NMR spectroscopy of the main protease of ...
Document type :
Compte-rendu et recension critique d'ouvrage
DOI :
PMID :
Title :
NMR spectroscopy of the main protease of SARS‐CoV‐2 and fragment‐based screening identify three protein hotspots and an antiviral fragment
Author(s) :
Cantrelle, François-Xavier [Auteur]
Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167 [RID-AGE]
Biologie Structurale Intégrative [ERL 9002 - INSERM U1167 - BSI]
Boll, Emmanuelle [Auteur]
Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167 [RID-AGE]
Biologie Structurale Intégrative [ERL 9002 - INSERM U1167 - BSI]
Brier, Lucile [Auteur]
Médicaments et molécules pour les systèmes vivants - U 1177 [M2SV]
Moschidi, Danai [Auteur]
Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167 [RID-AGE]
Biologie Structurale Intégrative [ERL 9002 - INSERM U1167 - BSI]
Belouzard, Sandrine [Auteur]
Centre d’Infection et d’Immunité de Lille - INSERM U 1019 - UMR 9017 - UMR 8204 [CIIL]
Landry, Valérie [Auteur]
Médicaments et molécules pour les systèmes vivants - U 1177 [M2SV]
Leroux, Florence [Auteur]
Médicaments et molécules pour les systèmes vivants - U 1177 [M2SV]
Dewitte, Frédérique [Auteur]
Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167 [RID-AGE]
Biologie Structurale Intégrative [ERL 9002 - INSERM U1167 - BSI]
Landrieu, Isabelle [Auteur]
Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167 [RID-AGE]
Biologie Structurale Intégrative [ERL 9002 - INSERM U1167 - BSI]
Dubuisson, Jean [Auteur]
Centre d’Infection et d’Immunité de Lille - INSERM U 1019 - UMR 9017 - UMR 8204 [CIIL]
Deprez, Benoit [Auteur]
Médicaments et molécules pour les systèmes vivants - U 1177 [M2SV]
Charton, Julie [Auteur]
Médicaments et molécules pour les systèmes vivants - U 1177 [M2SV]
Hanoulle, Xavier [Auteur]
Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167 [RID-AGE]
Biologie Structurale Intégrative [ERL 9002 - INSERM U1167 - BSI]
Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167 [RID-AGE]
Biologie Structurale Intégrative [ERL 9002 - INSERM U1167 - BSI]
Boll, Emmanuelle [Auteur]
Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167 [RID-AGE]
Biologie Structurale Intégrative [ERL 9002 - INSERM U1167 - BSI]
Brier, Lucile [Auteur]
Médicaments et molécules pour les systèmes vivants - U 1177 [M2SV]
Moschidi, Danai [Auteur]
Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167 [RID-AGE]
Biologie Structurale Intégrative [ERL 9002 - INSERM U1167 - BSI]
Belouzard, Sandrine [Auteur]
Centre d’Infection et d’Immunité de Lille - INSERM U 1019 - UMR 9017 - UMR 8204 [CIIL]
Landry, Valérie [Auteur]
Médicaments et molécules pour les systèmes vivants - U 1177 [M2SV]
Leroux, Florence [Auteur]
Médicaments et molécules pour les systèmes vivants - U 1177 [M2SV]
Dewitte, Frédérique [Auteur]
Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167 [RID-AGE]
Biologie Structurale Intégrative [ERL 9002 - INSERM U1167 - BSI]
Landrieu, Isabelle [Auteur]
Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167 [RID-AGE]
Biologie Structurale Intégrative [ERL 9002 - INSERM U1167 - BSI]
Dubuisson, Jean [Auteur]
Centre d’Infection et d’Immunité de Lille - INSERM U 1019 - UMR 9017 - UMR 8204 [CIIL]
Deprez, Benoit [Auteur]
Médicaments et molécules pour les systèmes vivants - U 1177 [M2SV]
Charton, Julie [Auteur]
Médicaments et molécules pour les systèmes vivants - U 1177 [M2SV]
Hanoulle, Xavier [Auteur]
Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167 [RID-AGE]
Biologie Structurale Intégrative [ERL 9002 - INSERM U1167 - BSI]
Journal title :
Angewandte Chemie International Edition
Pages :
25428-25435
Publisher :
Wiley-VCH Verlag
Publication date :
2021-09-27
ISSN :
1433-7851
HAL domain(s) :
Sciences du Vivant [q-bio]/Biochimie, Biologie Moléculaire/Biologie structurale [q-bio.BM]
Chimie/Chimie thérapeutique
Sciences du Vivant [q-bio]/Microbiologie et Parasitologie/Virologie
Chimie/Chimie thérapeutique
Sciences du Vivant [q-bio]/Microbiologie et Parasitologie/Virologie
English abstract : [en]
The main protease (3CLp) of the SARS-CoV-2, the causative agent for the COVID-19 pandemic, is one of the main targets for drug development. To be active, 3CLp relies on a complex interplay between dimerization, active site ...
Show more >The main protease (3CLp) of the SARS-CoV-2, the causative agent for the COVID-19 pandemic, is one of the main targets for drug development. To be active, 3CLp relies on a complex interplay between dimerization, active site flexibility, and allosteric regulation. The deciphering of these mechanisms is a crucial step to enable the search for inhibitors. In this context, using NMR spectroscopy, we studied the conformation of dimeric 3CLp from the SARS-CoV-2 and monitored ligand binding, based on NMR signal assignments. We performed a fragment-based screening that led to the identification of 38 fragment hits. Their binding sites showed three hotspots on 3CLp, two in the substrate binding pocket and one at the dimer interface. F01 is a non-covalent inhibitor of the 3CLp and has antiviral activity in SARS-CoV-2 infected cells. This study sheds light on the complex structure-function relationships of 3CLp, and constitutes a strong basis to assist in developing potent 3CLp inhibitors.Show less >
Show more >The main protease (3CLp) of the SARS-CoV-2, the causative agent for the COVID-19 pandemic, is one of the main targets for drug development. To be active, 3CLp relies on a complex interplay between dimerization, active site flexibility, and allosteric regulation. The deciphering of these mechanisms is a crucial step to enable the search for inhibitors. In this context, using NMR spectroscopy, we studied the conformation of dimeric 3CLp from the SARS-CoV-2 and monitored ligand binding, based on NMR signal assignments. We performed a fragment-based screening that led to the identification of 38 fragment hits. Their binding sites showed three hotspots on 3CLp, two in the substrate binding pocket and one at the dimer interface. F01 is a non-covalent inhibitor of the 3CLp and has antiviral activity in SARS-CoV-2 infected cells. This study sheds light on the complex structure-function relationships of 3CLp, and constitutes a strong basis to assist in developing potent 3CLp inhibitors.Show less >
Language :
Anglais
Popular science :
Non
Source :
Files
- https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03363607/document
- Open access
- Access the document
- https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03363607/file/Accepted-Version_anie.202109965.pdf
- Open access
- Access the document
- https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03363607/file/Submitted_SI_Hanoulle_sh.pdf
- Open access
- Access the document
- https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03363607/document
- Open access
- Access the document
- https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03363607/file/Accepted-Version_anie.202109965.pdf
- Open access
- Access the document
- https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03363607/document
- Open access
- Access the document
- https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03363607/document
- Open access
- Access the document
- document
- Open access
- Access the document
- Accepted-Version_anie.202109965.pdf
- Open access
- Access the document
- Submitted_SI_Hanoulle_sh.pdf
- Open access
- Access the document