Titre :

Contribution to Alzheimer's disease risk of rare variants in TREM_2, SORL_1, and ABCA_7 in 1779 cases and 1273 controls

Auteur(s) :

Bellenguez, Céline [Auteur]
Excellence Laboratory LabEx DISTALZ
Facteurs de Risque et Déterminants Moléculaires des Maladies liées au Vieillissement - U 1167 [RID-AGE]
Charbonnier, Camille [Auteur]
Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques [GPMCND]
Grenier-Boley, Benjamin [Auteur]
Epidémiologie des maladies chroniques : impact des interactions gène environnement sur la santé des populations
Quenez, Olivier [Auteur]
Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques [GPMCND]
Le Guennec, Kilan [Auteur]
Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques [GPMCND]
Nicolas, Gaël [Auteur]
Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques [GPMCND]
Chauhan, Ganesh [Auteur]
Prévention et prise en charge des traumatismes [Bordeaux]
Wallon, David [Auteur]
Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques [GPMCND]
Service de neurologie [Rouen]
Rousseau, Stéphane [Auteur]
Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques [GPMCND]
Richard, Anne-Claire [Auteur]
Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques [GPMCND]
Boland, Anne [Auteur]
Centre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
Centre National de Génotypage [CNG]
Bourque, Guillaume [Auteur]
McGill University and Genome Quebec Innovation Centre
Munter, Hans Markus [Auteur]
McGill University and Genome Quebec Innovation Centre
Olaso, Robert [Auteur]
Centre National de Génotypage [CNG]
Meyer, Vincent [Auteur]
Centre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
Centre National de Génotypage [CNG]
Rollin-Sillaire, Adeline [Auteur]
Troubles cognitifs dégénératifs et vasculaires - U 1171 - EA 1046 [TCDV]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] [CHRU Lille]
Pasquier, Florence [Auteur]
Département de neurologie [Lille]
Letenneur, Luc [Auteur]
Université de Bordeaux [UB]
Institut de Santé Publique, d'Épidémiologie et de Développement (ISPED)
Redon, Richard [Auteur]
ITX - unité de recherche de l'institut du thorax [ITX]
Dartigues, Jean-François [Auteur]
Epidémiologie, santé publique et développement
Tzourio, Christophe [Auteur]
Neuroépidémiologie
Frebourg, Thierry [Auteur]
Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques [GPMCND]
Lathrop, Mark [Auteur]
McGill University and Genome Quebec Innovation Centre
Deleuze, Jean-François [Auteur]
Centre National de Recherche en Génomique Humaine [CNRGH]
Centre National de Génotypage [CNG]
Hannequin, Didier [Auteur]
Service de neurologie [Rouen]
Genin, Emmanuelle [Auteur]
Génétique, génomique fonctionnelle et biotechnologies (UMR 1078) [GGB]
Amouyel, Philippe [Auteur]
Université de Lille
Debette, Stéphanie [Auteur]
Troubles cognitifs vasculaires et dégénératifs
Lambert, Jean-Charles [Auteur]
Institut Pasteur de Lille
Campion, Dominique [Auteur]
Génomique et Médecine Personnalisée du Cancer et des Maladies Neuropsychiatriques [GPMCND]
Gabelle-Deloustal, Audrey [Collaborateur]
Centre Hospitalier Régional Universitaire [Montpellier] [CHRU Montpellier]
Labauge, Pierre [Collaborateur]
Département de neurologie [Montpellier]
Godefroy, Olivier [Collaborateur]
Laboratoire de Neurosciences Fonctionnelles et Pathologies - UR UPJV 4559 [LNFP]
CHU Amiens-Picardie

Titre de la revue :

Neurobiology of Aging

Pagination :

220.e1-220.e9

Éditeur :

Elsevier

Date de publication :

2017

ISSN :

0197-4580

Mot(s)-clé(s) en anglais :

Genetic Predisposition to Disease
Alzheimer's disease
Membrane Glycoproteins
Genetic Association Studies
LDL-Receptor Related Proteins
ATP-Binding Cassette Transporters
Membrane Transport Proteins
Alzheimer Disease
Whole Genome Sequencing
Apolipoprotein E4

Discipline(s) HAL :

Sciences du Vivant [q-bio]/Neurosciences [q-bio.NC]/Neurobiologie

Résumé en anglais : [en]

We performed whole-exome and whole-genome sequencing in 927 late-onset Alzheimer disease (LOAD) cases, 852 early-onset AD (EOAD) cases, and 1273 controls from France. We assessed the evidence for gene-based association of ...
Lire la suite >We performed whole-exome and whole-genome sequencing in 927 late-onset Alzheimer disease (LOAD) cases, 852 early-onset AD (EOAD) cases, and 1273 controls from France. We assessed the evidence for gene-based association of rare variants with AD in 6 genes for which an association with such variants was previously claimed. When aggregating protein-truncating and missense-predicted damaging variants, we found exome-wide significant association between EOAD risk~and rare variants in SORL1, TREM2, and ABCA7. No exome-wide significant signal was obtained in the LOAD sample, and significance of the order of 10$^{-6}$ was observed in the whole AD group for TREM2. Our study confirms previous gene-level results for TREM2, SORL1, and ABCA7 and provides a~clearer insight into the classes of rare variants involved. Despite different effect sizes and~varying~cumulative minor allele frequencies, the rare protein-truncating and missense-predicted~damaging variants in TREM2, SORL1, and ABCA7 contribute similarly to the heritability of EOAD and explain between 1.1% and 1.5% of EOAD heritability each, compared with 9.12% for APOE $\varepsilon$4.Lire moins >

Langue :

Anglais

Comité de lecture :

Oui

Audience :

Internationale

Vulgarisation :

Non

Projet ANR :

Medical Genomics
Organisation et montée en puissance d'une Infrastructure Nationale de Génomique

Collections :

• Facteurs de risque et déterminants moléculaires des maladies liées au vieillissement (RID-AGE) - U1167

Source :

Harvested from HAL