Titre :

MuscleJ: a high-content analysis method to study skeletal muscle with a new Fiji tool

Auteur(s) :

Mayeuf-Louchart, Alicia [Auteur]
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Hardy, David [Auteur]
Neuropathologie expérimentale - Experimental neuropathology
Institut Pasteur [Paris] [IP]
Thorel, Quentin [Auteur]
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Roux, Pascal [Auteur]
BioImagerie Photonique – Photonic BioImaging [UTechS PBI]
Gueniot, Lorna [Auteur]
Neuropathologie expérimentale - Experimental neuropathology
Institut Pasteur [Paris] [IP]
Briand, David [Auteur]
Neuropathologie expérimentale - Experimental neuropathology
Institut Pasteur [Paris] [IP]
Mazeraud, Aurélien [Auteur]
Neuropathologie expérimentale - Experimental neuropathology
Institut Pasteur [Paris] [IP]
Bouglé, Adrien [Auteur]
Neuropathologie expérimentale - Experimental neuropathology
Shorte, Spencer [Auteur]
BioImagerie Photonique – Photonic BioImaging [UTechS PBI]
Staels, Bart [Auteur]
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Chretien, Fabrice [Auteur]
Neuropathologie expérimentale - Experimental neuropathology
Institut Pasteur [Paris] [IP]
Duez, Helene [Auteur]
Récepteurs nucléaires, maladies cardiovasculaires et diabète - U 1011 [RNMCD]
Danckaert, Anne [Auteur]
BioImagerie Photonique – Photonic BioImaging [UTechS PBI]
Neuropathologie expérimentale - Experimental neuropathology
Institut Pasteur [Paris] [IP]

Titre de la revue :

Skeletal Muscle

Pagination :

25

Éditeur :

BioMed Central

Date de publication :

2018-08-06

ISSN :

2044-5040

Mot(s)-clé(s) en anglais :

Fiber typing
Histology
Image automated quantification
In situ cartography
Stem cells
Skeletal muscle fiber
Vessels
Satellite cells

Discipline(s) HAL :

Sciences du Vivant [q-bio]/Médecine humaine et pathologie/Anatomie, Histologie, Anatomopathologie [q-bio.TO]

Résumé en anglais : [en]

Skeletal muscle has the capacity to adapt to environmental changes and regenerate upon injury. To study these processes, most experimental methods use quantification of parameters obtained from images of immunostained ...
Lire la suite >Skeletal muscle has the capacity to adapt to environmental changes and regenerate upon injury. To study these processes, most experimental methods use quantification of parameters obtained from images of immunostained skeletal muscle. Muscle cross-sectional area, fiber typing, localization of nuclei within the muscle fiber, the number of vessels, and fiber-associated stem cells are used to assess muscle physiology. Manual quantification of these parameters is time consuming and only poorly reproducible. While current state-of-the-art software tools are unable to analyze all these parameters simultaneously, we have developed MuscleJ, a new bioinformatics tool to do so.Lire moins >

Langue :

Anglais

Comité de lecture :

Oui

Audience :

Internationale

Vulgarisation :

Non

Projet ANR :

EGID Diabetes Pole
Développment d'une infrastructure française distribuée coordonnée

Collections :

• Récepteurs nucléaires, Maladies Cardiovasculaires et Diabète (RNMCD) - U1011

Source :

Harvested from HAL