Searching for alternate RNA structures in ...
Type de document :
Communication dans un congrès avec actes
DOI :
Titre :
Searching for alternate RNA structures in genomic sequences
Auteur(s) :
Saffarian, Azadeh [Auteur]
Bioinformatics and Sequence Analysis [BONSAI]
Laboratoire d'Informatique Fondamentale de Lille [LIFL]
Giraud, Mathieu [Auteur]
Laboratoire d'Informatique Fondamentale de Lille [LIFL]
Touzet, Helene [Auteur]
Bioinformatics and Sequence Analysis [BONSAI]
Laboratoire d'Informatique Fondamentale de Lille [LIFL]
Bioinformatics and Sequence Analysis [BONSAI]
Laboratoire d'Informatique Fondamentale de Lille [LIFL]
Giraud, Mathieu [Auteur]

Laboratoire d'Informatique Fondamentale de Lille [LIFL]
Touzet, Helene [Auteur]

Bioinformatics and Sequence Analysis [BONSAI]
Laboratoire d'Informatique Fondamentale de Lille [LIFL]
Titre de la manifestation scientifique :
Computational Methods for Structural RNAs, CMSR'14
Ville :
Strasbourg
Pays :
France
Date de début de la manifestation scientifique :
2014-09-07
Titre de la revue :
1st workshop on Computational Methods for Structural RNAs
Date de publication :
2014
Discipline(s) HAL :
Informatique [cs]/Bio-informatique [q-bio.QM]
Résumé en anglais : [en]
We introduce the concept of RNA multi-structures, that is a formal grammar based framework specifically designed to model a set of alternate RNA secondary structures. Such alternate structures can either be a set of ...
Lire la suite >We introduce the concept of RNA multi-structures, that is a formal grammar based framework specifically designed to model a set of alternate RNA secondary structures. Such alternate structures can either be a set of suboptimal foldings, or distinct stable folding states, or variants within an RNA family. We provide several such examples and propose an efficient algorithm to search for RNA multi-structures within a genomic sequence.Lire moins >
Lire la suite >We introduce the concept of RNA multi-structures, that is a formal grammar based framework specifically designed to model a set of alternate RNA secondary structures. Such alternate structures can either be a set of suboptimal foldings, or distinct stable folding states, or variants within an RNA family. We provide several such examples and propose an efficient algorithm to search for RNA multi-structures within a genomic sequence.Lire moins >
Langue :
Anglais
Comité de lecture :
Oui
Audience :
Internationale
Vulgarisation :
Non
Collections :
Source :
Fichiers
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