Title :

Clinical phenotypes and outcomes associated with SARS-CoV-2 variant Omicron in critically ill French patients with COVID-19

Author(s) :

de Prost, Nicolas [Auteur]
CHU Henri Mondor [Créteil]
Groupe de recherche clinique CARMAS (Cardiovascular and Respiratory Manifestations of Acute lung injury and Sepsis) [CARMAS]
Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 [UPEC UP12]
Audureau, Etienne [Auteur]
Institut Mondor de Recherche Biomédicale [IMRB]
Hôpital Henri Mondor
Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 [UPEC UP12]
Heming, Nicholas [Auteur]
Infection et inflammation [2I]
Hôpital Raymond Poincaré (Garches) [GHU AP-HP Université Paris-Saclay]
Gault, Elyanne [Auteur]
Infection et inflammation [2I]
Hôpital Ambroise Paré [AP-HP]
Pham, Tài [Auteur]
Centre de recherche en épidémiologie et santé des populations [CESP]
Hôpital Bicêtre [AP-HP, Le Kremlin-Bicêtre]
Groupe de recherche clinique CARMAS (Cardiovascular and Respiratory Manifestations of Acute lung injury and Sepsis) [CARMAS]
Chaghouri, Amal [Auteur]
Hôpital Paul Brousse
de Montmollin, Nina [Auteur]
Département des maladies respiratoires [CHU Cochin]
Centre de Recherche Saint-Antoine [CRSA]
CHU Tenon [AP-HP]
Voiriot, Guillaume [Auteur]
CHU Tenon [AP-HP]
Morand-Joubert, Laurence [Auteur]
Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique [iPLESP]
CHU Saint-Antoine [AP-HP]
Joseph, Adrien [Auteur]
Centre de Recherche des Cordeliers [CRC (UMR_S_1138 / U1138)]
Hopital Saint-Louis [AP-HP] [AP-HP]
Chaix, Marie-Laure [Auteur]
Génomes, biologie cellulaire et thérapeutiques [GenCellDis (U944 / UMR7212)]
Laboratoire de Virologie [CHU Saint-Louis]
Immunologie humaine, physiopathologie & immunothérapie [HIPI (UMR_S_976 / U976)]
Préau, Sébastien [Auteur]
Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167 [RID-AGE]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Favory, Raphaël [Auteur]
Hôpital Roger Salengro [Lille]
Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167 [RID-AGE]
Guigon, Aurélie [Auteur]
Service de Virologie [Lille]
Luyt, Charles-Edouard [Auteur]
CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
Unité de Recherche sur les Maladies Cardiovasculaires, du Métabolisme et de la Nutrition = Research Unit on Cardiovascular and Metabolic Diseases [ICAN]
Burrel, Sonia [Auteur]
Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique [iPLESP]
CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
Mayaux, Julien [Auteur]
CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
Marot, Stéphane [Auteur]
Institut Pierre Louis d'Epidémiologie et de Santé Publique [iPLESP]
CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
Roux, Damien [Auteur]
CHU Saint-Antoine [AP-HP]
Institut Necker Enfants-Malades [INEM - UM 111 (UMR 8253 / U1151)]
Descamps, Diane [Auteur]
Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution [IAME (UMR_S_1137 / U1137)]
AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris]
Meireles, Sylvie [Auteur]
Hôpital Ambroise Paré [AP-HP]
Pène, Frédéric [Auteur]
Hôpital Cochin [AP-HP]
Rozenberg, Flore [Auteur]
Service de Virologie [CHU Cochin]
Contou, Damien [Auteur]
Centre Hospitalier Victor Dupouy
Henry, Amandine [Auteur]
Centre de Référence des Maladies Auto-Inflammatoires et des Amyloses [CH Versailles] [CeRéMAIA - Hôpital André Mignot]
Centre Hospitalier Victor Dupouy
Gaudry, Stéphane [Auteur]
Hôpital Avicenne [AP-HP]
Brichler, Ségolène [Auteur]
Hôpital Avicenne [AP-HP]
Timsit, Jean-François [Auteur]
AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard [Paris]
Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution [IAME (UMR_S_1137 / U1137)]
Kimmoun, Antoine [Auteur]
Défaillance Cardiovasculaire Aiguë et Chronique [DCAC]
Cardiovascular and Renal Clinical Trialists [Vandoeuvre-les-Nancy] [INI-CRCT]
Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy [CHRU Nancy]
Hartard, Cédric [Auteur]
Laboratoire de Chimie Physique et Microbiologie pour les Matériaux et l'Environnement [LCPME]
Service de Virologie [CHRU Nancy]
Jandeaux, Louise-Marie [Auteur]
Nanomédecine Régénérative [NanoRegMed]
Centre de Recherche en Biomédecine de Strasbourg [CRBS]
Fédération de Médecine Translationnelle de Strasbourg [FMTS]
Service de Médecine Intensive et Réanimation [Strasbourg]
Fafi-Kremer, Samira [Auteur]
Immuno-Rhumatologie Moléculaire [IRM]
Nouvel Hôpital Civil de Strasbourg
Gabarre, Paul [Auteur]
CHU Saint-Antoine [AP-HP]
Emery, Malo [Auteur]
Hôpital Saint-Camille [Bry-sur-Marne]
Garcia-Sanchez, Claudio [Auteur]
Hôpital Saint-Camille [Bry-sur-Marne]
Jochmans, Sébastien [Auteur]
Centre Hospitalier de Melun [CHM]
Pitsch, Aurélia [Auteur]
Centre Hospitalier de Melun [CHM]
Annane, Djillali [Auteur]
Service de réanimation medico-chirurgicale [CHU Raymond-Poincaré]
Azoulay, Elie [Auteur]
Hopital Saint-Louis [AP-HP] [AP-HP]
Mekontso Dessap, Armand [Auteur]
Hôpital Henri Mondor
Groupe de recherche clinique CARMAS (Cardiovascular and Respiratory Manifestations of Acute lung injury and Sepsis) [CARMAS]
Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 [UPEC UP12]
Rodriguez, Christophe [Auteur]
Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 [UPEC UP12]
Hôpital Henri Mondor
IMRB - VHC/"Viruses-Hepatology-Cancers" [Créteil] [U955 Inserm - UPEC]
Pawlotsky, Jean-Michel [Auteur]
Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 [UPEC UP12]
Hôpital Henri Mondor
IMRB - VHC/"Viruses-Hepatology-Cancers" [Créteil] [U955 Inserm - UPEC]
Fourati, Slim [Auteur]
Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 [UPEC UP12]
Hôpital Henri Mondor
IMRB - VHC/"Viruses-Hepatology-Cancers" [Créteil] [U955 Inserm - UPEC]

Journal title :

Nature Communications

Pages :

6025

Publisher :

Nature Publishing Group

Publication date :

2022-10-12

ISSN :

2041-1723

HAL domain(s) :

Sciences du Vivant [q-bio]

English abstract : [en]

Infection with SARS-CoV-2 variant Omicron is considered to be less severe than infection with variant Delta, with rarer occurrence of severe disease requiring intensive care. Little information is available on comorbid ...
Show more >Infection with SARS-CoV-2 variant Omicron is considered to be less severe than infection with variant Delta, with rarer occurrence of severe disease requiring intensive care. Little information is available on comorbid factors, clinical conditions and specific viral mutational patterns associated with the severity of variant Omicron infection. In this multicenter prospective cohort study, patients consecutively admitted for severe COVID-19 in 20 intensive care units in France between December 7th 2021 and May 1st 2022 were included. Among 259 patients, we show that the clinical phenotype of patients infected with variant Omicron (n = 148) is different from that in those infected with variant Delta (n = 111). We observe no significant relationship between Delta and Omicron variant lineages/sublineages and 28-day mortality (adjusted odds ratio [95% confidence interval] = 0.68 [0.35-1.32]; p = 0.253). Among Omicroninfected patients, 43.2% are immunocompromised, most of whom have received two doses of vaccine or more (85.9%) but display a poor humoral response to vaccination. The mortality rate of immunocompromised patients infected with variant Omicron is significantly higher than that of nonimmunocompromised patients (46.9% vs 26.2%; p = 0.009). In patients infected with variant Omicron, there is no association between specific sublineages (BA.1/BA.1.1 (n = 109) and BA.2 (n = 21)) or any viral genome polymorphisms/ mutational profile and 28-day mortality.Show less >

Language :

Anglais

Peer reviewed article :

Oui

Audience :

Internationale

Popular science :

Non

Collections :

• Facteurs de risque et déterminants moléculaires des maladies liées au vieillissement (RID-AGE) - U1167

Source :

Harvested from HAL