPM functional biology and its genomic history, and provide insights into the variations observed in the clinical behavior of patients with MPM.Lire moins >
Langue :
Anglais
Vulgarisation :
Non
Source :
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