Identification of cell wall proteins in ...
Type de document :
Compte-rendu et recension critique d'ouvrage
DOI :
Titre :
Identification of cell wall proteins in the flax (Linum usitatissimum) stem
Auteur(s) :
Day, Arnaud [Auteur]
Stress Abiotiques et Différenciation des Végétaux Cultivés [SADV]
Centre National de la Recherche Scientifique [CNRS]
Fenart, Stephane [Auteur]
Stress Abiotiques et Différenciation des Végétaux Cultivés [SADV]
Centre National de la Recherche Scientifique [CNRS]
Neutelings, Godfrey [Auteur]
Stress Abiotiques et Différenciation des Végétaux Cultivés [SADV]
Centre National de la Recherche Scientifique [CNRS]
Hawkins, Simon [Auteur]
Stress Abiotiques et Différenciation des Végétaux Cultivés [SADV]
Centre National de la Recherche Scientifique [CNRS]
Rolando, Christian [Auteur]
Université de Lille, Sciences et Technologies
Centre National de la Recherche Scientifique [CNRS]
Miniaturisation pour la Synthèse, l’Analyse et la Protéomique - UAR 3290 [MSAP]
Tokarski, Caroline [Auteur]
Université de Lille, Sciences et Technologies
Centre National de la Recherche Scientifique [CNRS]
Miniaturisation pour la Synthèse, l’Analyse et la Protéomique - UAR 3290 [MSAP]
![refId](/themes/Mirage2//images/idref.png)
Stress Abiotiques et Différenciation des Végétaux Cultivés [SADV]
Centre National de la Recherche Scientifique [CNRS]
Fenart, Stephane [Auteur]
Stress Abiotiques et Différenciation des Végétaux Cultivés [SADV]
Centre National de la Recherche Scientifique [CNRS]
Neutelings, Godfrey [Auteur]
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Stress Abiotiques et Différenciation des Végétaux Cultivés [SADV]
Centre National de la Recherche Scientifique [CNRS]
Hawkins, Simon [Auteur]
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Stress Abiotiques et Différenciation des Végétaux Cultivés [SADV]
Centre National de la Recherche Scientifique [CNRS]
Rolando, Christian [Auteur]
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Université de Lille, Sciences et Technologies
Centre National de la Recherche Scientifique [CNRS]
Miniaturisation pour la Synthèse, l’Analyse et la Protéomique - UAR 3290 [MSAP]
Tokarski, Caroline [Auteur]
Université de Lille, Sciences et Technologies
Centre National de la Recherche Scientifique [CNRS]
Miniaturisation pour la Synthèse, l’Analyse et la Protéomique - UAR 3290 [MSAP]
Titre de la revue :
Proteomics
Pagination :
812 - 825
Éditeur :
Wiley-VCH Verlag
Date de publication :
2013
ISSN :
1615-9853
Mot(s)-clé(s) :
Flax
Plant proteomics
PROTEOMICS
L.
Plant proteomics
PROTEOMICS
L.
Mot(s)-clé(s) en anglais :
Cell wall
FT-ICR high resolution MS
PLANT GLYCOSIDE HYDROLASES
GERMIN-LIKE PROTEIN
PECTIN METHYLESTERASE
ARABIDOPSIS-THALIANA
PHYSIOLOGICAL ROLES
ELONGATING CELLS
BAST FIBERS
PEROXIDASE
FT-ICR high resolution MS
PLANT GLYCOSIDE HYDROLASES
GERMIN-LIKE PROTEIN
PECTIN METHYLESTERASE
ARABIDOPSIS-THALIANA
PHYSIOLOGICAL ROLES
ELONGATING CELLS
BAST FIBERS
PEROXIDASE
Discipline(s) HAL :
Sciences du Vivant [q-bio]
Sciences du Vivant [q-bio]/Biologie végétale
Sciences du Vivant [q-bio]/Biologie végétale
Résumé en anglais : [en]
Sequential salt (CaCl2, LiCl) extractions were used to obtain fractions enriched in cell wall proteins (CWPs) from the stem of 60-day-old flax (Linum usitatissimum) plants. High-resolution FT-ICR MS analysis and the use ...
Lire la suite >Sequential salt (CaCl2, LiCl) extractions were used to obtain fractions enriched in cell wall proteins (CWPs) from the stem of 60-day-old flax (Linum usitatissimum) plants. High-resolution FT-ICR MS analysis and the use of recently published genomic data allowed the identification of 11912 peptides corresponding to a total of 1418 different proteins. Subcellular localization using TargetP, Predotar, and WoLF PSORT led to the identification of 152 putative flax CWPs that were classified into nine different functional classes previously established for Arabidopsis thaliana. Examination of different functional classes revealed the presence of a number of proteins known to be involved in, or potentially involved in cell-wall metabolism in plants. The flax stem cell wall proteome was also compared with transcriptomic data previously obtained on comparable samples. This study represents a major contribution to the identification of CWPs in flax and will lead to a better understanding of cell wall biology in this species.Lire moins >
Lire la suite >Sequential salt (CaCl2, LiCl) extractions were used to obtain fractions enriched in cell wall proteins (CWPs) from the stem of 60-day-old flax (Linum usitatissimum) plants. High-resolution FT-ICR MS analysis and the use of recently published genomic data allowed the identification of 11912 peptides corresponding to a total of 1418 different proteins. Subcellular localization using TargetP, Predotar, and WoLF PSORT led to the identification of 152 putative flax CWPs that were classified into nine different functional classes previously established for Arabidopsis thaliana. Examination of different functional classes revealed the presence of a number of proteins known to be involved in, or potentially involved in cell-wall metabolism in plants. The flax stem cell wall proteome was also compared with transcriptomic data previously obtained on comparable samples. This study represents a major contribution to the identification of CWPs in flax and will lead to a better understanding of cell wall biology in this species.Lire moins >
Langue :
Anglais
Vulgarisation :
Non
Source :
Fichiers
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