An extended transcription factor regulatory ...
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Article dans une revue scientifique: Article original
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Title :
An extended transcription factor regulatory network controls hepatocyte identity
Author(s) :
Dubois-Chevalier, Julie [Auteur]
Gheeraert, Celine [Auteur]
Récepteurs nucléaires, Maladies Cardiovasculaires et Diabète (RNMCD) - U1011
Berthier, Alexandre [Auteur]
Récepteurs nucléaires, Maladies Cardiovasculaires et Diabète (RNMCD) - U1011
Boulet, Clemence [Auteur]
Récepteurs nucléaires, Maladies Cardiovasculaires et Diabète (RNMCD) - U1011
Dubois, Vanessa [Auteur]
Universiteit Gent = Ghent University = Université de Gand [UGENT]
Récepteurs Nucléaires, Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires - U 1011 [RNMCD]
Guille, Loic [Auteur]
Récepteurs nucléaires, Maladies Cardiovasculaires et Diabète (RNMCD) - U1011
Fourcot, Marie [Auteur]
METRICS : Evaluation des technologies de santé et des pratiques médicales - ULR 2694
Marot, Guillemette [Auteur]
METRICS : Evaluation des technologies de santé et des pratiques médicales - ULR 2694
MOdel for Data Analysis and Learning [MODAL]
Gauthier, Karine [Auteur]
Dubuquoy, Laurent [Auteur]
Institute for Translational Research in Inflammation - U 1286 [INFINITE]
Staels, Bart [Auteur]
Récepteurs nucléaires, Maladies Cardiovasculaires et Diabète (RNMCD) - U1011
Lefebvre, Philippe [Auteur]
Récepteurs nucléaires, Maladies Cardiovasculaires et Diabète (RNMCD) - U1011
Eeckhoute, Jerome [Auteur]
Récepteurs nucléaires, Maladies Cardiovasculaires et Diabète (RNMCD) - U1011
Gheeraert, Celine [Auteur]
Récepteurs nucléaires, Maladies Cardiovasculaires et Diabète (RNMCD) - U1011
Berthier, Alexandre [Auteur]
Récepteurs nucléaires, Maladies Cardiovasculaires et Diabète (RNMCD) - U1011
Boulet, Clemence [Auteur]
Récepteurs nucléaires, Maladies Cardiovasculaires et Diabète (RNMCD) - U1011
Dubois, Vanessa [Auteur]
Universiteit Gent = Ghent University = Université de Gand [UGENT]
Récepteurs Nucléaires, Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires - U 1011 [RNMCD]
Guille, Loic [Auteur]
Récepteurs nucléaires, Maladies Cardiovasculaires et Diabète (RNMCD) - U1011
Fourcot, Marie [Auteur]
METRICS : Evaluation des technologies de santé et des pratiques médicales - ULR 2694
Marot, Guillemette [Auteur]
METRICS : Evaluation des technologies de santé et des pratiques médicales - ULR 2694
MOdel for Data Analysis and Learning [MODAL]
Gauthier, Karine [Auteur]
Dubuquoy, Laurent [Auteur]
Institute for Translational Research in Inflammation - U 1286 [INFINITE]
Staels, Bart [Auteur]
Récepteurs nucléaires, Maladies Cardiovasculaires et Diabète (RNMCD) - U1011
Lefebvre, Philippe [Auteur]
Récepteurs nucléaires, Maladies Cardiovasculaires et Diabète (RNMCD) - U1011
Eeckhoute, Jerome [Auteur]
Récepteurs nucléaires, Maladies Cardiovasculaires et Diabète (RNMCD) - U1011
Journal title :
EMBO Reports
Abbreviated title :
EMBO Reports
Volume number :
24
Publisher :
Springer Science and Business Media LLC
Publication date :
2023-07-10
HAL domain(s) :
Sciences du Vivant [q-bio]
English abstract : [en]
AbstractCell identity is specified by a core transcriptional regulatory circuitry (CoRC), typically limited to a small set of interconnected cell‐specific transcription factors (TFs). By mining global hepatic TF regulons, ...
Show more >AbstractCell identity is specified by a core transcriptional regulatory circuitry (CoRC), typically limited to a small set of interconnected cell‐specific transcription factors (TFs). By mining global hepatic TF regulons, we reveal a more complex organization of the transcriptional regulatory network controlling hepatocyte identity. We show that tight functional interconnections controlling hepatocyte identity extend to non‐cell‐specific TFs beyond the CoRC, which we call hepatocyte identity (Hep‐ID)CONNECT TFs. Besides controlling identity effector genes, Hep‐IDCONNECT TFs also engage in reciprocal transcriptional regulation with TFs of the CoRC. In homeostatic basal conditions, this translates into Hep‐IDCONNECT TFs being involved in fine tuning CoRC TF expression including their rhythmic expression patterns. Moreover, a role for Hep‐IDCONNECT TFs in the control of hepatocyte identity is revealed in dedifferentiated hepatocytes where Hep‐IDCONNECT TFs are able to reset CoRC TF expression. This is observed upon activation of NR1H3 or THRB in hepatocarcinoma or in hepatocytes subjected to inflammation‐induced loss of identity. Our study establishes that hepatocyte identity is controlled by an extended array of TFs beyond the CoRC.Show less >
Show more >AbstractCell identity is specified by a core transcriptional regulatory circuitry (CoRC), typically limited to a small set of interconnected cell‐specific transcription factors (TFs). By mining global hepatic TF regulons, we reveal a more complex organization of the transcriptional regulatory network controlling hepatocyte identity. We show that tight functional interconnections controlling hepatocyte identity extend to non‐cell‐specific TFs beyond the CoRC, which we call hepatocyte identity (Hep‐ID)CONNECT TFs. Besides controlling identity effector genes, Hep‐IDCONNECT TFs also engage in reciprocal transcriptional regulation with TFs of the CoRC. In homeostatic basal conditions, this translates into Hep‐IDCONNECT TFs being involved in fine tuning CoRC TF expression including their rhythmic expression patterns. Moreover, a role for Hep‐IDCONNECT TFs in the control of hepatocyte identity is revealed in dedifferentiated hepatocytes where Hep‐IDCONNECT TFs are able to reset CoRC TF expression. This is observed upon activation of NR1H3 or THRB in hepatocarcinoma or in hepatocytes subjected to inflammation‐induced loss of identity. Our study establishes that hepatocyte identity is controlled by an extended array of TFs beyond the CoRC.Show less >
Language :
Anglais
Audience :
Internationale
Popular science :
Non
ANR Project :
Identification et caractérisation d'un nouveau facteur de transcription controlant l'activation des cellules stellaires et la fibrose hépatique
Cibler les MEcanismes cellulaires du défaut de régénération pour le développement d'une médecine de précision pour l'hépatite ALcoolique.
EGID Diabetes Pole
ULNE
Cibler les MEcanismes cellulaires du défaut de régénération pour le développement d'une médecine de précision pour l'hépatite ALcoolique.
EGID Diabetes Pole
ULNE
Other project(s) or funding source(s) :
Fondation pour la Recherche Médicale (FRM grants EQU202203014645)
Administrative institution(s) :
Université de Lille
CHU Lille
CHU Lille
Collections :
- Institut de Recherche Translationnelle sur l'Inflammation (INFINITE) - U1286
- METRICS : Evaluation des technologies de santé et des pratiques médicales - ULR 2694
- Plateformes Lilloises en Biologie et Santé (PLBS) - UAR 2014 - US 41
- Récepteurs nucléaires, Maladies Cardiovasculaires et Diabète (RNMCD) - U1011
Submission date :
2024-01-18T12:05:33Z
Files
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- Open access
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