Title :

MuscleJ: a high-content analysis method to study skeletal muscle with a new Fiji tool

Author(s) :

Mayeuf-Louchart, Alicia [Auteur]
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Hardy, David [Auteur]
Institut Pasteur [Paris] [IP]
Neuropathologie expérimentale - Experimental neuropathology
Thorel, Quentin [Auteur]
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Roux, Pascal [Auteur]
BioImagerie Photonique – Photonic BioImaging [UTechS PBI]
Gueniot, Lorna [Auteur]
Institut Pasteur [Paris] [IP]
Neuropathologie expérimentale - Experimental neuropathology
Briand, David [Auteur]
Institut Pasteur [Paris] [IP]
Neuropathologie expérimentale - Experimental neuropathology
Mazeraud, Aurélien [Auteur]
Institut Pasteur [Paris] [IP]
Neuropathologie expérimentale - Experimental neuropathology
Bouglé, Adrien [Auteur]
Neuropathologie expérimentale - Experimental neuropathology
Shorte, Spencer [Auteur]
BioImagerie Photonique – Photonic BioImaging [UTechS PBI]
Staels, Bart [Auteur]
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Chretien, Fabrice [Auteur]
Institut Pasteur [Paris] [IP]
Neuropathologie expérimentale - Experimental neuropathology
Duez, Helene [Auteur]
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Danckaert, Anne [Auteur]
Institut Pasteur [Paris] [IP]
Neuropathologie expérimentale - Experimental neuropathology
BioImagerie Photonique – Photonic BioImaging [UTechS PBI]

Journal title :

Skeletal Muscle

Pages :

25

Publisher :

BioMed Central

Publication date :

2018-08-06

ISSN :

2044-5040

English keyword(s) :

Fiber typing
Histology
Image automated quantification
In situ cartography
Stem cells
Skeletal muscle fiber
Vessels
Satellite cells

HAL domain(s) :

Sciences du Vivant [q-bio]/Médecine humaine et pathologie/Anatomie, Histologie, Anatomopathologie [q-bio.TO]

English abstract : [en]

Skeletal muscle has the capacity to adapt to environmental changes and regenerate upon injury. To study these processes, most experimental methods use quantification of parameters obtained from images of immunostained ...
Show more >Skeletal muscle has the capacity to adapt to environmental changes and regenerate upon injury. To study these processes, most experimental methods use quantification of parameters obtained from images of immunostained skeletal muscle. Muscle cross-sectional area, fiber typing, localization of nuclei within the muscle fiber, the number of vessels, and fiber-associated stem cells are used to assess muscle physiology. Manual quantification of these parameters is time consuming and only poorly reproducible. While current state-of-the-art software tools are unable to analyze all these parameters simultaneously, we have developed MuscleJ, a new bioinformatics tool to do so.Show less >

Language :

Anglais

Peer reviewed article :

Oui

Audience :

Internationale

Popular science :

Non

ANR Project :

EGID Diabetes Pole
Développment d'une infrastructure française distribuée coordonnée

Collections :

• Récepteurs nucléaires, Maladies Cardiovasculaires et Diabète (EGID) - U1011

Source :

Harvested from HAL