Next-generation sequencing in a series of ...
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Article dans une revue scientifique: Article original
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Title :
Next-generation sequencing in a series of 80 fetuses with complex cardiac malformations and/or heterotaxy
Author(s) :
Liu, Hui [Auteur]
Giguet-Valard, Anna-Gaelle [Auteur]
Simonet, Thomas [Auteur]
Szenker-Ravi, Emmanuelle [Auteur]
Lambert, Laetitia [Auteur]
Vincent, Catherine [Auteur]
Maladies Rares du Développement : Génétique, Régulation et Protéomique (RADEME) - ULR 7364
Maladies RAres du DEveloppement embryonnaire et du MEtabolisme : du Phénotype au Génotype et à la Fonction - ULR 7364 [RADEME]
Scheidecker, Sophie [Auteur]
Fradin, Melanie [Auteur]
Morice-Picard, Fanny [Auteur]
Naudion, Sophie [Auteur]
Ciorna-Monferrato, Viorica [Auteur]
Colin, Estelle [Auteur]
Fellmann, Florence [Auteur]
Blesson, Sophie [Auteur]
Jouk, Pierre-Simon [Auteur]
Francannet, Christine [Auteur]
Petit, Florence [Auteur]
Moutton, Sebastien [Auteur]
Lehalle, Daphne [Auteur]
Chassaing, Nicolas [Auteur]
El Zein, Loubna [Auteur]
Bazin, Anne [Auteur]
Centre d'Etudes et de Recherches Administratives, Politiques et Sociales - UMR 8026 [CERAPS]
Centre d'Études et de Recherches Administratives, Politiques et Sociales (CERAPS) - UMR 8026
Beneteau, Claire [Auteur]
Attie-Bitach, Tania [Auteur]
Hanu, Sylvie M. [Auteur]
Brechard, Marie-Pierre [Auteur]
Chiesa, Jean [Auteur]
Pasquier, Laurent [Auteur]
Rooryck-Thambo, Caroline [Auteur]
Van Maldergem, Lionel [Auteur]
Cabrol, Christelle [Auteur]
El Chehadeh-Djebbar, Salima [Auteur]
Vasiljevic, Alexandre [Auteur]
Isidor, Bertrand [Auteur]
Abel, Carine [Auteur]
Thevenon, Julien [Auteur]
Di Filippo, Sylvie [Auteur]
Vigouroux-Castera, Adeline [Auteur]
Attia, Jocelyne [Auteur]
Quelin, Chloe [Auteur]
Odent, Sylvie [Auteur]
Piard, Juliette [Auteur]
Giuliano, Fabienne [Auteur]
Putoux, Audrey [Auteur]
Khau Van Kien, Philippe [Auteur]
Yardin, Catherine [Auteur]
Touraine, Renaud [Auteur]
Reversade, Bruno [Auteur]
Bouvagnet, Patrice [Auteur]
Giguet-Valard, Anna-Gaelle [Auteur]
Simonet, Thomas [Auteur]
Szenker-Ravi, Emmanuelle [Auteur]
Lambert, Laetitia [Auteur]
Vincent, Catherine [Auteur]
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Maladies Rares du Développement : Génétique, Régulation et Protéomique (RADEME) - ULR 7364
Maladies RAres du DEveloppement embryonnaire et du MEtabolisme : du Phénotype au Génotype et à la Fonction - ULR 7364 [RADEME]
Scheidecker, Sophie [Auteur]
Fradin, Melanie [Auteur]
Morice-Picard, Fanny [Auteur]
Naudion, Sophie [Auteur]
Ciorna-Monferrato, Viorica [Auteur]
Colin, Estelle [Auteur]
Fellmann, Florence [Auteur]
Blesson, Sophie [Auteur]
Jouk, Pierre-Simon [Auteur]
Francannet, Christine [Auteur]
Petit, Florence [Auteur]
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Moutton, Sebastien [Auteur]
Lehalle, Daphne [Auteur]
Chassaing, Nicolas [Auteur]
El Zein, Loubna [Auteur]
Bazin, Anne [Auteur]
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Centre d'Etudes et de Recherches Administratives, Politiques et Sociales - UMR 8026 [CERAPS]
Centre d'Études et de Recherches Administratives, Politiques et Sociales (CERAPS) - UMR 8026
Beneteau, Claire [Auteur]
Attie-Bitach, Tania [Auteur]
Hanu, Sylvie M. [Auteur]
Brechard, Marie-Pierre [Auteur]
Chiesa, Jean [Auteur]
Pasquier, Laurent [Auteur]
Rooryck-Thambo, Caroline [Auteur]
Van Maldergem, Lionel [Auteur]
Cabrol, Christelle [Auteur]
El Chehadeh-Djebbar, Salima [Auteur]
Vasiljevic, Alexandre [Auteur]
Isidor, Bertrand [Auteur]
Abel, Carine [Auteur]
Thevenon, Julien [Auteur]
Di Filippo, Sylvie [Auteur]
Vigouroux-Castera, Adeline [Auteur]
Attia, Jocelyne [Auteur]
Quelin, Chloe [Auteur]
Odent, Sylvie [Auteur]
Piard, Juliette [Auteur]
Giuliano, Fabienne [Auteur]
Putoux, Audrey [Auteur]
Khau Van Kien, Philippe [Auteur]
Yardin, Catherine [Auteur]
Touraine, Renaud [Auteur]
Reversade, Bruno [Auteur]
Bouvagnet, Patrice [Auteur]
Journal title :
Human mutation
Abbreviated title :
Hum Mutat
Publication date :
2020-11-01
ISSN :
1098-1004
Keyword(s) :
consanguinity
generation sequencing
next‐
midline anomaly
fetus
heterotaxy
congenital heart defects
generation sequencing
next‐
midline anomaly
fetus
heterotaxy
congenital heart defects
HAL domain(s) :
Sciences du Vivant [q-bio]
English abstract : [en]
Herein, we report the screening of a large panel of genes in a series of 80 fetuses with congenital heart defects (CHDs) and/or heterotaxy and no cytogenetic anomalies. There were 49 males (61%/39%), with a family history ...
Show more >Herein, we report the screening of a large panel of genes in a series of 80 fetuses with congenital heart defects (CHDs) and/or heterotaxy and no cytogenetic anomalies. There were 49 males (61%/39%), with a family history in 28 cases (35%) and no parental consanguinity in 77 cases (96%). All fetuses had complex CHD except one who had heterotaxy and midline anomalies while 52 cases (65%) had heterotaxy in addition to CHD. Altogether, 29 cases (36%) had extracardiac and extra-heterotaxy anomalies. A pathogenic variant was found in 10/80 (12.5%) cases with a higher percentage in the heterotaxy group (8/52 cases, 15%) compared with the non-heterotaxy group (2/28 cases, 7%), and in 3 cases with extracardiac and extra-heterotaxy anomalies (3/29, 10%). The inheritance was recessive in six genes (DNAI1, GDF1, MMP21, MYH6, NEK8, and ZIC3) and dominant in two genes (SHH and TAB2). A homozygous pathogenic variant was found in three cases including only one case with known consanguinity. In conclusion, after removing fetuses with cytogenetic anomalies, next-generation sequencing discovered a causal variant in 12.5% of fetal cases with CHD and/or heterotaxy. Genetic counseling for future pregnancies was greatly improved. Surprisingly, unexpected consanguinity accounts for 20% of cases with identified pathogenic variants.Show less >
Show more >Herein, we report the screening of a large panel of genes in a series of 80 fetuses with congenital heart defects (CHDs) and/or heterotaxy and no cytogenetic anomalies. There were 49 males (61%/39%), with a family history in 28 cases (35%) and no parental consanguinity in 77 cases (96%). All fetuses had complex CHD except one who had heterotaxy and midline anomalies while 52 cases (65%) had heterotaxy in addition to CHD. Altogether, 29 cases (36%) had extracardiac and extra-heterotaxy anomalies. A pathogenic variant was found in 10/80 (12.5%) cases with a higher percentage in the heterotaxy group (8/52 cases, 15%) compared with the non-heterotaxy group (2/28 cases, 7%), and in 3 cases with extracardiac and extra-heterotaxy anomalies (3/29, 10%). The inheritance was recessive in six genes (DNAI1, GDF1, MMP21, MYH6, NEK8, and ZIC3) and dominant in two genes (SHH and TAB2). A homozygous pathogenic variant was found in three cases including only one case with known consanguinity. In conclusion, after removing fetuses with cytogenetic anomalies, next-generation sequencing discovered a causal variant in 12.5% of fetal cases with CHD and/or heterotaxy. Genetic counseling for future pregnancies was greatly improved. Surprisingly, unexpected consanguinity accounts for 20% of cases with identified pathogenic variants.Show less >
Language :
Anglais
Audience :
Internationale
Popular science :
Non
Administrative institution(s) :
Université de Lille
Collections :
Submission date :
2021-09-02T07:02:39Z