Mycobacterium tuberculosis genetic features ...
Type de document :
Compte-rendu et recension critique d'ouvrage
PMID :
Titre :
Mycobacterium tuberculosis genetic features associated with pulmonary tuberculosis severity
Auteur(s) :
Genestet, Charlotte [Auteur]
Centre International de Recherche en Infectiologie [CIRI]
Hospices Civils de Lyon [HCL]
Institut des Agents Infectieux [Lyon] [IAI]
Refrégier, Guislaine [Auteur]
Ecologie Systématique et Evolution [ESE]
Institut de Biologie Intégrative de la Cellule [I2BC]
Hodille, Elisabeth [Auteur]
Centre International de Recherche en Infectiologie [CIRI]
Institut des Agents Infectieux [Lyon] [IAI]
Hospices Civils de Lyon [HCL]
Zein-Eddine, Rima [Auteur]
Ecologie Systématique et Evolution [ESE]
Institut de Biologie Intégrative de la Cellule [I2BC]
Meur, Adrien [Auteur]
Ecologie Systématique et Evolution [ESE]
Institut de Biologie Intégrative de la Cellule [I2BC]
Hak, Fiona [Auteur]
Ecologie Systématique et Evolution [ESE]
Institut de Biologie Intégrative de la Cellule [I2BC]
Barbry, Alexia [Auteur]
Centre International de Recherche en Infectiologie [CIRI]
Institut des Agents Infectieux [Lyon] [IAI]
Hospices Civils de Lyon [HCL]
Westeel, Emilie [Auteur]
Laboratoire des Pathogènes Emergents
Fondation Mérieux
Berland, Jean-Luc [Auteur]
Laboratoire des Pathogènes Emergents
Fondation Mérieux
Engelmann, Astrid [Auteur]
Centre Hospitalier Fleyriat [Bourg en Bresse] [CHBBF]
Verdier, Isabelle [Auteur]
Centre Hospitalier Fleyriat [Bourg en Bresse] [CHBBF]
Lina, Gérard [Auteur]
Centre International de Recherche en Infectiologie [CIRI]
Institut des Agents Infectieux [Lyon] [IAI]
Hospices Civils de Lyon [HCL]
Université Claude Bernard Lyon 1 [UCBL]
Ader, Florence [Auteur]
Centre International de Recherche en Infectiologie [CIRI]
Institut des Agents Infectieux [Lyon] [IAI]
Hospices Civils de Lyon [HCL]
Dray, Stéphane [Auteur]
Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 [LBBE]
Jacob, Laurent [Auteur]
Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 [LBBE]
Massol, Francois [Auteur]
Centre d’Infection et d’Immunité de Lille - INSERM U 1019 - UMR 9017 - UMR 8204 [CIIL]
Évolution, Écologie et Paléontologie (Evo-Eco-Paleo) - UMR 8198 [Evo-Eco-Paléo (EEP)]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Venner, Samuel [Auteur]
Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 [LBBE]
Dumitrescu, Oana [Auteur]
Centre International de Recherche en Infectiologie [CIRI]
Institut des Agents Infectieux [Lyon] [IAI]
Hospices Civils de Lyon [HCL]
Université Claude Bernard Lyon 1 [UCBL]
Centre International de Recherche en Infectiologie [CIRI]
Hospices Civils de Lyon [HCL]
Institut des Agents Infectieux [Lyon] [IAI]
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Institut de Biologie Intégrative de la Cellule [I2BC]
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Ecologie Systématique et Evolution [ESE]
Institut de Biologie Intégrative de la Cellule [I2BC]
Meur, Adrien [Auteur]
Ecologie Systématique et Evolution [ESE]
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Barbry, Alexia [Auteur]
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Berland, Jean-Luc [Auteur]
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Fondation Mérieux
Engelmann, Astrid [Auteur]
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Verdier, Isabelle [Auteur]
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Dray, Stéphane [Auteur]
Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 [LBBE]
Jacob, Laurent [Auteur]
Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 [LBBE]
Massol, Francois [Auteur]
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Venner, Samuel [Auteur]
Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 [LBBE]
Dumitrescu, Oana [Auteur]
Centre International de Recherche en Infectiologie [CIRI]
Institut des Agents Infectieux [Lyon] [IAI]
Hospices Civils de Lyon [HCL]
Université Claude Bernard Lyon 1 [UCBL]
Titre de la revue :
International Journal of Infectious Diseases
Pagination :
74-83
Éditeur :
Elsevier
Date de publication :
2022-10
ISSN :
1201-9712
Mot(s)-clé(s) en anglais :
Genetic heterogeneity
Genome-wide association study
Mycobacterium tuberculosis
Pulmonary tuberculosis
Structural equation modeling
Whole genome sequencing
Genome-wide association study
Mycobacterium tuberculosis
Pulmonary tuberculosis
Structural equation modeling
Whole genome sequencing
Discipline(s) HAL :
Sciences du Vivant [q-bio]/Immunologie
Sciences du Vivant [q-bio]/Santé publique et épidémiologie
Sciences du Vivant [q-bio]/Santé publique et épidémiologie
Résumé en anglais : [en]
Objective: Mycobacterium tuberculosis (Mtb) infections result in a wide spectrum of clinical presentations but without proven Mtb genetic determinants. Herein, we hypothesised that genetic features of Mtb clinical isolates, ...
Lire la suite >Objective: Mycobacterium tuberculosis (Mtb) infections result in a wide spectrum of clinical presentations but without proven Mtb genetic determinants. Herein, we hypothesised that genetic features of Mtb clinical isolates, such as specific polymorphisms or micro-diversity, may be linked to tuberculosis (TB) severity.Methods: 234 pulmonary TB patients (including 193 drug-susceptible and 14 mono-resistant cases diagnosed between 2017 and 2020 and 27 multidrug-resistant cases diagnosed between 2010 and 2020) were stratified according to TB disease severity and Mtb genetic features were explored using whole genome sequencing, including heterologous single nucleotide polymorphism (SNP) calling to explore micro-diversity. Finally, we performed a structural equation modelling (SEM) analysis to relate TB severity to Mtb genetic features.Results: Clinical isolates from patients with mild TB carried mutations in genes associated with host-pathogen interaction, while those from patients with moderate/severe TB carried mutations associated with regulatory mechanisms. Genome-wide association study identified a SNP in the promoter of the gene coding for the virulence regulator EspR statistically associated with moderate/severe disease. SEM and model comparisons indicated that TB severity was associated with the detection of Mtb micro-diversity within clinical isolates and to the espR SNP.Conclusions: Taken together, these results provide a new insight to better understand TB pathophysiology and could provide new prognosis tool for pulmonary TB severity.Lire moins >
Lire la suite >Objective: Mycobacterium tuberculosis (Mtb) infections result in a wide spectrum of clinical presentations but without proven Mtb genetic determinants. Herein, we hypothesised that genetic features of Mtb clinical isolates, such as specific polymorphisms or micro-diversity, may be linked to tuberculosis (TB) severity.Methods: 234 pulmonary TB patients (including 193 drug-susceptible and 14 mono-resistant cases diagnosed between 2017 and 2020 and 27 multidrug-resistant cases diagnosed between 2010 and 2020) were stratified according to TB disease severity and Mtb genetic features were explored using whole genome sequencing, including heterologous single nucleotide polymorphism (SNP) calling to explore micro-diversity. Finally, we performed a structural equation modelling (SEM) analysis to relate TB severity to Mtb genetic features.Results: Clinical isolates from patients with mild TB carried mutations in genes associated with host-pathogen interaction, while those from patients with moderate/severe TB carried mutations associated with regulatory mechanisms. Genome-wide association study identified a SNP in the promoter of the gene coding for the virulence regulator EspR statistically associated with moderate/severe disease. SEM and model comparisons indicated that TB severity was associated with the detection of Mtb micro-diversity within clinical isolates and to the espR SNP.Conclusions: Taken together, these results provide a new insight to better understand TB pathophysiology and could provide new prognosis tool for pulmonary TB severity.Lire moins >
Langue :
Anglais
Vulgarisation :
Non
Source :
Fichiers
- https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03836738/document
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