Title :

Origin and Global Expansion of Mycobacterium tuberculosis Complex Lineage 3

Author(s) :

Shuaib, Yassir [Auteur]
Utpatel, Christian [Auteur]
Kohl, Thomas [Auteur]
Barilar, Ivan [Auteur]
Diricks, Margo [Auteur]
Ashraf, Nadia [Auteur]
Wieler, Lothar [Auteur]
Kerubo, Glennah [Auteur]
Mesfin, Eyob [Auteur]
Diallo, Awa Ba [Auteur]
Al-Hajoj, Sahal [Auteur]
Ndung’u, Perpetua [Auteur]
Fitzgibbon, Margaret [Auteur]
Vaziri, Farzam [Auteur]
Sintchenko, Vitali [Auteur]
Martinez, Elena [Auteur]
Viegas, Sofia [Auteur]
Zhou, Yang [Auteur]
Azmy, Aya [Auteur]
Al-Amry, Khaled [Auteur]
Godreuil, Sylvain [Auteur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] [CHRU Montpellier]
Institut de Recherche pour le Développement (IRD en Occitanie) [IRD (Occitanie)]
Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle [MIVEGEC]
Varma-Basil, Mandira [Auteur]
Narang, Anshika [Auteur]
Ali, Solomon [Auteur]
Beckert, Patrick [Auteur]
Dreyer, Viola [Auteur]
Kabwe, Mwila [Auteur]
Bates, Matthew [Auteur]
Hoelscher, Michael [Auteur]
Rachow, Andrea [Auteur]
Gori, Andrea [Auteur]
Tekwu, Emmanuel [Auteur]
Sidze, Larissa [Auteur]
Jean-Paul, Assam [Auteur]
Beng, Veronique [Auteur]
Ntoumi, Francine [Auteur]
Frank, Matthias [Auteur]
Diallo, Aissatou Gaye [Auteur]
Mboup, Souleymane [Auteur]
Tessema, Belay [Auteur]
Beyene, Dereje [Auteur]
Khan, Sadiq [Auteur]
Diel, Roland [Auteur]
Supply, Philip [Auteur]
Centre d’Infection et d’Immunité de Lille - INSERM U 1019 - UMR 9017 - UMR 8204 [CIIL]
Maurer, Florian [Auteur]
Hoffmann, Harald [Auteur]
Niemann, Stefan [Auteur]
Merker, Matthias [Auteur]

Journal title :

Genes

Pages :

990

Publisher :

MDPI

Publication date :

2022-05-31

ISSN :

2073-4425

English keyword(s) :

Mycobacterium tuberculosis
MTBC
Lineage 3
Back to Africa

HAL domain(s) :

Sciences du Vivant [q-bio]/Microbiologie et Parasitologie/Bactériologie
Sciences du Vivant [q-bio]/Génétique/Génétique des populations [q-bio.PE]

English abstract : [en]

Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC) Lineage 3 (L3) strains are abundant in world regions with the highest tuberculosis burden. To investigate the population structure and the global diversity of this major lineage, ...
Show more >Mycobacterium tuberculosis complex (MTBC) Lineage 3 (L3) strains are abundant in world regions with the highest tuberculosis burden. To investigate the population structure and the global diversity of this major lineage, we analyzed a dataset comprising 2682 L3 strains from 38 countries over 5 continents, by employing 24-loci mycobacterial interspersed repetitive unit-variable number of tandem repeats genotyping (MIRU-VNTR) and drug susceptibility testing. We further combined whole-genome sequencing (WGS) and phylogeographic analysis for 373 strains representing the global L3 genetic diversity. Ancestral state reconstruction confirmed that the origin of L3 strains is located in Southern Asia and further revealed multiple independent introduction events into North-East and East Africa. This study provides a systematic understanding of the global diversity of L3 strains and reports phylogenetic variations that could inform clinical trials which evaluate the effectivity of new drugs/regimens or vaccine candidates.Show less >

Language :

Anglais

Peer reviewed article :

Oui

Audience :

Internationale

Popular science :

Non

Collections :

• Centre d'Infection et d'Immunité de Lille (CIIL) - U1019 - UMR 9017

Source :

Harvested from HAL