MuscleJ: a high-content analysis method ...
Document type :
Article dans une revue scientifique: Article original
PMID :
Title :
MuscleJ: a high-content analysis method to study skeletal muscle with a new Fiji tool
Author(s) :
Mayeuf-Louchart, Alicia [Auteur]
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Hardy, David [Auteur]
Neuropathologie expérimentale - Experimental neuropathology
Institut Pasteur [Paris] [IP]
Thorel, Quentin [Auteur]
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Roux, Pascal [Auteur]
BioImagerie Photonique – Photonic BioImaging [UTechS PBI]
Gueniot, Lorna [Auteur]
Neuropathologie expérimentale - Experimental neuropathology
Institut Pasteur [Paris] [IP]
Briand, David [Auteur]
Neuropathologie expérimentale - Experimental neuropathology
Institut Pasteur [Paris] [IP]
Mazeraud, Aurélien [Auteur]
Neuropathologie expérimentale - Experimental neuropathology
Institut Pasteur [Paris] [IP]
Bouglé, Adrien [Auteur]
Neuropathologie expérimentale - Experimental neuropathology
Shorte, Spencer [Auteur]
BioImagerie Photonique – Photonic BioImaging [UTechS PBI]
Staels, Bart [Auteur]
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Chretien, Fabrice [Auteur]
Neuropathologie expérimentale - Experimental neuropathology
Institut Pasteur [Paris] [IP]
Duez, Helene [Auteur]
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Danckaert, Anne [Auteur]
BioImagerie Photonique – Photonic BioImaging [UTechS PBI]
Neuropathologie expérimentale - Experimental neuropathology
Institut Pasteur [Paris] [IP]
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Hardy, David [Auteur]
Neuropathologie expérimentale - Experimental neuropathology
Institut Pasteur [Paris] [IP]
Thorel, Quentin [Auteur]
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Roux, Pascal [Auteur]
BioImagerie Photonique – Photonic BioImaging [UTechS PBI]
Gueniot, Lorna [Auteur]
Neuropathologie expérimentale - Experimental neuropathology
Institut Pasteur [Paris] [IP]
Briand, David [Auteur]
Neuropathologie expérimentale - Experimental neuropathology
Institut Pasteur [Paris] [IP]
Mazeraud, Aurélien [Auteur]
Neuropathologie expérimentale - Experimental neuropathology
Institut Pasteur [Paris] [IP]
Bouglé, Adrien [Auteur]
Neuropathologie expérimentale - Experimental neuropathology
Shorte, Spencer [Auteur]
BioImagerie Photonique – Photonic BioImaging [UTechS PBI]
Staels, Bart [Auteur]
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Chretien, Fabrice [Auteur]
Neuropathologie expérimentale - Experimental neuropathology
Institut Pasteur [Paris] [IP]
Duez, Helene [Auteur]
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Danckaert, Anne [Auteur]
BioImagerie Photonique – Photonic BioImaging [UTechS PBI]
Neuropathologie expérimentale - Experimental neuropathology
Institut Pasteur [Paris] [IP]
Journal title :
Skeletal Muscle
Pages :
25
Publisher :
BioMed Central
Publication date :
2018-08-06
ISSN :
2044-5040
English keyword(s) :
Fiber typing
Histology
Image automated quantification
In situ cartography
Stem cells
Skeletal muscle fiber
Vessels
Satellite cells
Histology
Image automated quantification
In situ cartography
Stem cells
Skeletal muscle fiber
Vessels
Satellite cells
HAL domain(s) :
Sciences du Vivant [q-bio]/Médecine humaine et pathologie/Anatomie, Histologie, Anatomopathologie [q-bio.TO]
English abstract : [en]
Skeletal muscle has the capacity to adapt to environmental changes and regenerate upon injury. To study these processes, most experimental methods use quantification of parameters obtained from images of immunostained ...
Show more >Skeletal muscle has the capacity to adapt to environmental changes and regenerate upon injury. To study these processes, most experimental methods use quantification of parameters obtained from images of immunostained skeletal muscle. Muscle cross-sectional area, fiber typing, localization of nuclei within the muscle fiber, the number of vessels, and fiber-associated stem cells are used to assess muscle physiology. Manual quantification of these parameters is time consuming and only poorly reproducible. While current state-of-the-art software tools are unable to analyze all these parameters simultaneously, we have developed MuscleJ, a new bioinformatics tool to do so.Show less >
Show more >Skeletal muscle has the capacity to adapt to environmental changes and regenerate upon injury. To study these processes, most experimental methods use quantification of parameters obtained from images of immunostained skeletal muscle. Muscle cross-sectional area, fiber typing, localization of nuclei within the muscle fiber, the number of vessels, and fiber-associated stem cells are used to assess muscle physiology. Manual quantification of these parameters is time consuming and only poorly reproducible. While current state-of-the-art software tools are unable to analyze all these parameters simultaneously, we have developed MuscleJ, a new bioinformatics tool to do so.Show less >
Language :
Anglais
Peer reviewed article :
Oui
Audience :
Internationale
Popular science :
Non
Source :
Files
- https://hal-pasteur.archives-ouvertes.fr/pasteur-01926223/document
- Open access
- Access the document
- https://skeletalmusclejournal.biomedcentral.com/track/pdf/10.1186/s13395-018-0171-0
- Open access
- Access the document
- https://hal-pasteur.archives-ouvertes.fr/pasteur-01926223/document
- Open access
- Access the document
- document
- Open access
- Access the document
- Mayeuf-Louchart-BMC_Sketetal-muscle_2018.pdf
- Open access
- Access the document
- s13395-018-0171-0
- Open access
- Access the document
- document
- Open access
- Access the document
- Mayeuf-Louchart-BMC_Sketetal-muscle_2018.pdf
- Open access
- Access the document
- document
- Open access
- Access the document
- Mayeuf-Louchart-BMC_Sketetal-muscle_2018.pdf
- Open access
- Access the document