Ingénierie métabolique pour la production ...
Document type :
Habilitation à diriger des recherches
Permalink :
Title :
Ingénierie métabolique pour la production sélective d’isoformes de lipopeptides bactériens bioactifs
English title :
Metabolic engineering for the selective production of isoforms of bioactive bacterial lipopeptides
Author(s) :
Thesis director(s) :
Dhulster, Pascal
Defence date :
2019-12-13
Jury president :
Jacques, Philippe
Accredited body :
Université de Lille
Doctoral school :
Sciences de la Matière, du Rayonnement et de l’Environnement (SMRE)
Keyword(s) :
Lipopeptides -- Synthèse -- Relations structure-activité
Toxicité
Purification
Bacillus subtilis -- Métabolisme
Microorganismes -- Métabolites
Peptides non ribosomiques
Biomolécules actives
Biocontrôle
Toxicité
Purification
Bacillus subtilis -- Métabolisme
Microorganismes -- Métabolites
Peptides non ribosomiques
Biomolécules actives
Biocontrôle
English keyword(s) :
Lipopeptides -- Synthesis -- Structure-activity relationships
Toxicity
Purification
Bacillus subtilis -- Metabolism
Microorganisms -- Metabolites
Non-ribosomal peptides
Active biomolecules
Biocontrol
Toxicity
Purification
Bacillus subtilis -- Metabolism
Microorganisms -- Metabolites
Non-ribosomal peptides
Active biomolecules
Biocontrol
French abstract :
Dans la situation mondiale actuelle d’accroissement de la population et de diminution des ressources fossiles, la santé, l’environnement et une alimentation plus saine sont devenus des enjeux prioritaires. Par conséquent, ...
Show more >Dans la situation mondiale actuelle d’accroissement de la population et de diminution des ressources fossiles, la santé, l’environnement et une alimentation plus saine sont devenus des enjeux prioritaires. Par conséquent, de nombreux défis se posent pour répondre aux questions de durabilité environnementale et économique, et plus particulièrement sur la nécessité de produire plus de nourriture et d’énergie biosourcée, tout en préservant l’environnement et la biodiversité. Dans ce contexte, l’élimination des intrants chimiques représente la problématique et le défi pour les deux décennies à venir. Ceci est renforcé par la volonté des populations et des pouvoirs publics qui incitent les industriels à trouver rapidement des solutions biosourcées. C’est pour répondre à ces enjeux que j’ai développé depuis dix ans des travaux de recherche sur les métabolites secondaires d’origine microbienne et plus particulièrement sur les lipopeptides produits par Bacillus et Pseudomonas. Ces métabolites au travers de leurs nombreuses activités, leur faible toxicité et leur grande biodégradabilité représentent des candidats de choix pour remplacer les molécules de synthèse et répondre aux demandes des marchés. Les activités et le projet de recherche qui sont développés dans ce manuscrit portent sur différentes approches pour (i) identifier de nouveaux lipopeptides et de nouvelles souches productrices ; (ii) établir une méthodologie permettant d’évaluer leurs activités et leur toxicité en relation avec leur structure; (iii) optimiser leur production grâce à l’utilisation de stratégies moléculaires innovantes ; (iv) orienter par ingénierie métabolique le métabolisme de la cellule vers la production des isoformes présentant le meilleur équilibre dans le triptyque productivité-efficacité-toxicité. Ce projet de recherche se veut pluridisciplinaire et collaboratif au sein de la nouvelle structuration de l’UMRT Terra-Viollette mais également en pérennisant les collaborations établies avec d’autres universités et centres de recherche, ainsi qu’avec le secteur industriel.Show less >
Show more >Dans la situation mondiale actuelle d’accroissement de la population et de diminution des ressources fossiles, la santé, l’environnement et une alimentation plus saine sont devenus des enjeux prioritaires. Par conséquent, de nombreux défis se posent pour répondre aux questions de durabilité environnementale et économique, et plus particulièrement sur la nécessité de produire plus de nourriture et d’énergie biosourcée, tout en préservant l’environnement et la biodiversité. Dans ce contexte, l’élimination des intrants chimiques représente la problématique et le défi pour les deux décennies à venir. Ceci est renforcé par la volonté des populations et des pouvoirs publics qui incitent les industriels à trouver rapidement des solutions biosourcées. C’est pour répondre à ces enjeux que j’ai développé depuis dix ans des travaux de recherche sur les métabolites secondaires d’origine microbienne et plus particulièrement sur les lipopeptides produits par Bacillus et Pseudomonas. Ces métabolites au travers de leurs nombreuses activités, leur faible toxicité et leur grande biodégradabilité représentent des candidats de choix pour remplacer les molécules de synthèse et répondre aux demandes des marchés. Les activités et le projet de recherche qui sont développés dans ce manuscrit portent sur différentes approches pour (i) identifier de nouveaux lipopeptides et de nouvelles souches productrices ; (ii) établir une méthodologie permettant d’évaluer leurs activités et leur toxicité en relation avec leur structure; (iii) optimiser leur production grâce à l’utilisation de stratégies moléculaires innovantes ; (iv) orienter par ingénierie métabolique le métabolisme de la cellule vers la production des isoformes présentant le meilleur équilibre dans le triptyque productivité-efficacité-toxicité. Ce projet de recherche se veut pluridisciplinaire et collaboratif au sein de la nouvelle structuration de l’UMRT Terra-Viollette mais également en pérennisant les collaborations établies avec d’autres universités et centres de recherche, ainsi qu’avec le secteur industriel.Show less >
English abstract : [en]
In the current global situation of increasing population and decreasing fossil resources, the health, the environment and a healthier food have become priority issues. As a result, there are many challenges to address the ...
Show more >In the current global situation of increasing population and decreasing fossil resources, the health, the environment and a healthier food have become priority issues. As a result, there are many challenges to address the issues of environmental and economic sustainability, particularly the need to produce more food and bio-based energy, while preserving the environment and biodiversity. In this context, the elimination of chemical inputs represents the main problem and the challenge for the next two decades. This is driven by the will of the people and public authorities who pushes the industry to quickly find bio-sourced solutions. It is to answer these stakes that I have developed over the past ten years research work on microbial’s secondary metabolites and more particularly on lipopeptides produced by Bacillus and Pseudomonas. These metabolites through their numerous activities, their low toxicity and their high biodegradability represent prime candidates for replacing synthetic molecules and meeting the demand of the markets. The activities and the research project that are developed in this manuscript relate to different approaches to (i) identify new lipopeptides and new producer strains; (ii) establish a methodology to evaluate their activities and toxicity in relation to their structure; (iii) optimize their production through the use of innovative molecular strategies; (iv) direct the cell metabolism by metabolic engineering towards the production of isoforms which displays the best balance in the triptych productivity-efficacy-toxicity. This research project is multidisciplinary and collaborative within the new structure of UMRT Terra-Viollette but also by sustaining collaborations established with other universities and research centers, as well as with the industrial sector.Show less >
Show more >In the current global situation of increasing population and decreasing fossil resources, the health, the environment and a healthier food have become priority issues. As a result, there are many challenges to address the issues of environmental and economic sustainability, particularly the need to produce more food and bio-based energy, while preserving the environment and biodiversity. In this context, the elimination of chemical inputs represents the main problem and the challenge for the next two decades. This is driven by the will of the people and public authorities who pushes the industry to quickly find bio-sourced solutions. It is to answer these stakes that I have developed over the past ten years research work on microbial’s secondary metabolites and more particularly on lipopeptides produced by Bacillus and Pseudomonas. These metabolites through their numerous activities, their low toxicity and their high biodegradability represent prime candidates for replacing synthetic molecules and meeting the demand of the markets. The activities and the research project that are developed in this manuscript relate to different approaches to (i) identify new lipopeptides and new producer strains; (ii) establish a methodology to evaluate their activities and toxicity in relation to their structure; (iii) optimize their production through the use of innovative molecular strategies; (iv) direct the cell metabolism by metabolic engineering towards the production of isoforms which displays the best balance in the triptych productivity-efficacy-toxicity. This research project is multidisciplinary and collaborative within the new structure of UMRT Terra-Viollette but also by sustaining collaborations established with other universities and research centers, as well as with the industrial sector.Show less >
Language :
Anglais
Français
Français
Collections :
Submission date :
2020-12-14T17:08:33Z
Files
- HDR_Coutte_François.pdf
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