Whole Exome/Genome Sequencing Joint Analysis ...
Type de document :
Compte-rendu et recension critique d'ouvrage
DOI :
PMID :
Titre :
Whole Exome/Genome Sequencing Joint Analysis of a Family with Oligogenic Familial Hypercholesterolemia
Auteur(s) :
Ghaleb, Youmna [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Université Saint-Joseph de Beyrouth [USJ]
Elbitar, Sandy [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Université Saint-Joseph de Beyrouth [USJ]
Philippi, Anne [Auteur]
Institut Cochin [IC UM3 (UMR 8104 / U1016)]
El Khoury, Petra [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Université Saint-Joseph de Beyrouth [USJ]
Azar, Yara [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Université Saint-Joseph de Beyrouth [USJ]
Andrianirina, Miangaly [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Loste, Alexia [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Abou-Khalil, Yara [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Université Saint-Joseph de Beyrouth [USJ]
Nicolas, Gaël [Auteur]
Centre de recherche sur l'Inflammation [CRI (UMR_S_1149 / ERL_8252 / U1149)]
Le Borgne, Marie [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Moulin, Philippe [Auteur]
Hôpital Louis Pradel [CHU - HCL]
Cardiovasculaire, métabolisme, diabétologie et nutrition [CarMeN]
Di-Filippo, Mathilde [Auteur]
Cardiovasculaire, métabolisme, diabétologie et nutrition [CarMeN]
Hospices Civils de Lyon [HCL]
Charrière, Sybil [Auteur]
Hôpital Louis Pradel [CHU - HCL]
Cardiovasculaire, métabolisme, diabétologie et nutrition [CarMeN]
Farnier, Michel [Auteur]
Physiopathologie et épidémiologie cérébro-cardiovasculaire [Dijon] [PEC2]
Yelnick, Cécile [Auteur]
Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167 [RID-AGE]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Carreau, Valérie [Auteur]
Institut de Cardiométabolisme et Nutrition = Institute of Cardiometabolism and Nutrition [CHU Pitié Salpêtrière] [IHU ICAN]
CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
Ferrières, Jean [Auteur]
Centre d'Epidémiologie et de Recherche en santé des POPulations [CERPOP]
Service Cardiologie [CHU Toulouse]
Lecerf, Jean-Michel [Auteur]
Institut Pasteur de Lille
Derksen, Alexa [Auteur]
McGill University Health Center [Montreal] [MUHC]
Institut de Recherches Cliniques de Montréal [IRCM]
McGill University = Université McGill [Montréal, Canada]
Bernard, Geneviève [Auteur]
McGill University Health Center [Montreal] [MUHC]
McGill University = Université McGill [Montréal, Canada]
Gauthier, Marie-Soleil [Auteur]
Institut de Recherches Cliniques de Montréal [IRCM]
Coulombe, Benoit [Auteur]
Institut de Recherches Cliniques de Montréal [IRCM]
Université de Montréal [UdeM]
Lütjohann, Dieter [Auteur]
University Hospital Bonn
Fin, Bertrand [Auteur]
Centre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
Boland, Anne [Auteur]
Centre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
Olaso, Robert [Auteur]
Centre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
Deleuze, Jean-François [Auteur]
Centre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
Centre d'Etude du Polymorphisme Humain [CEPH]
Rabès, Jean-Pierre [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Hôpital Ambroise Paré [AP-HP]
Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines - UFR Sciences de la santé Simone Veil [UVSQ Santé]
Boileau, Catherine [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Hôpital Ambroise Paré [AP-HP]
Abifadel, Marianne [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Université Saint-Joseph de Beyrouth [USJ]
Varret, Mathilde [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Université Saint-Joseph de Beyrouth [USJ]
Elbitar, Sandy [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Université Saint-Joseph de Beyrouth [USJ]
Philippi, Anne [Auteur]
Institut Cochin [IC UM3 (UMR 8104 / U1016)]
El Khoury, Petra [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Université Saint-Joseph de Beyrouth [USJ]
Azar, Yara [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Université Saint-Joseph de Beyrouth [USJ]
Andrianirina, Miangaly [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Loste, Alexia [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Abou-Khalil, Yara [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Université Saint-Joseph de Beyrouth [USJ]
Nicolas, Gaël [Auteur]
Centre de recherche sur l'Inflammation [CRI (UMR_S_1149 / ERL_8252 / U1149)]
Le Borgne, Marie [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Moulin, Philippe [Auteur]
Hôpital Louis Pradel [CHU - HCL]
Cardiovasculaire, métabolisme, diabétologie et nutrition [CarMeN]
Di-Filippo, Mathilde [Auteur]
Cardiovasculaire, métabolisme, diabétologie et nutrition [CarMeN]
Hospices Civils de Lyon [HCL]
Charrière, Sybil [Auteur]
Hôpital Louis Pradel [CHU - HCL]
Cardiovasculaire, métabolisme, diabétologie et nutrition [CarMeN]
Farnier, Michel [Auteur]
Physiopathologie et épidémiologie cérébro-cardiovasculaire [Dijon] [PEC2]
Yelnick, Cécile [Auteur]
Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167 [RID-AGE]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Carreau, Valérie [Auteur]
Institut de Cardiométabolisme et Nutrition = Institute of Cardiometabolism and Nutrition [CHU Pitié Salpêtrière] [IHU ICAN]
CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP]
Ferrières, Jean [Auteur]
Centre d'Epidémiologie et de Recherche en santé des POPulations [CERPOP]
Service Cardiologie [CHU Toulouse]
Lecerf, Jean-Michel [Auteur]
Institut Pasteur de Lille
Derksen, Alexa [Auteur]
McGill University Health Center [Montreal] [MUHC]
Institut de Recherches Cliniques de Montréal [IRCM]
McGill University = Université McGill [Montréal, Canada]
Bernard, Geneviève [Auteur]
McGill University Health Center [Montreal] [MUHC]
McGill University = Université McGill [Montréal, Canada]
Gauthier, Marie-Soleil [Auteur]
Institut de Recherches Cliniques de Montréal [IRCM]
Coulombe, Benoit [Auteur]
Institut de Recherches Cliniques de Montréal [IRCM]
Université de Montréal [UdeM]
Lütjohann, Dieter [Auteur]
University Hospital Bonn
Fin, Bertrand [Auteur]
Centre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
Boland, Anne [Auteur]
Centre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
Olaso, Robert [Auteur]
Centre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
Deleuze, Jean-François [Auteur]
Centre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
Centre d'Etude du Polymorphisme Humain [CEPH]
Rabès, Jean-Pierre [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Hôpital Ambroise Paré [AP-HP]
Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines - UFR Sciences de la santé Simone Veil [UVSQ Santé]
Boileau, Catherine [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Hôpital Ambroise Paré [AP-HP]
Abifadel, Marianne [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Université Saint-Joseph de Beyrouth [USJ]
Varret, Mathilde [Auteur]
Laboratoire de Recherche Vasculaire Translationnelle [LVTS (UMR_S_1148 / U1148)]
Titre de la revue :
Metabolites
Pagination :
262
Éditeur :
MDPI
Date de publication :
2022
ISSN :
2218-1989
Mot(s)-clé(s) en anglais :
autosomal dominant hypercholesterolemia
CYP7A1
LDL uptake
LDLRAP1
linkage analysis
LRP6
next-generation sequencing
oligogenic hypercholesterolemia
polygenic risk score
protein structural models
CYP7A1
LDL uptake
LDLRAP1
linkage analysis
LRP6
next-generation sequencing
oligogenic hypercholesterolemia
polygenic risk score
protein structural models
Discipline(s) HAL :
Sciences du Vivant [q-bio]
Sciences du Vivant [q-bio]/Santé publique et épidémiologie
Sciences du Vivant [q-bio]/Santé publique et épidémiologie
Résumé en anglais : [en]
Autosomal Dominant Hypercholesterolemia (ADH) is a genetic disorder caused by pathogenic variants in LDLR, APOB, PCSK9 and APOE genes. We sought to identify new candidate genes responsible for the ADH phenotype in patients ...
Lire la suite >Autosomal Dominant Hypercholesterolemia (ADH) is a genetic disorder caused by pathogenic variants in LDLR, APOB, PCSK9 and APOE genes. We sought to identify new candidate genes responsible for the ADH phenotype in patients without pathogenic variants in the known ADH-causing genes by focusing on a French family with affected and non-affected members who presented a high ADH polygenic risk score (wPRS). Linkage analysis, whole exome and whole genome sequencing resulted in the identification of variants p.(Pro398Ala) in CYP7A1, p.(Val1382Phe) in LRP6 and p.(Ser202His) in LDLRAP1. A total of 6 other variants were identified in 6 of 160 unrelated ADH probands: p.(Ala13Val) and p.(Aps347Asn) in CYP7A1; p.(Tyr972Cys), p.(Thr1479Ile) and p.(Ser1612Phe) in LRP6; and p.(Ser202LeufsTer19) in LDLRAP1. All six probands presented a moderate wPRS. Serum analyses of carriers of the p.(Pro398Ala) variant in CYP7A1 showed no differences in the synthesis of bile acids compared to the serums of non-carriers. Functional studies of the four LRP6 mutants in HEK293T cells resulted in contradictory results excluding a major effect of each variant alone. Within the family, none of the heterozygous for only the LDLRAP1 p.(Ser202His) variant presented ADH. Altogether, each variant individually does not result in elevated LDL-C; however, the oligogenic combination of two or three variants reveals the ADH phenotype.Lire moins >
Lire la suite >Autosomal Dominant Hypercholesterolemia (ADH) is a genetic disorder caused by pathogenic variants in LDLR, APOB, PCSK9 and APOE genes. We sought to identify new candidate genes responsible for the ADH phenotype in patients without pathogenic variants in the known ADH-causing genes by focusing on a French family with affected and non-affected members who presented a high ADH polygenic risk score (wPRS). Linkage analysis, whole exome and whole genome sequencing resulted in the identification of variants p.(Pro398Ala) in CYP7A1, p.(Val1382Phe) in LRP6 and p.(Ser202His) in LDLRAP1. A total of 6 other variants were identified in 6 of 160 unrelated ADH probands: p.(Ala13Val) and p.(Aps347Asn) in CYP7A1; p.(Tyr972Cys), p.(Thr1479Ile) and p.(Ser1612Phe) in LRP6; and p.(Ser202LeufsTer19) in LDLRAP1. All six probands presented a moderate wPRS. Serum analyses of carriers of the p.(Pro398Ala) variant in CYP7A1 showed no differences in the synthesis of bile acids compared to the serums of non-carriers. Functional studies of the four LRP6 mutants in HEK293T cells resulted in contradictory results excluding a major effect of each variant alone. Within the family, none of the heterozygous for only the LDLRAP1 p.(Ser202His) variant presented ADH. Altogether, each variant individually does not result in elevated LDL-C; however, the oligogenic combination of two or three variants reveals the ADH phenotype.Lire moins >
Langue :
Anglais
Vulgarisation :
Non
Projet ANR :
Collections :
Source :
Fichiers
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